Введение

Высокочастотная рекомбинантная клетка (клетка Hfr) (также называемая штаммом Hfr) — это бактерия, содержащая конъюгативную плазмиду (например, F-фактор), интегрированную в её хромосомную ДНК. Интеграция плазмиды в хромосому клетки происходит посредством гомологичной рекомбинации. Конъюгативная плазмида, способная к интеграции в хромосому, также называется эписомой (сегмент ДНК, который может существовать как плазмида или быть интегрированным в хромосому). При конъюгации Hfr-клетки очень эффективно передают хромосомные гены в реципиентные F−-клетки, не содержащие эписому.

История

Штамм Hfr был впервые охарактеризован Лукой Кавалли Сфорца. Уильям Хейс также независимо изолировал другой штамм Hfr.

Передача хромосомы бактерии клетками Hfr

Клетка Hfr может передавать часть бактериального генома. Несмотря на то, что F-фактор клеток Hfr интегрирован в хромосомную ДНК бактерии, он все еще способен инициировать конъюгативный перенос, не вырезаясь предварительно из бактериальной хромосомы. Благодаря присущей F-фактору склонности к самопередаче во время конъюгации, остальная часть бактериального генома переносится вместе с ним. Таким образом, в отличие от обычной клетки F+, штаммы Hfr стремятся передать всю свою ДНК через конъюгационный мост, подобно обычной конъюгации. В типичной конъюгации клетка-реципиент также становится F+ после конъюгации, поскольку получает полную копию плазмиды F-фактора; однако, в конъюгации, опосредованной клетками Hfr, этого не происходит. Из-за большого размера бактериальной хромосомы, полный перенос хромосомы в клетку F− крайне редок, поскольку для поддержания физического контакта между клетками требуется слишком много времени. Следовательно, поскольку конъюгативный перенос не завершается (кольцевая структура плазмиды и бактериальной хромосомы требует полного переноса для передачи F-фактора, так как он может быть разрезан в середине), клетки-реципиенты F− не получают полную последовательность F-фактора и не становятся F+, поскольку не могут сформировать половой пилюс.

Техника прерывания спаривания

При конъюгации, опосредованной клетками Hfr, передача ДНК начинается в точке начала передачи (oriT), расположенной в пределах F-фактора, и затем продолжается по часовой стрелке или против часовой стрелки в зависимости от ориентации F-фактора в хромосоме. Следовательно, длина хромосомной ДНК, переносимой в F−-клетку, пропорциональна времени, в течение которого происходит конъюгация. Это приводит к последовательной передаче генов на бактериальной хромосоме. Бактериальные генетики используют этот принцип для картирования генов на бактериальной хромосоме. Эта техника называется прерванным спариванием, поскольку генетики позволяют конъюгации происходить в течение различных периодов времени, прежде чем остановить ее с помощью высокоскоростного блендера. Используя штаммы Hfr и F−, один из которых несет мутации в нескольких генах, каждый из которых влияет на метаболическую функцию или вызывает устойчивость к антибиотикам, и исследуя фенотип клеток-реципиентов на селективных агарных пластинах, можно определить, какие гены переносятся в клетки-реципиенты первыми и, следовательно, находятся ближе к последовательности oriT на хромосоме.

Клетка F-простейшего числа

F-прайм клетка содержит плазмиду F, которая интегрируется в хромосомную ДНК и выносит с собой часть хромосомной ДНК при вырезании из хромосомы. Таким образом, F-прайм плазмида – это плазмида, содержащая часть хромосомной ДНК, которая может быть передана клетке-реципиенту вместе с плазмидой в процессе конъюгации.