Семейство бактерий Halomonadaceae: история классификации и особенности.
Halomonadaceae
Halomonadaceae: семейство галофильных бактерий Pseudomonadota. Роды Halomonas, Deleya, Chromohalobacter. Классификация, переклассификация видов и перспективы.
Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Семейство бактерий Halomonadaceae — это семейство галофильных бактерий из типа Pseudomonadota.
Family of bacteria
Halomonadaceae is a family of halophilic Pseudomonadota.
История
Семейство было первоначально описано в 1988 году и включало роды Halomonas и Deleya. В 1989 году Chromobacterium marismortui была переклассифицирована как Chromohalobacter marismortui, образовав третий род в семействе Halomonadaceae. Впоследствии, в 1990 году, был обнаружен вид, который первоначально предлагалось назвать Volcaniella eurihalina, формируя новый род в семействе Halomonadaceae, но позже (в 1995 году) он был переклассифицирован в род Halomonas. Вид Carnimonas nigrificans (единственный представитель рода) не был включен в семейство из-за отсутствия двух из 15 описательных сигнальных последовательностей 16S рРНК, однако было предложено переклассифицировать его в это семейство. В 1996 году семейство было реорганизовано путем объединения родов Deleya, Halomonas и Halovibrio, а также вида Paracoccus halodenitrificans в род Halomonas и включения в него рода Zymobacter. Однако позже было установлено, что штаммы Halovibrio variabilis DSM 3051 и DSM 3050 различаются, и последний был определен как типовой штамм Halovibrio, который до сих пор используется, и в настоящее время включает два вида (второй вид – Halovibrio denitrificans), а в 2009 году Halomonas marisflavi, Halomonas indalinina и Halomonas avicenniae были перенесены в новый род Kushneria (5 видов).
The family was originally described in 1988 to contain the genera Halomonas and Deleya. In 1989, Chromobacterium marismortui was reclassified as Chromohalobacter marismortui forming a third genus in the family Halomonadaceae. Subsequently, in 1990 a species was discovered and was originally proposed to be called Volcaniella eurihalina forming a new genus in the Halomonadaceae, but was later (in 1995) reclassified as a member of the genus Halomonas. The species Carnimonas nigrificans (sole member of genus) was not placed in the family due to the lack of two out of 15 descriptive 16S rRNA signature sequences, but it has been proposed to reclassify it into the family. In 1996, the family was later reorganised by unifying genera Deleya, Halomonas and Halovibrio and the species Paracoccus halodenitrificans into Halomonas and placing Zymobacter in this family. However, it was later discovered that the strain of Halovibrio variabilis DSM 3051 and DSM 3050 differed and the latter was made type strain of the Halovibrio, which remains still in use. and now comprising two species (the other being Halovibrio denitrificans) and in 2009 Halomonas marisflavi, Halomonas indalinina. and Halomonas avicenniae were transferred to a new genus called Kushneria (5 species)
В последнее время было создано несколько монотипических родов: в 2007 году описан Halotalea alkalilenta, в 2009 году – Aidingimonas halophila, в 2006 году – Halospina denitrificans, в 2009 году – Salinicola socius. К последнему роду были отнесены два вида: Halomonas salaria как Salinicola salarius и Chromohalobacter salarius как Salinicola halophilus. В семейство также входит недавно обнаруженная, но некультивируемая бактерия "Candidatus Portiera aleyrodidarum" (первичные эндосимбионты белокрылок).
Several singleton genera were created recently: in 2007, Halotalea alkalilenta was described, Aidingimonas halophila in 2009, Halospina denitrificans in 2006, Salinicola socius in 2009. To the latter genus two species were transferred Halomonas salaria as Salinicola salarius and Chromohalobacter salarius as Salinicola halophilus. The family also contain the recently discovered but uncultured bacterium "Candidatus Portiera aleyrodidarum" (primary endosymbionts of whiteflies).
Исследования
Геомикробиолог Фелиса Вольф-Саймон с командой, финансируемой НАСА, исследует определенный штамм семейства Halomonadaceae, названный GFAJ 1, который был изолирован и выращен из отложений, собранных вдоль берега озера Моно, рядом с национальным парком Йосемити в восточной Калифорнии. Этот штамм GFAJ 1 семейства Halomonadaceae способен расти в присутствии высоких концентраций мышьяка.
Geomicrobiologist Felisa Wolfe Simon with a NASA funded team is researching a particular strain the family Halomonadaceae, named GFAJ 1, isolated and cultured from sediments collected along the shore of Mono Lake, near Yosemite National Park in eastern California. This GFAJ 1 strain of Halomonadaceae can grow in the presence of high concentrations of arsenic.