Кіріспе
Молекуланың антиденелер өзінің сызықтық құрылымы бойынша танитын сегменті. Иммунологияда сызықтық эпитоп (сонымен қатар тізбекті эпитоп) – антигендегі антиденелер аминқышқылдарының сызықтық тізбегі (яғни, бастапқы құрылымы) бойынша танитын байланысу орны. Керісінше, көптеген антиденелер белгілі бір үш өлшемді пішіні (үшінші деңгейлі құрылымы) бар конформациялық эпитопты таниды. Антиген – иммундық жүйе шетелдік зат ретінде танитын және иммундық жауапты тудыратын кез келген зат. Антигендер көбінесе кез келген рецепторға толығымен байланысуға тым үлкен ақуыздар болғандықтан, антигенді құрайтын нақты сегменттер ғана белгілі бір антиденемен байланысады. Мұндай сегменттер эпитоптар деп аталады. Сол сияқты, антидененің паратопы ғана эпитоппен жанасады. Ақуыздар аминқышқылдар деп аталатын азотты кіші бірліктерден тұрады. Ақуызды құрайтын аминқышқылдарының сызықтық тізбегі оның бастапқы құрылымы деп аталады, ол әдетте қарапайым тізбектей сызықты ақуыздар түрінде ұсынылмайды (түз тізбек емес, түйін сияқты). Бірақ, антиген лизосомада ыдырағанда, кішкентай пептидтер пайда болады, оларды тізбектей орналасқан аминқышқылдары арқылы тануға болады, сондықтан олар сызықтық эпитоптар деп аталады.
In immunology, a linear epitope (also sequential epitope) is an epitope—a binding site on an antigen—that is recognized by antibodies by its linear sequence of amino acids (i. e. primary structure). In contrast, most antibodies recognize a conformational epitope that has a specific three dimensional shape (tertiary structure). An antigen is any substance that the immune system can recognize as being foreign and which provokes an immune response. Since antigens are usually proteins that are too large to bind as a whole to any receptor, only specific segments that form the antigen bind with a specific antibody. Such segments are called epitopes. Likewise, it is only the paratope of the antibody that comes in contact with the epitope. Proteins are composed of repeating nitrogen containing subunits called amino acids. The linear sequence of amino acids that compose a protein is called its primary structure, which typically does not present as simple line of sequential proteins (much like a knot, rather than a straight string). But, when an antigen is broken down in a lysosome, it yields small peptides, which can be recognized through the amino acids that lie continuously in a line, and hence are called linear epitopes.
Маңыздылығы
Молекулалық талдаулар жүргізу кезінде, антиденелерді қолдануда, мысалы, Вестерн блот, иммуногистохимия және ELISA сияқты әдістерде, сызықтық немесе конформациялық эпитоптарды танитын антиденелерді мұқият таңдау қажет. Мысалы, егер белок үлгісі қайнатылып, бета-меркаптоэтанолмен өңделсе және Вестерн блот үшін SDS PAGE-де жүргізілсе, белоктар негізінен денатурацияланады, демек олардың табиғи үш өлшемді құрылымын алуға мүмкіндік болмайды. Сондықтан иммунодетекция үшін конформациялық эпитоптардың орнына сызықтық эпитоптарды танитын антиденелер таңдалады. Керісінше, иммуногистохимияда белок құрылымы сақталатындықтан, конформациялық эпитоптарды танитын антиденелерге басымдық беріледі.