Ретропозиция және геномдағы қайталама ДНК элементтері
Retroposon
Ретропозондар – РНҚ-дан түзілген ДНК фрагменттері. Өздігінен көшуге қабілетсіз, ретротранспозондардан өзгеше. Геномның құрылымын зерттеуге көмектеседі.
Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.
Мазмұны
Кіріспе
Ретропозондар – кез келген РНК молекуласынан кері транскрипцияланған соң хромосомаларға енгізілетін қайталанатын ДНҚ фрагменттері.
Retroposons are repetitive DNA fragments which are inserted into chromosomes after they had been reverse transcribed from any RNA molecule.
Ретропозон мен ретротранспозонның айырмашылығы
Ретротранспозоннан өзгеше, ретропозон ешқашан кері транскриптазаны (RT) кодтамайды (бірақ төменде қараңыз). Сондықтан, олар транспозиция белсенділігі тұрғысынан автономды емес элементтер (транспозондардан айырмашылығы). Адамның LINE1 элементтері сияқты ұзын терминалдық қайталамалары жоқ (LTR) ретротранспозонды кейде ретропозон деп жаңылыстырады. Дегенмен, бұл авторға байланысты. Мысалы, Говард Темин былай деп анықтаған: Ретропозондар RT-ны кодтайды, бірақ ұзын терминалдық қайталамаларынан (LTR) құрылмайды, мысалы, ұзын араласқан элементтер (LINE). Ретротранспозондар LTR-лерді және ретровирустарды да қамтиды, сонымен қатар олар вирустық бөлшектер (вириондар) түрінде жиналады. Ретротізбектер – RT-сы жоқ автономды емес элементтер. Олар LINE сияқты автономды элементтердің механизмдері арқылы ретропозицияланады; мысалдарға қысқа араласқан ядролық элементтер (SINE) немесе мРНҚ-дан туындаған ретро(псевдо)гендер жатады.
In contrast to retrotransposons, retroposons never encode reverse transcriptase (RT) (but see below). Therefore, they are non autonomous elements with regard to transposition activity (as opposed to transposons). Non long terminal repeat (LTR) retrotransposons such as the human LINE1 elements are sometimes falsely referred to as retroposons. However, this depends on the author. For example, Howard Temin published the following definition: Retroposons encode RT but are devoid of long terminal repeats (LTRs), for example long interspersed elements (LINEs). Retrotransposons also feature LTRs and retroviruses, in addition, are packaged as viral particles (virions). Retrosequences are non autonomous elements devoid of RT. They are retroposed with the aid of the machinery of autonomous elements, such as LINEs; examples are short interspersed nuclear elements (SINEs) or mRNA derived retro(pseudo)genes.
Гендердің қайталануы
Ретропозиция адам геномында шамамен 10 000 гендік дупликация оқиғасын қамтиды, олардың шамамен 2-10% функционалды болуы мүмкін. Мұндай гендер ретрогендер деп аталады және ретропозонның бір түрін құрайды.
Retroposition accounts for approximately 10,000 gene duplication events in the human genome, of which approximately 2 10% are likely to be functional. Such genes are called retrogenes and represent a certain type of retroposon.
Генологиялық трансфер
Классикалық оқиға – c Src генінің біріктірілген (spliced) пре-mRNA молекуласының Rous саркома вирусының (RSV) провирустық түпкі атасына ретропозициялануы. Ретропозицияланған c src пре-mRNA әлі де бір интрон сақтайды және RSV ішінде қазір v Src гені деп аталады.
A classical event is the retroposition of a spliced pre mRNA molecule of the c Src gene into the proviral ancestor of the Rous sarcoma virus (RSV). The retroposed c src pre mRNA still contained a single intron and within RSV is now referred to as v Src gene.