Введение
Белокодирующий ген вида Homo sapiens Дезоксирибонуклеаза I (обычно называемая DNase I) является эндонуклеазой семейства DNase, кодируемой геном человека DNASE1. DNase I - это нуклеаза, которая расщепляет ДНК предпочтительно на фосфодиэстерных связях, прилегающих к пиримидиновому нуклеотиду, давая 5'-фосфатные полинуклеотиды с свободной гидроксильной группой на позиции 3', в среднем производя тетрануклеотиды. Он действует на одноцепочечную ДНК, двойную ДНК и хроматин. В дополнение к своей роли в качестве эндонуклеазы для обращения с отходами, предполагается, что она является одной из дезоксирибонуклеаз, ответственных за фрагментацию ДНК во время апоптоза. DNase I связывается с цитоскелетным белком актина. Он связывает мономеры актина с очень высокой (субнаномолярной) аффинностью и полимеры актина с более низкой аффинностью. Функция этого взаимодействия неясна. Однако, поскольку актин-связанная DNase I является ферментативно неактивной, актин-комплекс DNase может быть формой хранения DNase I, которая предотвращает повреждение генетической информации. Этот белок хранится в гранулах зимогена ядерной оболочки и функционирует путем расщепления ДНК эндонуклеотическим способом. Охарактеризовано по меньшей мере шесть аутосомных кодоминантных аллелей гена DNASE 1, DNASE1*1 до DNASE1*6, и последовательность DNASE1*2 представлена в этом документе. Мутации в этом гене, а также фактор инактивации его фермента, были связаны с системной красным волчанкой (СЛЭ), аутоиммунным заболеванием. Рекомбинантная форма этого белка используется для лечения одного из симптомов муковисцидоза путем гидролиза внеклеточной ДНК в мокроте и снижения ее вязкости. Были замечены альтернативные варианты транскрипционного сплайса этого гена, но они не были полностью охарактеризованы.
Deoxyribonuclease I (usually called DNase I), is an endonuclease of the DNase family coded by the human gene DNASE1. DNase I is a nuclease that cleaves DNA preferentially at phosphodiester linkages adjacent to a pyrimidine nucleotide, yielding 5' phosphate terminated polynucleotides with a free hydroxyl group on position 3', on average producing tetranucleotides. It acts on single stranded DNA, double stranded DNA, and chromatin. In addition to its role as a waste management endonuclease, it has been suggested to be one of the deoxyribonucleases responsible for DNA fragmentation during apoptosis. DNase I binds to the cytoskeletal protein actin. It binds actin monomers with very high (sub nanomolar) affinity and actin polymers with lower affinity. The function of this interaction is unclear. However, since actin bound DNase I is enzymatically inactive, the DNase actin complex might be a storage form of DNase I that prevents damage of the genetic information. This protein is stored in the zymogen granules of the nuclear envelope and functions by cleaving DNA in an endonucleolytic manner. At least six autosomal codominant alleles of the gene DNASE 1 have been characterized, DNASE1*1 through DNASE1*6, and the sequence of DNASE1*2 represented in this record. Mutations in this gene, as well as factor inactivating its enzyme product, have been associated with systemic lupus erythematosus (SLE), an autoimmune disease. A recombinant form of this protein is used to treat one of the symptoms of cystic fibrosis by hydrolyzing the extracellular DNA in sputum and reducing its viscosity. Alternate transcriptional splice variants of this gene have been observed but have not been thoroughly characterized.
Специфика последовательности DNase I
Недавно сообщалось, что DNase I показывает некоторые уровни специфичности последовательности, которые могут зависеть от экспериментальных условий. В отличие от других ферментов, которые имеют высокую специфичность субстрата, DNase I, безусловно, не расщепляет с абсолютной специфичностью последовательности. Однако расщепление в местах, содержащих C или G на их 3'-конце, менее эффективно.