Кіріспе

Бактериялар тобы Ацидобактериота – грам-теріс бактериялар тобы. Оның өкілдері физиологиялық тұрғыдан алуан түрлі және кең таралған, әсіресе топырақтарда, бірақ зертханалық жағдайда өсіру қиын.

Сипаттама

Бұл филомның мүшелері физиологиялық тұрғыдан алуан түрлі және оларды топырақ, ыдырайтын ағаш, ыстық су бұлақтары, мұхиттар, үңгірлер және металл қосылған топырақтар сияқты әртүрлі орталарда кездестіруге болады. Бұл филомның мүшелері топырақ ортасында кең таралған, жалпы бактериялық қоғамдастықтың 52%-ын құрайды. Ацидобактериоталардың динамикасына pH және қоректік заттар сияқты қоршаған орта факторларының әсері байқалады. Көптеген ацидобактериоталар қышқылды жағдайды ұнатады, оның ішінде филомның алғаш сипатталған мүшесі – Acidobacterium capsulatum. Ацидобактериялардың пішіні мен функциясы туралы көп мәселе әлі де зерттеуді күтуде. Осылайша, бұл микробиологияның дами жұп келе жатқан саласы. Бұл белгісіздіктің бір бөлігі осы бактерияларды зертханада өсірудің қиындығымен байланысты. Жақында азық заттардың төмен концентрациясын және жоғары мөлшердегі CO2-ні, сондай-ақ Geothrix fermentans, Acanthopleuribacter pedis және Bryobacter aggregatus қолдану арқылы оларды көбейтуде сәттіліктерге қол жеткізілді. Олардың жақында ғана ашылғаны және көпшілігінің мәдениетке алынбағаны себепті, бұл бактериялардың экологиясы мен метаболизмі толыққанды түсініксіз. 1, 4 және 6-бөлімшелерінің мүшелері топырақта ерекше көптеп кездеседі. Табиғи топырақ ортасымен қатар, жіктелмеген 2-бөлімшесіндегі ацидобактериоталар ДНК-ны бөліп алу жиынтығының реагенттеріндегі ластанушы зат ретінде анықталды, бұл олардың микробиота немесе метагеномдық деректерде қате пайда болуына әкелуі мүмкін. 1-бөлімше мүшелерінің төмен pH жағдайында басымдығы анықталды, бұл жасушалардың мамандануымен және ферменттердің тұрақтылығымен байланысты болуы мүмкін. 8-бөлімшеде анаэробтар саналатын кейбір ацидобактериоталар бар. Топырақтан алынған ацидобактериоталардың кейбір штаммдарының атмосфералық және атмосферадан төмен концентрациядағы оттекті тыныс алуға геномдық қабілеті бар екені анықталды. Алайда, ацидобактериоталар 1997 жылға дейін жеке клад ретінде танылмады, ал алғашқы геном 2006 жылы секвенцияланды.