Введение
Класс ферментов
Кофермент Q: цитохром c-оксидоредуктаза, иногда называемый комплексом цитохрома bc1, а также комплексом III, является третьим комплексом в цепи транспорта электронов, играющим критическую роль в биохимическом образовании АТФ (окислительное фосфорилирование). Комплекс III представляет собой многосубъединичный трансмембранный белок, кодируемый как митохондриальным (цитохром b), так и ядерным геномом (всеми остальными субъединицами). Комплекс III присутствует в митохондриях всех животных и всех аэробных эукариот, а также во внутренних мембранах большинства эубактерий. Мутации в комплексе III вызывают непереносимость физических нагрузок, а также мультисистемные нарушения. Комплекс bc1 содержит 11 субъединиц, 3 дыхательных субъединицы (цитохром B, цитохром C1, белок Риске), 2 структурных белка и 6 белков с низкой молекулярной массой. Убихинол-цитохром c-редуктаза катализирует химическую реакцию:
QH2 + 2 феррицитохром c → Q + 2 ферроцитохром c + 2 H+
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются хинол (QH2) и ферри (Fe3+) цитохром c, в то время как тремя его продуктами являются хинон (Q), ферро (Fe2+) цитохром c и H+. Этот фермент относится к семейству оксидоредуктаз, в частности к тем, которые действуют на дифенолы и родственные вещества в качестве донора с цитохромом в качестве акцептора. Этот фермент участвует в окислительном фосфорилировании. Он содержит четыре кофактора: цитохром c1, цитохром b562, цитохром b566 и 2-железный ферредоксин типа Риске.
Состав комплекса
У позвоночных комплекс bc1, или комплекс III, содержит 11 субъединиц: 3 дыхательные субъединицы, 2 структурных белка и 6 белков с низкой молекулярной массой. Протеобактериальные комплексы могут содержать всего три субъединицы.
Таблица состава подразделов комплекса III
Нет. Название субъединицыСимвол гена человекаОписание белка из UniProtСемейство Pfam с человеческим белкомРеспираторные субъединицы 1 MT CYB / Cyt b MT CYB Цитохром b 2 CYC1 / Cyt c1 CYC1 Цитохром c1, гемовый белок, митохондриальный 3 Rieske / UCR1 UQCRFS1 Субъединица цитохром b c1 комплекса Rieske, митохондриальная , Основные белковые субъединицы 4 QCR1 / SU1 UQCRC1 Субъединица 1 цитохром b c1 комплекса, митохондриальная , 5 QCR2 / SU2 UQCRC2 Субъединица 2 цитохром b c1 комплекса, митохондриальная , Субъединицы с низкой молекулярной массой 6 QCR6 / SU6 UQCRH Субъединица 6 цитохром b c1 комплекса, митохондриальная 7 QCR7 / SU7 UQCRB Субъединица 7 цитохром b c1 комплекса 8 QCR8 / SU8 UQCRQ Субъединица 8 цитохром b c1 комплекса 9 QCR9 / SU9 UQCRFS1a (N-концевой фрагмент Rieske, отдельной записи нет) 10 QCR10 / SU10 UQCR10 Субъединица 9 цитохром b c1 комплекса 11 QCR11 / SU11 UQCR11 Субъединица 10 цитохром b c1 комплекса
a У позвоночных продукт расщепления 8 кДа от N-конца белка Rieske (сигнальный пептид) сохраняется в комплексе в качестве субъединицы 9. Таким образом, субъединицы 10 и 11 соответствуют грибковым QCR9p и QCR10p.
a In vertebrates, a cleavage product of 8 kDa from the N terminus of the Rieske protein (Signal peptide) is retained in the complex as subunit 9. Thus subunits 10 and 11 correspond to fungal QCR9p and QCR10p.
Ингибиторы комплекса III
Существует три отчетливые группы ингибиторов комплекса III. Антимицин А связывается с сайтом Qi и ингибирует перенос электронов в комплексе III от гема bH к окисленному Q (ингибитор сайта Qi). Миксотиазол и стигматиллин связываются с сайтом Qo и ингибируют перенос электронов от восстановленного QH2 к Rieske железо-серному белку. Миксотиазол и стигматиллин связываются с различными, но перекрывающимися углублениями в сайте Qo. Миксотиазол связывается ближе к цитохрому bL (поэтому его называют "проксимальным" ингибитором). Стигматиллин связывается дальше от гема bL и ближе к Rieske железо-серному белку, с которым он сильно взаимодействует. Некоторые из них были коммерциализированы как фунгициды (производные стробилурина, наиболее известным из которых является азоксистробин; ингибиторы QoI) и как противомалярийные препараты (атоваквон). Также пропилгекседрин ингибирует цитохром c редуктазу.
Свободные радикалы кислорода
Небольшая часть электронов покидает цепь электронного транспорта до достижения комплекса IV. Преждевременная утечка электронов к кислороду приводит к образованию супероксида. Значимость этой, казалось бы, незначительной побочной реакции заключается в том, что супероксид и другие реактивные формы кислорода обладают высокой токсичностью и, как считается, играют роль в развитии ряда патологий, а также в процессе старения (свободнорадикальная теория старения). Утечка электронов происходит главным образом в участке Qo и стимулируется антимицином А. Антимицин А фиксирует b-гемы в восстановленном состоянии, препятствуя их повторному окислению в участке Qi, что, в свою очередь, приводит к увеличению стационарных концентраций полухинона Qo, который затем реагирует с кислородом, образуя супероксид. Считается, что высокий мембранный потенциал оказывает аналогичное воздействие. Супероксид, образующийся в участке Qo, может высвобождаться как в митохондриальный матрикс, так и в межмембранное пространство, откуда он может достигать цитозоля. Это можно объяснить тем, что комплекс III может производить супероксид в виде мембранопроницаемого HOO•, а не в виде мембранонепроницаемого O.
Мутации в сложных генах III при болезнях человека
Мутации в генах, связанных с комплексом III, обычно проявляются в виде непереносимости физических нагрузок. Другие мутации, как сообщается, вызывают септооптическую дисплазию и мультисистемные заболевания. Однако мутации в BCS1L, гене, отвечающем за правильное созревание комплекса III, могут приводить к синдрому Бьёрнстада и синдрому GRACILE, которые у новорожденных являются летальными состояниями с мультисистемными и неврологическими проявлениями, характерными для тяжелых митохондриальных расстройств. Патогенность ряда мутаций была подтверждена на модельных системах, таких как дрожжи. Степень, в которой эти различные патологии обусловлены биоэнергетическим дефицитом или избыточной продукцией супероксида, в настоящее время не установлена.