Введение

Филум бактерий Ацидобактериота — это филум грамотрицательных бактерий. Его представители физиологически разнообразны и широко распространены, особенно в почвах, но их недостаточно представлено в культуре.

Описание

Члены этой группы физиологически разнообразны и могут быть найдены в различных средах обитания, включая почву, разлагающуюся древесину, горячие источники, океаны, пещеры и почвы, загрязненные металлами. Члены этой группы особенно многочисленны в почвенных местообитаниях, составляя до 52% от общего числа бактерий. Факторы окружающей среды, такие как pH и питательные вещества, оказывают влияние на динамику Acidobacteriota. Многие Acidobacteriota являются ацидофильными, включая первого описанного представителя этой группы, Acidobacterium capsulatum. О Acidobacteria остается многое неизвестного, как в отношении их формы, так и их функций. Таким образом, это развивающаяся область микробиологии. Часть этой неопределенности связана с трудностями, возникающими при культивировании этих бактерий в лабораторных условиях. В последнее время достигнуты успехи в размножении с использованием низких концентраций питательных веществ в сочетании с высоким содержанием CO2, например, у Geothrix fermentans, Acanthopleuribacter pedis и Bryobacter aggregatus. Поскольку они были открыты относительно недавно, и подавляющее большинство представителей не культивировано, экология и метаболизм этих бактерий изучены недостаточно. Представители подразделений 1, 4 и 6 особенно распространены в почвах. Помимо естественной почвенной среды обитания, неклассифицированные представители подразделения 2 Acidobacteriota также были идентифицированы как контаминанты реагентов для выделения ДНК, что может приводить к их ложному обнаружению в данных о микробиоте или метагеноме. Представители подразделения 1 доминируют в условиях низкого pH, вероятно, из-за специализации клеток и стабильности ферментов. Некоторые Acidobacteriota, относящиеся к подразделению 8, считаются анаэробами. Было установлено, что некоторые штаммы Acidobacteriota, выделенные из почвы, обладают геномным потенциалом для дыхания кислородом при атмосферных и суб-атмосферных концентрациях. Однако Acidobacteriota были признаны отдельной кладой только в 1997 году, а первый геном был секвенирован в 2006 году.