Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Вид вируса
Species of virus
Вирус краснухи (RuV) является возбудителем заболевания краснухой, передается исключительно от человека к человеку воздушно-капельным путем и является основной причиной врожденного синдрома краснухи при инфицировании в первые недели беременности. Вирус краснухи, научное название Rubivirus rubellae, относится к роду Rubivirus и семейству Matonaviridae, члены которого обычно имеют геном одноцепочечной РНК положительной полярности, заключенный в икосаэдрическую капсиду. По состоянию на 1999 год молекулярные механизмы развития врожденного синдрома краснухи еще не были полностью выяснены, однако исследования in vitro на клеточных линиях показали, что вирус краснухи оказывает апоптотическое действие на определенные типы клеток. Имеются данные о механизме, зависящем от p53.
Rubella virus (RuV) is the pathogenic agent of the disease rubella, transmitted only between humans via the respiratory route, and is the main cause of congenital rubella syndrome when infection occurs during the first weeks of pregnancy. Rubella virus, scientific name Rubivirus rubellae, is a member of the genus Rubivirus and belongs to the family of Matonaviridae, whose members commonly have a genome of single stranded RNA of positive polarity which is enclosed by an icosahedral capsid. as of 1999 the molecular basis for the causation of congenital rubella syndrome was not yet completely clear, but in vitro studies with cell lines showed that rubella virus has an apoptotic effect on certain cell types. There is evidence for a p53 dependent mechanism.
Таксономия
Вирус краснухи (Rubivirus rubellae) отнесен к роду Rubivirus. Это изменение внесено Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV) – центральным органом, определяющим классификацию вирусов. Matonaviridae сохраняется в той же надцарстве, что и Togaviridae, Riboviria, благодаря своему РНК-геному и РНК-зависимой РНК-полимеразе. Ни один из этих вирусов не известен как поражающий людей.
Rubella virus (Rubivirus rubellae) is assigned to the Rubivirus genus. The change was made by the International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV), the central governing body for viral classification. Matonaviridae remains part of the realm that it was already in as Togaviridae, Riboviria, because of its RNA genome and RNA dependent RNA polymerase. Neither of them are known to infect people.
Капсидный белок
Внутри липидной оболочки находится капсид диаметром 40 нм. Капсидный белок (CP) выполняет различные функции. Его основными задачами являются формирование гомоолигомеров для построения капсида и связывание геномной РНК. Кроме того, он отвечает за агрегацию РНК внутри капсида, взаимодействует с мембранными белками E1 и E2, а также связывается с человеческим белком-хозяином p32, который играет важную роль в репликации вируса в клетке-хозяине. В отличие от альфавирусов, капсид не подвергается аутопротеолизу, а отделяется от остальной части полипротеина сигнальной пептидазой. Синтез капсида происходит на поверхности внутриклеточных мембран одновременно с почкованием вируса.
Inside the lipid envelope is a capsid of 40 nm in diameter. The capsid protein (CP) has different functions. Its main tasks are the formation of homooligomeres to form the capsid, and the binding of the genomic RNA. Further is it responsible for the aggregation of RNA in the capsid, it interacts with the membrane proteins E1 and E2 and binds the human host protein p32 which is important for replication of the virus in the host. As opposed to alphaviruses the capsid does not undergo autoproteolysis, rather is it cut off from the rest of the polyprotein by the signal peptidase. Production of the capsid happens at the surface of intracellular membranes simultaneously with the budding of the virus.
Геном
Геном содержит 9762 нуклеотида и кодирует 2 неструктурных полипептида (p150 и p90) в пределах первых двух третей 5'-конца и 3 структурных полипептида (C, E2 и E1) в пределах последних одной трети 3'-конца. Оба белка оболочки, E1 и E2, гликозилированы. В матонавирусах выделяют три высококонсервативных участка: структура «стебель-петля» в 5'-конце генома, 51-нуклеотидная консервативная последовательность вблизи 5'-конца генома и 20-нуклеотидная консервативная последовательность в точке начала субгеномной РНК. Гомологичные последовательности обнаружены в геноме вируса краснухи. Единственная значимая область гомологии между вирусом краснухи и альфавирусами локализована в NH2-конце неструктурного белка 3. Эта последовательность обладает геликазной и репликазной активностью. В геноме вируса краснухи она имеет ориентацию, обратную той, что наблюдается в альфавирусах, что свидетельствует о перестройке генома. Геном характеризуется самым высоким содержанием G+C среди всех известных на данный момент одноцепочечных РНК-вирусов (~70%). Несмотря на высокое содержание GC, использование кодонов соответствует таковому у человека-хозяина.
The genome has 9,762 nucleotides and encodes 2 nonstructural polypeptides (p150 and p90) within its 5′ terminal two thirds and 3 structural polypeptides (C, E2, and E1) within its 3′ terminal one third. Both envelope proteins E1 and E2 are glycosylated. There are three sites that are highly conserved in Matonaviruses: a stem and loop structure at the 5' end of the genome, a 51 nucleotide conserved sequence near the 5' end of the genome and a 20 nucleotide conserved sequence at the subgenomic RNA start site. Homologous sequences are present in the rubella genome. The only significant region of homology between rubella and the alphaviruses is located at the NH2 terminus of non structural protein 3. This sequence has helicase and replicase activity. In the rubella genome these occur in the opposite orientation to that found in the alphaviruses indicating that a genome rearrangement has occurred. The genome has the highest G+C content of any currently known single stranded RNA virus (~70%). Despite this high GC content its codon use is similar to that of its human host.