Введение
Плохая структура эукариотических хромосом относится к структуре последовательностей для эукариотических хромосом. Некоторые тонкие последовательности включены в более чем один класс, поэтому перечисленная классификация не предназначена для того, чтобы быть полностью отдельной.
Структурные последовательности
Другие последовательности используются при репликации или во время интерфазы с физической структурой хромосомы. Ори, или Происхождение: Происхождение репликации. МАР: области прикрепления матрицы, где ДНК прикрепляется к ядерной матрице.
Повторяющиеся последовательности
Повторяющиеся последовательности бывают двух основных типов: уникальные последовательности, которые повторяются в одной области; и повторяющиеся последовательности, которые перемежаются по всему геному.
Спутники
Спутники - это уникальные последовательности, которые повторяются в тандеме в одной области. В зависимости от длины повторения они классифицируются как: Миниспутники: короткие повторения нуклеотидов. Микроспутники: очень короткие повторения нуклеотидов. Некоторые тринуклеотидные повторения встречаются в кодирующих областях (см. Тринуклеотидные повторения). Большинство из них находятся в некодирующих областях. Их функция неизвестна, если они имеют какую-либо конкретную функцию. Они используются в качестве молекулярных маркеров и в ДНК отпечатков пальцев.
Minisatellite: Short repeats of nucleotides. Microsatellite: Very short repeats of nucleotides. Some trinucleotide repeats are found in coding regions (see, Trinucleotide repeat disorder). Most are found in noncoding regions. Their function is unknown, if they have any specific function. They are used as molecular markers and in DNA fingerprinting.
Перемежаемые последовательности
Перемежаемые последовательности - это несоседствующие повторения, в которых последовательности обнаруживаются в разных местах генома. Их можно классифицировать на основе длины повторения как: SINE: короткие перемежающиеся последовательности. Повторения обычно составляют несколько сотен пар оснований. Эти последовательности составляют около 13% генома человека, а специфическая последовательность Алю составляет около 10%. Длинные перемежающиеся последовательности. Повторения обычно имеют длину в несколько тысяч пар оснований. Эти последовательности составляют около 21% человеческого генома. Оба типа классифицируются как ретротранспозоны.
SINE: Short interspersed sequences. The repeats are normally a few hundred base pairs in length. These sequences constitute about 13% of the human genome with the specific Alu sequence accounting for about 10%. LINE: Long interspersed sequences. The repeats are normally several thousand base pairs in length. These sequences constitute about 21% of the human genome. Both of these types are classified as retrotransposons.
Ретротранспозоны
Ретротранспозоны - это последовательности в ДНК, которые являются результатом ретротранспозиции РНК. LINEs и SINEs являются примерами, где последовательности повторяются, но есть не повторяющиеся последовательности, которые также могут быть ретротранспозонами.
Другие последовательности
Типичные эукариотические хромосомы содержат намного больше ДНК, чем классифицируется в вышеуказанных категориях. ДНК может быть использована в качестве интервала или иметь другую пока неизвестную функцию. Или, они могут быть просто случайными последовательностями без последствий.