Кіріспе
Бактериялық түрлер тобы. Колиформды бактериялар – қозғалмалы немесе қозғалмайтын, грам-теріс, спора түзбайтын, β-галактозидаза ферментіне ие бациллалар, олар 35–37 °C оңтайлы өсу температурасында қышқылдар мен газдарды өндіреді. Олар аэробты немесе факультативті аэробты болуы мүмкін және тағам, сүт және судың санитарлық сапасының төмендігін көрсететін жиі қолданылатын индикатор болып табылады. Колиформдар су ортасында, топырақта және өсімдіктерде кездеседі; олар жылы қанды жануарлардың нәжісінде көп мөлшерде таралған, себебі олар асқазан-ішек жүйесінде мекендейді. Citrobacter – ұзындығы 0,6–6 мкм аралығындағы перитрихті, факультативті анаэробты бациллалар. Citrobacter түрлері ішек флорасында зиянсыз тіршілік етеді, бірақ мүмкіндік туған жағдайда несеп жолдарының инфекциясына, бактериемияға, ми абсцесіне, пневмонияға, іш қуысының сепсисіне, менингитке және буын инфекцияларына алып келуі мүмкін. Үлгіде Enterobacter-дің болуын анықтау үшін оларды алдымен MacConkey агарында өсіріп, лактозаны ыдырату қабілетін растайды. Олар факультативті анаэробтар, күрделі қышқыл полисахаридтерден тұратын капсуласы бар, бұл оларға бірнеше ай бойы кептіруге төтеп беруге мүмкіндік береді. Көмірсуларға бай ортада Klebsiella колониялары шырышты сыртқы қабаты бар, сұрғылт ақ түсті болып көрінеді. Escherichia түрлері әдетте адам және басқа жылы қанды жануарлардың ішегінде тіршілік етеді және адамдарда ауру тудыруға ең көп жауапты. Көптеген E. coli штаммдары қозғалмалы және олардың көптеген вируленттілік қасиеттерін горизонтальді гендер алмасу арқылы алған. Колиформды бактериялардың әртүрлі түрлерін ажыратудың оңай жолы – эозин метилен көк агар тақтасын пайдалану. Бұл тақта грам-оң бактерияларға ішінара тежеуші болып табылады және лактозаны ыдырату қабілетіне байланысты грам-теріс бактериялық колонияларында түс өзгерісін тудырады. Бұл жағдайлар 2021 жылдың 15 қазанынан 27 қазанына дейін тіркелген, ал Миннесота Ауыл шаруашылығы департаменті мен FDA тергеу жүргізді. Олар 2021 жылдың желтоқсаны мен 2022 жылдың қаңтары аралығында хабарланды, ал Канаданың Халық денсаулығы агенттігі (PHAC), Канаданың тағамдық инспекция агенттігі (CFIA) және Health Canada организмнің көзі болып табылатын Original Kimchi брендінің нақты атауын анықтады. Бета-D-глюкуронидазаның амплификациясы E. coli бактериясын анықтау үшін, ал олардың вертоксин гендерінің амплификациясы вертоксин өндіретін E. coli бактериясын анықтау үшін қолданылады.
Coliform bacteria are defined as either motile or non motile Gram negative non spore forming bacilli that possess β galactosidase to produce acids and gases under their optimal growth temperature of 35–37 °C. They can be aerobes or facultative aerobes, and are a commonly used indicator of low sanitary quality of foods, milk, and water. Coliforms can be found in the aquatic environment, in soil and on vegetation; they are universally present in large numbers in the feces of warm blooded animals as they are known to inhabit the gastrointestinal system. Citrobacter are peritrichous facultative anaerobic bacilli between 0.6–6 μm in length. Citrobacter species inhabit intestinal flora without causing harm, but can lead to urinary tract infections, bacteremia, brain abscesses, pneumonia, intra abdominal sepsis, meningitis, and joint infections if they are given the opportunity. To determine the presence of Enterobacter in a sample, they are first grown on MacConkey agar to confirm they are lactose fermenting. They are facultative anaerobes with a capsule composed of complex acid polysaccharides that allows them to withstand drying for several months. On carbohydrate rich media, Klebsiella colonies appear greyish white in colour with a mucosal outer surface. Escherichia species normally inhabit the human intestine and those of other warm blooded animals, and are the most commonly responsible for causing disease in humans. Most E. coli strains are motile and have obtained many of their virulence features from horizontal gene transfer. An easy way to differentiate between different types of coliform bacteria is by using an eosin methylene blue agar plate. This plate is partially inhibitory to Gram (+) bacteria, and will produce a color change in the Gram ( ) bacterial colonies based on lactose fermentation abilities. These cases were reported from October 15, 2021 through October 27, 2021 and an investigation was carried out by the Minnesota Department of Agriculture and FDA. These were reported between December 2021 and January 2022, and the Public Health Agency of Canada (PHAC), the Canadian Food Inspection Agency (CFIA), and Health Canada were able to determine a specific brand of Original Kimchi to be the source of the organism. The amplification of the beta D glucuronidase is used to detect E. coli, or the amplification of their verotoxin gene(s) to detect verotoxin producing E. coli.
Химилюминесценттік ин-ситу гибридтеу
Enterobacteriaceae тұқымдасындағы 16S рРНҚ-ның нақты аймақтары олигонуклеотидтік зондтармен байланысады, бұл ауыз судың сапасын бақылауға көмектеседі.
Қызғылт қызыл сары агар
Қатты орта лактозаны ферменттейтін колиформды өсіру үшін қолданылады және нейтралды қызыл pH индикаторы пайдаланылады. Лактоза ферменттелгенде қызғылт колониялар пайда болады және олардың айналасында тұнған өт қалдығы болады. Бұл колониялардың колиформ екенін растау үшін, олар жарқыраған жасыл лактозалы өт ортасына (BGLB) ауыстырылып, инкубацияланады. Инкубациядан кейін газ байқалса, сынамада колиформ болғаны расталады.
Мембраналық сүзгі әдісі
Сынамалар стандартты сүзгі қағаз арқылы сүзгіленіп, содан кейін M endo немесе LES Endo Agar орталарына егіледі. 22–24 сағат инкубациядан кейін колониялар жасыл металдық жылтырмен қызғылт-қызыл түспен көрінеді. Бұл колониялар лаурил триптоза (LST) ортасына егіліп, газ бөліп шығарса және содан кейін BGLB ортасына егілсе колиформды екені расталады. Егер BGLB түтіктерінде газ пайда болса, тест колиформ бактерияларының бар екенін көрсетеді.