Введение

Тип пептида

Пардаксин – это пептид, производимый камбалой Красноморской (P4, P5) и камбалой тихоокеанской павлиньей (P1, P2, P3), который используется в качестве средства для отпугивания акул. Он вызывает лизис клеток млекопитающих и бактерий, подобно мелиттину.

Синтез

В лаборатории парадаксин синтезируют с использованием автоматического пептидного синтезатора. В качестве альтернативы можно собирать и очищать секрет камбалы Красного моря.

Антибактериальный пептид

Пардаксин имеет структуру "спираль-шарнир-спираль". Эта структура часто встречается у пептидов, избирательно воздействующих на бактериальные мембраны, и у цитотоксических пептидов, вызывающих лизис клеток млекопитающих и бактерий. Механизм действия пардаксина зависит от состава мембраны. Пардаксин значительно нарушает структуру липидных бислоев, состоящих из цвиттерионных липидов, особенно из 1-пальмитоил-2-олеоил-фосфатидилхолина (POPC). Это указывает на "ковровый" механизм лизиса клеток. "Ковровый" механизм заключается в накоплении высокой плотности пептидов на поверхности целевой мембраны. Вытеснение фосфолипидов изменяет текучесть мембраны, и клеточное содержимое начинает вытекать. Обнаружено, что присутствие анионных липидов или холестерина снижает способность пептида разрушать бислои.

Лечение рака

Пардаксин ингибирует пролиферацию и индуцирует апоптоз раковых клеток человека. Его 33 аминокислотная структура содержит множество катионных и амфипатических аминокислот. Это облегчает его взаимодействие с анионными мембранами, такими как мембраны опухолевых клеток, которые по своей природе более кислые из-за кислой среды, создаваемой повышенным гликолизом. Пардаксин инициирует как каспазозависимый, так и каспазонезависимый апоптоз в клетках рака шейки матки человека. Пардаксин вызывает образование реактивных видов кислорода (ROS). Производство ROS нарушает правильное сворачивание белков и индуцирует ответ на не свернутые белки (UPR). Это вызывает стресс эндоплазматического ретикулума, который приводит к высвобождению кальция. Это, в свою очередь, приводит к увеличению концентрации кальция в митохондриях и снижению их мембранного потенциала. Меняется проницаемость пор, и происходит высвобождение цитохрома c (Cyt c). Цитохром c активирует каспазную каскад, приводящую к апоптозу. ROS также активирует JNK-путь. JNK фосфорилируется, что приводит к фосфорилированию AP-1 (транскрипционный фактор, состоящий из cFOS и Cjun). Это также приводит к активации каспаз. ROS также вызывает каспазонезависимый путь, который приводит к апоптозу. При изменении мембранного потенциала митохондрий высвобождаются также факторы, индуцирующие апоптоз (AIF). Они запускают апоптоз при попадании в ядро, не требуя участия каспаз.