Класс бактерий Chloroflexia: Таксономия и особенности
Chloroflexia
Хлорофлексия: класс бактерий с нитевидной структурой и способностью к глидингу. Происхождение названия – "зелёно-жёлтый" и "изогнутый". Подробности здесь!
Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Класс бактерий
Class of bacteria
Хлорофлексии (Chloroflexia) — это класс бактерий из типа Chloroflexota. Хлорофлексии обычно имеют нитчатую структуру и способны перемещаться посредством бактериального скольжения. Они названы в честь отряда Chloroflexales, что означает "зеленовато-жёлтый", и латинского слова flexus (от flecto), означающего "изогнутый", в значении "зелёный изгиб". Название не связано с хлором, элементом, который был открыт сэром Хамфри Дэви в 1810 году и получил своё название из-за его бледно-зелёного цвета.
The Chloroflexia are a class of bacteria in the phylum Chloroflexota. Chloroflexia are typically filamentous, and can move about through bacterial gliding. It is named after the order Chloroflexales. meaning "greenish yellow" and the Latin flexus (of flecto) meaning "bent" to mean "a green bending". The name is not due to chlorine, an element confirmed as such in 1810 by Sir Humphry Davy and named after its pale green colour.
Таксономия и молекулярные сигнатуры
Класс Chloroflexia — это группа глубоко ветвящихся фотосинтетических бактерий (за исключением видов Herpetosiphon и Kallotenue), включающая в настоящее время три порядка: Chloroflexales, Herpetosiphonales и Kallotenuales. Порядки Herpetosiphonales и Kallotenuales каждый состоит из одного рода, входящего в собственное семейство — Herpetosiphonaceae (Herpetosiphon) и Kallotenuaceae (Kallotenue) соответственно, тогда как порядок Chloroflexales обладает большим филогенетическим разнообразием.
The Chloroflexia class is a group of deep branching photosynthetic bacteria (with the exception of Herpetosiphon and Kallotenue species) that currently consist of three orders: Chloroflexales, Herpetosiphonales, and Kallotenuales. The Herpetosiphonales and Kallotenuales each consist of a single genus within its own family, Herpetosiphonaceae (Herpetosiphon) and Kallotenuaceae (Kallotenue), respectively, whereas the Chloroflexales are more phylogenetically diverse.
Генетические отличительные признаки
Сравнительный геномный анализ недавно уточнил таксономию класса Chloroflexia, разделив Chloroflexales на подотряд Chloroflexineae, включающий семейства Oscillachloridaceae и Chloroflexaceae, и подотряд Roseiflexineae, содержащий семейство Roseiflexaceae.
Comparative genomic analysis has recently refined the taxonomy of the class Chloroflexia, dividing the Chloroflexales into the suborder Chloroflexineae consisting of the families Oscillachloridaceae and Chloroflexaceae, and the suborder Roseiflexineae containing family Roseiflexaceae.
Физиологические отличительные признаки
Дополнительным подтверждением разделения Хлорофлексальных на два подпорядка служат наблюдаемые различия в физиологических характеристиках: каждый подпорядок характеризуется уникальными каротиноидами, хинонами и профилями жирных кислот, которые последовательно отсутствуют у представителей другого подпорядка. Помимо разграничения таксономических групп, CSI могут играть роль в уникальных особенностях членов клады. В частности, в белке пируват-флаводоксин/ферредоксин-оксидоредуктазе – белке, играющем важную роль в фотосинтезирующих организмах – обнаружена вставка из четырех аминокислот, которая эксклюзивно присутствует у всех представителей рода Chloroflexus и, предположительно, выполняет важную функциональную роль. Дополнительные исследования с использованием CSI позволили уточнить филогенетическое положение Chloroflexia относительно других фотосинтетических групп, таких как цианобактерии. Chloroflexia разделяет ряд CSI с Chlorobiota в белках, синтезирующих хлорофилл. Поскольку эти две линии не являются близкородственными, интерпретируется, что CSI являются результатом горизонтального переноса генов между ними. В свою очередь, Chloroflexia приобрела эти белки посредством другого горизонтального переноса генов от морских цианобактерий "клада C".
Additional support for the division of the Chloroflexales into two suborders is the observed differences in physiological characteristics where each suborder is characterized by distinct carotenoids, quinones, and fatty acid profiles that are consistently absent in the other suborder. In addition to demarcating taxonomic ranks, CSIs may play a role in the unique characteristics of members within the clade: In particular, a four amino acid insert in the protein pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase, a protein which plays important roles in photosynthetic organisms, has been found exclusively among all members in the genus Chloroflexus, and is thought to play an important functional role. Additional work has been done using CSIs to demarcate the phylogenetic position of Chloroflexia relative to other photosynthetic groups such as the Cyanobacteria. Chloroflexia shares a number of CSIs with Chlorobiota in the chlorophyll synthesizing proteins. As the two lineages are not otherwise closely related, the interpretation is that the CSIs are the result of a horizontal gene transfer event between the two. Chloroflexia in turn acquired these proteins by another HGT from a "Clade C" marine cyanobacteria.