Кишечные бактерии: характеристики и обнаружение колиформных бактерий.

Введение

Группа видов бактерий

Колиформные бактерии определяются как подвижные или неподвижные грамотрицательные не спорообразующие бациллы, обладающие β-галактозидазой для производства кислот и газов при оптимальной температуре роста 35–37 °C. Они могут быть аэробами или факультативными аэробами и обычно используются в качестве индикатора низкого санитарного качества пищевых продуктов, молока и воды. Колиформы можно обнаружить в водной среде, в почве и на растительности; они повсеместно присутствуют в больших количествах в фекалиях теплокровных животных, поскольку известны как обитатели желудочно-кишечного тракта. Citrobacter – перитрихозные факультативные анаэробные бациллы длиной 0,6–6 мкм. Виды Citrobacter обитают в кишечной флоре, не причиняя вреда, но могут приводить к инфекциям мочевыводящих путей, бактериемии, абсцессам головного мозга, пневмонии, внутрибрюшному сепсису, менингиту и инфекциям суставов при наличии благоприятных условий. Для определения наличия Enterobacter в образце их сначала выращивают на агаре МакКонки, чтобы подтвердить их способность к ферментации лактозы. Это факультативные анаэробы с капсулой, состоящей из сложных кислотных полисахаридов, позволяющей им выдерживать высыхание в течение нескольких месяцев. На средах, богатых углеводами, колонии Klebsiella выглядят серовато-белыми с муциновой внешней поверхностью. Виды Escherichia обычно обитают в кишечнике человека и других теплокровных животных и являются наиболее частой причиной заболеваний у людей. Большинство штаммов E. coli подвижны и приобрели многие свои вирулентные свойства в результате горизонтального переноса генов. Простой способ дифференцировать различные типы колиформных бактерий – использование чашки Петри с эозиново-метиленовым синим агаром. Эта чашка Петри частично ингибирует рост грамположительных бактерий и вызывает изменение цвета в колониях грамотрицательных бактерий в зависимости от их способности ферментировать лактозу. Эти случаи были зарегистрированы в период с 15 октября 2021 года по 27 октября 2021 года, и расследование было проведено Министерством сельского хозяйства штата Миннесота и FDA. Они были зарегистрированы в период с декабря 2021 года по январь 2022 года, и Агентство общественного здравоохранения Канады (PHAC), Канадское агентство по контролю за продуктами питания (CFIA) и Health Canada смогли установить, что источником возбудителя является конкретная марка Original Kimchi. Амплификация бета-D-глюкуронидазы используется для обнаружения E. coli, а амплификация гена веротоксина – для обнаружения веротоксинпродуцирующих E. coli.

Coliform bacteria are defined as either motile or non motile Gram negative non spore forming bacilli that possess β galactosidase to produce acids and gases under their optimal growth temperature of 35–37 °C. They can be aerobes or facultative aerobes, and are a commonly used indicator of low sanitary quality of foods, milk, and water. Coliforms can be found in the aquatic environment, in soil and on vegetation; they are universally present in large numbers in the feces of warm blooded animals as they are known to inhabit the gastrointestinal system. Citrobacter are peritrichous facultative anaerobic bacilli between 0.6–6 μm in length. Citrobacter species inhabit intestinal flora without causing harm, but can lead to urinary tract infections, bacteremia, brain abscesses, pneumonia, intra abdominal sepsis, meningitis, and joint infections if they are given the opportunity. To determine the presence of Enterobacter in a sample, they are first grown on MacConkey agar to confirm they are lactose fermenting. They are facultative anaerobes with a capsule composed of complex acid polysaccharides that allows them to withstand drying for several months. On carbohydrate rich media, Klebsiella colonies appear greyish white in colour with a mucosal outer surface. Escherichia species normally inhabit the human intestine and those of other warm blooded animals, and are the most commonly responsible for causing disease in humans. Most E. coli strains are motile and have obtained many of their virulence features from horizontal gene transfer. An easy way to differentiate between different types of coliform bacteria is by using an eosin methylene blue agar plate. This plate is partially inhibitory to Gram (+) bacteria, and will produce a color change in the Gram ( ) bacterial colonies based on lactose fermentation abilities. These cases were reported from October 15, 2021 through October 27, 2021 and an investigation was carried out by the Minnesota Department of Agriculture and FDA. These were reported between December 2021 and January 2022, and the Public Health Agency of Canada (PHAC), the Canadian Food Inspection Agency (CFIA), and Health Canada were able to determine a specific brand of Original Kimchi to be the source of the organism. The amplification of the beta D glucuronidase is used to detect E. coli, or the amplification of their verotoxin gene(s) to detect verotoxin producing E. coli.

Химиолюминесцентная гибридизация in situ

Специфические участки 16S рРНК в роде Enterobacteriaceae связываются олигонуклеотидными зондами, что позволяет контролировать качество питьевой воды.

Фиолетово-красный желчный агар

Твердая питательная среда используется для культивирования колиформ, ферментирующих лактозу, и содержит индикатор нейтрального красного для определения pH. Розовые колонии образуются при ферментации лактозы и окружены осажденной желчью. Для подтверждения того, что эти колонии являются колиформами, их пересевают на среду блестящего зеленого с лактозой и желчью (BGLB) и инкубируют. Обнаружение газа после инкубации подтверждает присутствие колиформ в образце.

Метод мембранного фильтра

Испытательные образцы фильтруются через стандартную фильтровальную бумагу, а затем пересеваются на среды M Endo или LES Endo Agar. Через 22–24 часа инкубации колонии приобретают розовато-красный цвет с металлическим зеленым блеском. Подтверждение того, что эти колонии являются колиформами, осуществляется путем пересева в лаурилтриптозный бульон (LST) с последующей проверкой на газообразование и пересевом в BGLB. Обнаружение газа в трубках BGLB указывает на положительный результат теста на наличие колиформных бактерий.