Мантел сынағы: екі матрица арасындағы корреляцияны анықтау
Mantel test
Мантел сынағы: екі матрица арасындағы корреляцияны бағалау. Экологияда кең қолданылады, түрлер арасындағы қашықтықты анықтауға көмектеседі. Статистикалық тест.
Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.
Мазмұны
Кіріспе
Нейтан Мантелдің есімімен аталған Мантел сынағы – екі матрица арасындағы корреляцияны тексеруге арналған статистикалық тест. Матрицалардың өлшемдері бірдей болуы керек; көбінесе олар бірдей объектілер жиыны арасындағы байланыстарды көрсететін матрицалар болып табылады. Бұл тестті алғаш рет 1967 жылы Ұлттық денсаулық сақтау институтының биостатистигі Нейтан Мантел жариялаған. Осы тест туралы мәліметтерді жоғары деңгейдегі статистикалық оқулықтарда табуға болады (мысалы, Sokal & Rohlf 1995).
The Mantel test, named after Nathan Mantel, is a statistical test of the correlation between two matrices. The matrices must be of the same dimension; in most applications, they are matrices of interrelations between the same vectors of objects. The test was first published by Nathan Mantel, a biostatistician at the National Institutes of Health, in 1967. Accounts of it can be found in advanced statistics books (e. g., Sokal & Rohlf 1995).
Қолданылуы
Тест экологияда кеңінен қолданылады, онда деректер әдетте организм түрлері сияқты объектілер арасындағы "қашықтықтың" бағалауларын құрайды. Мысалы, бір матрица молекулалық систематика әдістерімен алынған зерттеудегі барлық мүмкін жұп түрлер арасындағы генетикалық қашықтықтарды (яғни екі түрлі геном арасындағы айырмашылық деңгейін) қамтуы мүмкін; ал екінші матрицада әр түрдің басқа түрлердің таралған ареалдарына дейінгі географиялық қашықтығының бағалаулары болуы мүмкін. Бұл жағдайда тексерілетін гипотеза – аталған организмдердің генетикалық вариациясы географиялық қашықтықтағы вариациямен байланысты ма екендігі.
The test is commonly used in ecology, where the data are usually estimates of the "distance" between objects such as species of organisms. For example, one matrix might contain estimates of the genetic distances (i. e., the amount of difference between two different genomes) between all possible pairs of species in the study, obtained by the methods of molecular systematics; while the other might contain estimates of the geographical distance between the ranges of each species to every other species. In this case, the hypothesis being tested is whether the variation in genetics for these organisms is correlated to the variation in geographical distance.
Сын
Мантель сынағын (және оның кеңейтілімін, ішінара Мантель сынағын) таныстырған түрлі мақалаларда нөлдік және баламалы гипотезаларды толыққанды көрсететін нақты статистикалық аяқ жоқ. Бұл осы сынақтардың жалпыға қолданылатындығы туралы жаңылыс түсінік тудыруы мүмкін. Мысалы, Мантель және ішінара Мантель сынақтары кеңістіктік автокорреляция болған жағдайда бұрмаланған нәтижелер бере алады және дұрыс емес, төмен p мәндерін шығаруы мүмкін. Мысалы, Guillot and Rousset (2013) еңбегін қараңыз.
The various papers introducing the Mantel test (and its extension, the partial Mantel test) lack a clear statistical framework specifying fully the null and alternative hypotheses. This may convey the wrong idea that these tests are universal. For example, the Mantel and partial Mantel tests can be flawed in the presence of spatial auto correlation and return erroneously low p values. See, e. g., Guillot and Rousset (2013).