Введение
Генетически модифицированная хромосома, полученная из ДНК дрожжей
Хромосомы, полученные из ДНК дрожжей
Chromosomes derived from yeast DNA
Искусственные хромосомы дрожжей (YAC) – это генетически модифицированные хромосомы, полученные из ДНК дрожжей *Saccharomyces cerevisiae*, которые затем лигируются в бактериальную плазмиду. Встраивая крупные фрагменты ДНК размером от 100 до 1000 кб, вставленные последовательности можно клонировать и физически картировать с помощью метода, называемого хромосомным обходом. Этот метод первоначально использовался в проекте «Геном человека», однако из-за проблем со стабильностью YAC были заменены на бактериальные искусственные хромосомы.
Пекарские дрожжи *S. cerevisiae* являются одним из важнейших экспериментальных организмов для изучения молекулярной генетики эукариот. Начиная с первоначальных исследований Ранкина и др., Струла и др. и Хсайо и др., изначально хрупкая хромосома была стабилизирована благодаря обнаружению необходимой автономно реплицирующейся последовательности (ARS); усовершенствованный YAC, использующий эти данные, был описан в 1983 году Мюрреем и др. Основными компонентами YAC являются ARS, центромера и теломеры из *S. cerevisiae*. Кроме того, для отбора трансформированных клеток дрожжей используются гены селективных маркеров, такие как устойчивость к антибиотикам и визуальный маркер. Без этих последовательностей хромосома не будет стабильной во время внеклеточной репликации и не будет отличаться от колоний без вектора.
Полная хромосома III
Хромосома III – третья по величине хромосома в S. cerevisiae; ее размер был оценен в 300–360 кб на основе исследований электрофореза в импульсном полевом геле. Эта хромосома интенсивно изучалась, в частности, потому что она содержит три генетических локуса, участвующих в контроле типа спаривания: MAT, HML и HMR. В марте 2014 года Джеф Боке из Медицинского центра Лангоне при Нью-Йоркском университете опубликовал результаты, согласно которым его команда синтезировала одну из 16 хромосом дрожжей S. cerevisiae – хромосому III, которую он назвал synIII. Процедура заключалась в замене генов в исходной хромосоме на синтетические аналоги, а затем готовая синтезированная хромосома была интегрирована в клетку дрожжей. Для этого потребовалось спроектировать и создать 273 871 пару оснований ДНК, что меньше, чем 316 667 пар в исходной хромосоме.
This chromosome has been the subject of intensive study, not least because it contains the three genetic loci involved in mating type control: MAT, HML and HMR. In March 2014, Jef Boeke of the Langone Medical Centre at New York University, published that his team has synthesized one of the S. cerevisiae 16 yeast chromosomes, the chromosome III, that he named synIII. The procedure involved replacing the genes in the original chromosome with synthetic versions and the finished synthesized chromosome was then integrated into a yeast cell. It required designing and creating 273,871 base pairs of DNA fewer than the 316,667 pairs in the original chromosome.