Тест Мантеля: корреляция между матрицами и его применение в экологии.
Mantel test
Тест Мантеля: статистический анализ корреляции между матрицами. Применение в экологии для оценки расстояний между объектами (видами). Подробности здесь!
Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Тест Мантеля, названный в честь Натана Мантеля, — это статистический тест для оценки корреляции между двумя матрицами. Матрицы должны быть одинакового размера; в большинстве случаев они представляют собой матрицы взаимосвязей между одними и теми же наборами объектов. Тест был впервые опубликован Натаном Мантелем, биостатистиком из Национальных институтов здоровья, в 1967 году. Описание теста можно найти в учебниках по углубленной статистике (например, Sokal & Rohlf, 1995).
The Mantel test, named after Nathan Mantel, is a statistical test of the correlation between two matrices. The matrices must be of the same dimension; in most applications, they are matrices of interrelations between the same vectors of objects. The test was first published by Nathan Mantel, a biostatistician at the National Institutes of Health, in 1967. Accounts of it can be found in advanced statistics books (e. g., Sokal & Rohlf 1995).
Использование
Этот тест широко используется в экологии, где данные обычно представляют собой оценки «расстояния» между объектами, такими как виды организмов. Например, одна матрица может содержать оценки генетических расстояний (то есть величину различий между двумя разными геномами) между всеми возможными парами видов в исследуемой группе, полученные методами молекулярной систематики, а другая – оценки географического расстояния между ареалами каждого вида по отношению ко всем остальным видам. В этом случае проверяется гипотеза о том, существует ли связь между изменчивостью генетических характеристик этих организмов и изменчивостью географических расстояний.
The test is commonly used in ecology, where the data are usually estimates of the "distance" between objects such as species of organisms. For example, one matrix might contain estimates of the genetic distances (i. e., the amount of difference between two different genomes) between all possible pairs of species in the study, obtained by the methods of molecular systematics; while the other might contain estimates of the geographical distance between the ranges of each species to every other species. In this case, the hypothesis being tested is whether the variation in genetics for these organisms is correlated to the variation in geographical distance.
Критика
В различных работах, представляющих тест Мантеля (и его расширение, частичный тест Мантеля), отсутствует четкая статистическая основа, полностью определяющая нулевую и альтернативную гипотезы. Это может создать ложное впечатление об универсальности этих тестов. Например, тесты Мантеля и частичного Мантеля могут давать неверные результаты при наличии пространственной автокорреляции и возвращать ошибочно низкие p-значения. См., например, Guillot и Rousset (2013).
The various papers introducing the Mantel test (and its extension, the partial Mantel test) lack a clear statistical framework specifying fully the null and alternative hypotheses. This may convey the wrong idea that these tests are universal. For example, the Mantel and partial Mantel tests can be flawed in the presence of spatial auto correlation and return erroneously low p values. See, e. g., Guillot and Rousset (2013).