Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Сигнал белка, который вызывает высвобождение транскрибированной РНК в стоп-кодоне В молекулярной биологии, терминационный фактор - это белок, который опосредует прекращение транскрипции РНК, распознавая терминатор транскрипции и вызывая высвобождение вновь сделанной мРНК. Это часть процесса, который регулирует транскрипцию РНК для сохранения целостности экспрессии генов и присутствует как у эукариотов, так и у прокариотов, хотя процесс в бактериях более широко известен. Наиболее широко изученным и подробным фактором транскрипционной терминации является белок Rho (ρ) E. coli.
Protein signal which causes the release of transcribed RNA at a stop codon
In molecular biology, a termination factor is a protein that mediates the termination of RNA transcription by recognizing a transcription terminator and causing the release of the newly made mRNA. This is part of the process that regulates the transcription of RNA to preserve gene expression integrity and are present in both eukaryotes and prokaryotes, although the process in bacteria is more widely understood. The most extensively studied and detailed transcriptional termination factor is the Rho (ρ) protein of E. coli.
Прокариотические
Прокарионы используют один тип РНК-полимеразы, транскрибируя мРНК, которые кодируют более одного типа белка. Транскрипция, трансляция и деградация мРНК происходят одновременно. Окончание транскрипции имеет важное значение для определения границ в транскрипционных единицах, функция, необходимая для поддержания целостности нитей и обеспечения контроля качества. Терминация в E. coli может быть зависимой от Rho, используя фактор Rho, или независимой от Rho, также известной как внутренняя терминация. Хотя большинство оперонов в ДНК независимы от Rho, зависимое от Rho окончание также важно для поддержания правильной транскрипции. Когда белок Rho достигает комплекса РНК-полимеразы, транскрипция прекращается путем диссоциации РНК-полимеразы от ДНК. Структура и активность белка Rho аналогичны структуре и активности подединицы F1 АТФ-синтазы, что подтверждает теорию об эволюционной связи между ними. подавление антисмысловых транскрипций и разрешение конфликтов, которые возникают между транскрипцией и репликацией. Процесс терминации фактором Rho регулируется механизмами ослабления и антитерминации, конкурирующими с факторами удлинения для перекрывающихся мест использования (рут и орехи), и зависит от того, насколько быстро Rho может двигаться во время транскрипции, чтобы догнать РНК-полимеразу и активировать процесс терминации. Ингибирование роо-зависимой терминации бицикломицином используется для лечения бактериальных инфекций. Использование этого механизма вместе с другими классами антибиотиков изучается как способ борьбы с устойчивостью к антибиотикам, путем подавления защитных факторов в транскрипции РНК, работая в синергии с другими ингибиторами экспрессии генов, такими как тетрациклин или рифампицин.
Prokaryotes use one type of RNA polymerase, transcribing mRNAs that code for more than one type of protein. Transcription, translation and mRNA degradation all happen simultaneously. Transcription termination is essential to define boundaries in transcriptional units, a function necessary to maintain the integrity of the strands and provide quality control. Termination in E. coli may be Rho dependent, utilizing Rho factor, or Rho independent, also known as intrinsic termination. Although most operons in DNA are Rho independent, Rho dependent termination is also essential to maintain correct transcription. When the Rho protein reaches the RNA polymerase complex, transcription is terminated by dissociation of the RNA polymerase from the DNA. The structure and activity of the Rho protein is similar to that of the F1 subunit of ATP synthase, supporting the theory that the two share an evolutionary link. suppressing antisense transcriptions and resolving conflicts that happen between transcription and replication. The process of termination by Rho factor is regulated by attenuation and antitermination mechanisms, competing with elongation factors for overlapping utilization sites (ruts and nuts), and depends on how fast Rho can move during the transcription to catch up with the RNA polymerase and activate the termination process. Inhibition of Rho dependent termination by bicyclomycin is used to treat bacterial infections. The use of this mechanism along with other classes of antibiotics is being studied as a way to address antibiotic resistance, by suppressing the protective factors in RNA transcription while working in synergy with other inhibitors of gene expression such as tetracycline or rifampicin.
Эукариотические
Процесс транскрипционной терминации менее понятен у эукариотов, которые имеют обширную обработку посттранскрипционной РНК, и каждый из трех типов эукариотической РНК-полимеразы имеет другую систему терминации. В РНК-полимеразе I, конечном факторе транскрипции, РНК-полимераза I связывается вниз по течению с предварительными кодирующими областями РНК, вызывая диссоциацию РНК-полимеразы от шаблона и высвобождение новой нити РНК. В РНК-полимеразе II терминация происходит через полиаденолирование/кливирование. 3-х футовый хвост на конце нити связан с полиаденолированным участком, но нить будет продолжать кодировать. Новые синтезированные рибонуклеотиды удаляются по одному фактором расщепления CSTF и CPSF, в процессе, который до сих пор не полностью изучен. Остаток нити отключается 5'-экзонуклеазой, когда транскрипция завершена. РНК-полимераза III прекращает свое действие после серии остатков полимеризации урацила в транскрибированной мРНК.
The process of transcriptional termination is less understood in eukaryotes, which have extensive post transcriptional RNA processing, and each of the three types of eukaryotic RNA polymerase have a different termination system. In RNA polymerase I, Transcription termination factor, RNA polymerase I binds downstream of the pre rRNA coding regions, causing the dissociation of the RNA polymerase from the template and the release of the new RNA strand. In RNA polymerase II, the termination occurs via a polyadenylation/cleaving complex. The 3' tail on the ending of the strand is bound at the polyadenylation site, but the strand will continue to code. The newly synthesised ribonucleotides are removed one at a time by the cleavage factors CSTF and CPSF, in a process that is still not fully understood. The remainder of the strand is disengaged by a 5′ exonuclease when the transcription is finished. RNA polymerase III terminates after a series of uracil polymerization residues in the transcribed mRNA.