Введение

Биологический процесс обновления, восстановления и роста тканей.

Регенерация в биологии – это процесс обновления, восстановления и роста тканей, который обеспечивает устойчивость геномов, клеток, организмов и экосистем к естественным колебаниям или событиям, вызывающим нарушения или повреждения. Каждый вид способен к регенерации, от бактерий до человека. Регенерация может быть полной, когда новая ткань идентична утраченной, после чего некротическая ткань становится фиброзной. Однако в биологии регенерация в основном относится к морфогенным процессам, характеризующим фенотипическую пластичность признаков, позволяющую многоклеточным организмам восстанавливать и поддерживать целостность своего физиологического и морфологического состояния. Регенерация регулируется, прежде всего, асексуальными клеточными процессами, выше генетического уровня. Регенерация отличается от размножения. Например, гидра способны к регенерации, но размножаются почкованием. Регенеративный процесс протекает в две многоступенчатые фазы: подготовительную и фазу восстановления. Регенерация начинается с ампутации, которая запускает первую фазу. Сразу после ампутации мигрирующие эпидермальные клетки формируют эпителий раны, который утолщается за счет деления клеток в течение первой фазы, образуя колпачок вокруг места повреждения. После получения ранения их клетки активируются и восстанавливают органы до их прежнего состояния. Caudata (саламандры и тритоны), отряд хвостатых земноводных, возможно, является наиболее способной к регенерации группой позвоночных, учитывая их способность регенерировать конечности, хвосты, челюсти, глаза и различные внутренние структуры. Эхинодермы (например, морские звезды), раки, многие рептилии и амфибии демонстрируют замечательные примеры регенерации тканей. Например, автотомия служит защитной функцией, когда животное отбрасывает конечность или хвост, чтобы избежать захвата. После автотомии клетки активизируются, и ткани регенерируют. В некоторых случаях отброшенная конечность может сама регенерировать новую особь. Ограниченная регенерация конечностей наблюдается у большинства рыб и саламандр, а регенерация хвоста – у личинок лягушек и жаб (но не у взрослых особей). Целая конечность саламандры или тритона будет многократно отрастать после ампутации. У рептилий – черепах, крокодилов и змей – нет способности к регенерации утраченных частей, но многие (не все) виды ящериц, гекконов и игуан обладают высокой регенеративной способностью. Обычно это включает отбрасывание части хвоста и его последующую регенерацию как часть защитного механизма. При побеге от хищника, если хищник схватил хвост, он отсоединяется.

Экосистемы

Экосистемы способны к восстановлению. После нарушения, такого как пожар или вспышка численности вредителей в лесу, пионерные виды заселяют, конкурируют за пространство и закрепляются в новообразовавшейся среде обитания. Возобновление роста саженцев и процесс формирования сообщества известно как регенерация в экологии.

Молекулярные основы клеток

Формирование узоров в морфогенезе животного регулируется генетическими факторами индукции, которые активируют клетки после повреждения. Например, нервные клетки экспрессируют белки, связанные с ростом, такие как GAP 43, тубулин, актин, целый ряд новых нейропептидов и цитокинов, которые индуцируют клеточный физиологический ответ для регенерации после повреждения. Многие гены, участвующие в изначальном развитии тканей, вновь активируются в процессе регенерации. Клетки в зачатках плавников данио-рерио, например, экспрессируют четыре гена из семейства гомеобокс msx как в процессе развития, так и в процессе регенерации.

Ткани

Стратегии включают в себя перестройку существующей ткани, использование взрослых соматических стволовых клеток и дедифференциацию и/или трансдифференциацию клеток, и более одного механизма может функционировать в разных тканях одного и того же животного. В ходе развития активируются гены, которые изменяют свойства клеток по мере их дифференцировки в различные ткани. Развитие и регенерация включают координацию и организацию популяций клеток в бластему – “скопление стволовых клеток, с которого начинается регенерация”. Дедифференциация клеток означает, что они теряют свои тканеспецифические характеристики в процессе ремоделирования тканей при регенерации. Это не следует путать с трансдифференциацией, когда клетки теряют свои тканеспецифические характеристики в процессе регенерации, а затем повторно дифференцируются в клетки другого типа. Регенерационная способность ограничена стадией развития и способностью к линьке. Ракообразные, постоянно линяющие, способны к регенерации на протяжении всей жизни. Хотя циклы линьки обычно регулируются гормонально, ампутация конечности может индуцировать преждевременную линьку. Гемиметаболические насекомые, такие как сверчки, могут регенерировать конечности на стадии нимфы, до финальной линьки. Голометаболические насекомые могут регенерировать придатки на стадии личинки перед финальной линькой и метаморфозом. Например, личинки жуков способны регенерировать ампутированные конечности. Личинки плодовой мушки не имеют конечностей, но могут регенерировать зачатки придатков – имагинальные диски. В обеих системах рост новой ткани задерживает окукливание. Механизмы, лежащие в основе регенерации конечностей и придатков у насекомых и ракообразных, в значительной степени консервативны. В процессе регенерации конечностей виды из обеих таксонов формируют бластему, которая пролиферирует и растет, чтобы восстановить утраченную ткань.

Регенерация яда

Паукообразные, включая скорпионов, способны к регенерации яда, однако состав регенерированного яда отличается от первоначального в процессе регенерации, так как объем яда восстанавливается раньше, чем происходит полное восполнение активных белков.

Модель плодовой мухи

Плодовая мушка Drosophila melanogaster является полезной модельной системой для изучения молекулярных механизмов, управляющих регенерацией, в особенности регенерацией кишечника и зародышевой линии.

Аннелиды

Многие кольчатые черви (сегментированные черви) способны к регенерации. Например, Chaetopterus variopedatus и Branchiomma nigromaculata могут регенерировать как переднюю, так и заднюю части тела после поперечного деления. Связь между регенерацией соматических и зародышевых стволовых клеток изучалась на молекулярном уровне у кольчатого червя Capitella teleta. Однако пиявки, по-видимому, не способны к сегментарной регенерации. Более того, их близкие родственники, бранхиобделлиды, также не способны к сегментарной регенерации. Морфаллаксис включает в себя дедифференцировку, трансформацию и редифференцировку клеток для регенерации тканей. Степень выраженности морфаллактической регенерации у олигохет в настоящее время недостаточно изучена. Хотя о морфаллаксисе сообщается относительно редко, возможно, что она является распространенным механизмом межсегментарной регенерации у кольчатых червей. После регенерации у L. variegatus ранее задние сегменты иногда становятся передними в новой ориентации тела, что согласуется с морфаллаксисом. После ампутации большинство кольчатых червей способны быстро сокращая мышцы, герметизировать свое тело. Сокращение мышц тела может способствовать предотвращению инфекции. У некоторых видов, таких как Limnodrilus, аутолиз можно наблюдать в течение нескольких часов после ампутации в эктодерме и мезодерме. Считается также, что ампутация вызывает значительную миграцию клеток к месту повреждения, где они формируют раневой сгусток.

Иглокожие

Регенерация тканей широко распространена среди эхинодерм и хорошо задокументирована у морских звезд (Asteroidea), морских огурцов (Holothuroidea) и морских ежей (Echinoidea). Изучение регенерации конечностей у эхинодерм ведется как минимум с XIX века. Помимо конечностей, некоторые виды способны регенерировать внутренние органы и части центральной нервной системы. В ответ на повреждение морские звезды могут осуществлять автотомию поврежденных конечностей. Автотомия – это самоампутация части тела, как правило, конечности. В зависимости от степени повреждения, морские звезды затем в течение четырех недель регенерируют утраченную конечность. Для регенерации конечности некоторые виды должны сохранять клетки ротовой полости, поскольку для этого процесса требуется энергия.

Планьеры (Platyhelminthes)

Исследования регенерации с использованием планарий начались в конце 1800-х годов и были популяризированы Т. Х. Морганом в начале 20-го века. Алехандро Санчес Альварадо и Филип Ньюмарк превратили планарий в модельный генетический организм в начале 20-го века для изучения молекулярных механизмов, лежащих в основе регенерации у этих животных. Планарии обладают необычайной способностью восстанавливать утраченные части тела. Например, планария, разрезанная вдоль или поперек, регенерирует в два отдельных организма. В одном эксперименте Т. Х. Морган обнаружил, что кусок, составляющий 1/279 часть планарии, после ампутации, формирует бластему из необластов – плюрипотентных клеток, присутствующих во всем теле планарии. Новая ткань растет из необластов, при этом необласты составляют от 20 до 30% всех клеток планарии. Чтобы предотвратить голодание, планария использует собственные клетки для получения энергии, это явление известно как дерост. Таким образом, они могут полностью регенерировать свои конечности, хвост, челюсти и сетчатку посредством эпиморфной регенерации, приводящей к функциональной замене новой тканью. Регенерация конечностей саламандры происходит в два основных этапа. Сначала местные клетки дедифференцируются в месте раны в прогениторные клетки, образуя бластему. Затем клетки бластемы подвергаются клеточной пролиферации, формированию паттерна, клеточной дифференцировке и росту тканей, используя сходные генетические механизмы, которые действовали во время эмбрионального развития. Эпидермальные клетки продолжают мигрировать над зоной раны, формируя утолщенный, специализированный сигнальный центр, называемый апикальной эпителиальной крышкой (АЭК). В течение следующих нескольких дней происходят изменения в тканях культи, приводящие к формированию бластемы (массы дедифференцированных пролиферирующих клеток). По мере формирования бластемы активируются гены формирования паттерна, такие как HoxA и HoxD, как это происходило при формировании конечности в эмбрионе. Позиционная идентичность дистального конца конечности (т.е. автопода, который является рукой или ногой) формируется первой в бластеме. Промежуточные позиционные идентичности между культей и дистальным концом затем заполняются посредством процесса, называемого интеркалацией. Когда их удаляли, саламандры теряли способность к регенерации и вместо этого образовывали рубцовую ткань. Аксолотль – саламандра *Ambystoma mexicanum*, организм с исключительными способностями к регенерации конечностей, вероятно, подвергается эпигенетическим изменениям в клетках бластемы, которые усиливают экспрессию генов, участвующих в регенерации конечностей. У аксолотля очень мало крови и избыток эпидермальных клеток. Это позволяет пораженной области процветать благодаря эпидермальным клеткам, а продолжающаяся экспрессия генов позволяет области регенерировать до своего естественного состояния. Несмотря на исторически небольшое количество исследователей, изучающих регенерацию конечностей, в последнее время был достигнут значительный прогресс в установлении неотенической амфибии аксолотля (*Ambystoma mexicanum*) в качестве модельного генетического организма. Этому прогрессу способствовали достижения в геномике, биоинформатике и трансгенезе соматических клеток в других областях, что создало возможность исследовать механизмы важных биологических свойств, таких как регенерация конечностей, у аксолотля. Центр генетических ресурсов амбистомы (AGSC) – это самоподдерживающаяся размножающаяся колония аксолотлей, поддерживаемая Национальным научным фондом в качестве коллекции живых ресурсов. Расположенный в Университете Кентукки, AGSC занимается поставкой генетически хорошо охарактеризованных эмбрионов, личинок и взрослых аксолотлей в лаборатории по всей территории Соединенных Штатов и за рубежом. Грант NCRR, финансируемый NIH, привел к созданию базы данных Ambystoma EST, проекта Salamander Genome Project (SGP), который привел к созданию первой карты генов амфибий и нескольких аннотированных баз данных молекулярных данных, а также к созданию веб-портала для исследовательского сообщества. В 2022 году первая пространственно-временная карта выявила ключевые сведения о регенерации мозга аксолотля, а также предоставила интерактивный Атлас пространственно-временной интерпретации регенеративного телеэнцефалона аксолотля.

Модель лягушки

Ануран (лягушки) способны регенерировать свои конечности только на стадии эмбрионального развития. Реактивные формы кислорода (АФК) по-видимому, необходимы для запуска реакции регенерации у личинок ануранов. Производство АФК необходимо для активации Wnt-сигнального пути, который связан с регенерацией в других системах.

Гидра

Гидра – род пресноводных полипов из типа Cnidaria, обладающих высокопролиферативными стволовыми клетками, что обеспечивает им способность к регенерации всего тела. Любой фрагмент, содержащий более нескольких сотен эпителиальных клеток, отделившийся от тела, способен регенерировать в уменьшенную копию организма. Регенерация у гидры происходит как регенерация подошвы из базальной части тела, так и регенерация головного конца из апикальной области. Однако, в обоих случаях – регенерации подошвы и головного конца – возникают два различных молекулярных каскада: ранний ответ на повреждение и последующий, сигнально-зависимый путь регенерирующей ткани, приводящий к клеточной дифференцировке. Если гидру разрезать на две части, оставшиеся фрагменты формируют две полноценные и независимые гидры, приблизительно равные по размеру двум меньшим отделившимся фрагментам. Энхансер – это короткая последовательность ДНК (50–1500 пар оснований), к которой могут связываться факторы транскрипции для увеличения транскрипции определенного гена. В энхансерных областях, активирующихся во время регенерации головного конца, часто встречаются наборы мотивов транскрипционных факторов, которые, по-видимому, облегчают координированную экспрессию генов. Исследования на петухах показали, что птицы способны адекватно регенерировать некоторые части конечностей, и в зависимости от условий регенерации – возраста животного, взаимосвязи поврежденной ткани с другими мышцами и типа операции – может происходить полная регенерация некоторых мышечно-скелетных структур. Вербер и Голдшмидт (1909) обнаружили, что гуси и утки способны регенерировать клюв после частичной ампутации. Птицы также способны регенерировать волосковые клетки улитки после повреждения слухом или действием ототоксичных препаратов. Однако, современные исследования показывают, что репаративная регенерация у птиц ограничена периодами эмбрионального развития. Ряд методов молекулярной биологии успешно применяется для манипулирования клеточными путями, способствующими спонтанной регенерации в эмбрионах цыплят. Например, удаление части локтевого сустава у эмбриона цыпленка посредством вырезания окна или среза и сравнение специфических маркеров суставной ткани и маркеров хряща показали, что вырезание окна позволило 10 из 20 конечностей регенерировать и экспрессировать гены сустава аналогично развивающемуся эмбриону. В отличие от этого, срез не позволил суставу регенерировать из-за слияния скелетных элементов, что было выявлено по экспрессии маркеров хряща. Подобно физиологической регенерации волос у млекопитающих, птицы могут регенерировать свои перья для восстановления поврежденных или для привлечения партнеров своим оперением. Обычно сезонные изменения, связанные с сезоном размножения, запускают гормональный сигнал, побуждающий птиц к регенерации перьев. Это было экспериментально индуцировано с использованием гормонов щитовидной железы у кур породы Род-Айленд.

млекопитающие

Млекопитающие способны к клеточной и физиологической регенерации, но в целом обладают ограниченной репаративной регенеративной способностью. Самцы оленей ежегодно теряют рога в период с января по апрель, а затем восстанавливают их посредством регенерации. Рога оленя – единственный придаток млекопитающего, способный отрастать каждый год. Хотя репаративная регенерация – редкое явление у млекопитающих, она все же встречается. Хорошо задокументированным примером является регенерация кончика пальца дистальнее ногтевого ложа. Репаративная регенерация также наблюдалась у кроликов, пик и африканских колючих мышей. В 2012 году исследователи обнаружили, что два вида африканских колючих мышей, Acomys kempi и Acomys percivali, способны полностью регенерировать ткани, отторгнутые аутотомией или иным образом поврежденные. Эти виды могут восстанавливать волосяные фолликулы, кожу, потовые железы, шерсть и хрящи. Помимо этих двух видов, последующие исследования показали, что Acomys cahirinus способен регенерировать кожу и вырезанные ткани в ушной раковине. Несмотря на эти примеры, общепринято считать, что взрослые млекопитающие обладают ограниченной регенеративной способностью по сравнению с большинством эмбрионов/личинок позвоночных, взрослых саламандр и рыб. Однако подход к регенеративной терапии Роберта О. Беккера, основанный на электрической стимуляции, показал многообещающие результаты для крыс и млекопитающих в целом. Некоторые исследователи также утверждают, что штамм мышей MRL обладает повышенной регенеративной способностью. Исследования, сравнивающие дифференциальную экспрессию генов у мышей MRL, заживающих без образования рубцов, и мышей штамма C57BL/6, плохо заживающих, выявили 36 генов, отличающих процесс заживления у мышей MRL от других мышей. Изучение регенеративных процессов у этих животных направлено на то, чтобы выяснить, как воспроизвести их у человека, например, путем деактивации гена p21. Однако недавние исследования показали, что мыши MRL на самом деле закрывают небольшие отверстия в ушах рубцовой тканью, а не регенерируют их, как предполагалось ранее. Тем не менее, последние исследования свидетельствуют о том, что это не всегда так, и что мыши MRL могут регенерировать ткани после повреждения сердца.

Люди

Исследуется восстановление утраченных тканей или органов в организме человека. Некоторые ткани, такие как кожа, восстанавливаются довольно легко; другие, как считалось, обладают незначительной или вообще не обладают способностью к регенерации, но продолжающиеся исследования позволяют надеяться в отношении различных тканей и органов. К регенерированным органам человека относятся мочевой пузырь, влагалище и половой член. Как и все метазои, люди способны к физиологической регенерации (т.е. к замене клеток в процессе гомеостатического поддержания, не требующей повреждения). Например, регенерация эритроцитов посредством эритропоэза происходит в результате созревания эритроцитов из гематопоэтических стволовых клеток в костном мозге, их последующей циркуляции в течение примерно 90 дней в кровотоке и их окончательной гибели в селезенке. Другим примером физиологической регенерации является отторжение и восстановление функционального эндометрия во время каждого менструального цикла у женщин в ответ на изменяющиеся уровни циркулирующих эстрогенов и прогестерона. Однако у людей ограничена способность к репаративной регенерации, которая происходит в ответ на повреждение. Одной из наиболее изученных регенеративных реакций у человека является гипертрофия печени после повреждения печени. Например, исходная масса печени восстанавливается прямо пропорционально количеству удаленной печени после частичной гепатэктомии, что указывает на то, что сигналы организма точно регулируют массу печени как в положительном, так и в отрицательном направлении, до достижения желаемой массы. Этот ответ рассматривается как клеточная регенерация (форма компенсаторной гипертрофии), при которой функция и масса печени восстанавливаются за счет пролиферации существующих зрелых клеток печени (в основном гепатоцитов), но точная морфология печени не восстанавливается. Нейрогенез взрослых также является формой клеточной регенерации. Например, обновление нейронов гиппокампа происходит у нормальных взрослых людей со скоростью обновления 1,75% нейронов в год. Обновление кардиомиоцитов наблюдается у здоровых взрослых людей и с более высокой частотой у взрослых после острой травмы сердца, такой как инфаркт. Даже в миокарде взрослого человека после инфаркта пролиферация обнаруживается только примерно в 1% миоцитов вокруг области повреждения, чего недостаточно для восстановления функции сердечной мышцы. Однако это может быть важной целью для регенеративной медицины, поскольку это подразумевает, что регенерацию кардиомиоцитов, а следовательно, и миокарда, можно индуцировать. Другим примером репаративной регенерации у человека является регенерация кончиков пальцев, которая происходит после ампутации фаланги дистальнее ногтевого ложа (особенно у детей), и регенерация ребра, которая происходит после остеотомии при лечении сколиоза (хотя обычно регенерация является лишь частичной и может занять до одного года). Еще одним примером регенерации у человека является регенерация семявыносящих протоков, которая происходит после вазэктомии и приводит к неудаче вазэктомии.

Рептилии

Способность и степень регенерации у рептилий различаются у разных видов (см. ), но наиболее заметным и хорошо изученным случаем является регенерация хвоста у ящериц. Помимо ящериц, регенерация наблюдается в хвосте и верхнечелюстной кости крокодилов, а также отмечается нейрогенез у взрослых особей. Регенерация хвоста никогда не наблюдалась у змей, но см. После автотомии хвоста, эпиморфная регенерация нового хвоста происходит посредством процесса, опосредованного бластемой, что приводит к образованию структуры, функционально и морфологически схожей с исходной. Белые бамбуковые акулы способны регенерировать как минимум две трети печени, что связано с тремя микроРНК: xtr miR 125b, fru miR 204 и has miR 142 3p. В одном исследовании было удалено две трети печени, и в течение 24 часов более половины оставшейся печени подверглось гипертрофии. Некоторые акулы могут восстанавливать чешую и даже кожу после повреждений. В течение двух недель после ранения в рану выделяется слизь, что запускает процесс заживления. Одно исследование показало, что большая часть поврежденной области регенерировала в течение 4 месяцев, однако регенерированная область также демонстрировала значительную вариабельность.