Ағылшыншамен салыстырыңыз: абзацты басыңыз — түпнұсқа терезеде ашылады. Абзац астындағы EN түймесі оны мәтін ішінде көрсетеді.
Мазмұны
Кіріспе
Эукариоттар мен археяларда геннің транскрипциясына қажетті ақуыздар кешені.
Complex of proteins necessary for gene transcription in eukaryotes and archaea
Преинициациялық кешен (қысқартылған PIC) – эукариоттар мен археяларда ақуызды кодтайтын гендердің транскрипциясына қажетті, шамамен 100 ақуыздан тұратын кешен. Преинициациялық кешен РНК полимераза II (Pol II) - ні ген транскрипциясының басталу орындарында орналастырады, ДНК-ны денатурациялайды және ДНК-ны РНК полимераза II активті орталығында транскрипция үшін позициялайды. Минималды PIC РНК полимераза II және алты жалпы транскрипция факторын қамтиды: TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF және TFIIH. Қосымша реттегіш кешендер (мысалы, медиатор коактиваторы және хроматин қайта құру кешендері) де PIC құрамына кіруі мүмкін. Преинициациялық кешендер РНК полимераза I және РНК полимераза III транскрипциясы барысында да қалыптасады.
The preinitiation complex (abbreviated PIC) is a complex of approximately 100 proteins that is necessary for the transcription of protein coding genes in eukaryotes and archaea. The preinitiation complex positions RNA polymerase II (Pol II) at gene transcription start sites, denatures the DNA, and positions the DNA in the RNA polymerase II active site for transcription. The minimal PIC includes RNA polymerase II and six general transcription factors: TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, and TFIIH. Additional regulatory complexes (such as the mediator coactivator and chromatin remodeling complexes) may also be components of the PIC. Preinitiation complexes are also formed during RNA Polymerase I and RNA Polymerase III transcription.
Археяларда
Археялар Pol II PIC-тің минималдастырылған нұсқасына ұқсас алдын ала бастау кешеніне ие, оған TBP және Археал транскрипция факторы B (TFB, TFIIB гомологы) кіреді. Құрастыру TBP-нің промоторға байланысуымен басталатын ұқсас реттілікпен жүреді. Қызықтысы, бүкіл кешен эукариоттық ПИК-тегілерге қарағанда кері бағытта байланысқан. Олар сонымен қатар транскрипцияны бастауға көмектесетін, бірақ міндетті емес TFIIE гомологы TFE-ді пайдаланады.
Archaea have a preinitiation complex resembling that of a minimized Pol II PIC, with a TBP and an Archaeal transcription factor B (TFB, a TFIIB homolog). The assembly follows a similar sequence, starting with TBP binding to the promoter. An interesting aspect is that the entire complex is bound in an inverse orientation compared to those found in eukaryotic PIC. They also use TFE, a TFIIE homolog, which assists in transcription initiation but is not required.
РНК полимераза I (Pol I)
Pol I преинициациялық кешенін қалыптастыру үшін селективті фактор 1 (SL1 немесе TIF IB) rDNA промотордың негізгі элементіне байланысуы керек. SL1 – TBP және кем дегенде үш TBP-мен байланысты факторлардан (TAF) тұратын кешен. Транскрипцияның базалық деңгейлері үшін тек SL1 және RRN3 байланысуымен сипатталатын Pol I (Pol Iβ) транскрипцияға қабілетті формасы ғана қажет. Транскрипция деңгейі жоғары болғанда UBTF (UBF) да қажет. UBTF димер ретінде rDNA промотордың жоғары ағыстағы бақылау элементіне (UCE) және негізгі элементіне байланысып, ДНК-ны иіп, энхансеосоманы қалыптастырады.
Formation of the Pol I preinitiation complex requires the binding of selective factor 1 (SL1 or TIF IB) to the core element of the rDNA promoter. SL1 is a complex composed of TBP and at least three TBP associated factors (TAFs). For basal levels of transcription, only SL1 and the initiation competent form of Pol I (Pol Iβ), characterized by RRN3 binding, are required. For activated transcription levels, UBTF (UBF) is also required. UBTF binds as a dimer to both the upstream control element (UCE) and core element of the rDNA promoter, bending the DNA to form an enhanceosome.
РНК полимераза III (Pol III)
Pol III үш бастау класына ие, олар әртүрлі бақылау элементтерін танитын әртүрлі факторлармен басталады, бірақ барлығы TFIIIB-ге (TFIIB TBP-ге ұқсас; TBP/TRF, TFIIB-ге байланысты фактор және B″ бөлігінен тұрады) жиналып, Pol III алдын ала бастау кешенін құрайды. Жалпы құрылымы Pol II-ге ұқсас. Ұзарту кезінде тек TFIIIB ғана бекітіліп тұруы керек.
Pol III has three classes of initiation, which start with different factors recognizing different control elements but all converging on TFIIIB (similar to TFIIB TBP; consists of TBP/TRF, a TFIIB related factor, and a B″ unit) recruiting the Pol III preinitiation complex. The overall architecture resembles that of Pol II. Only TFIIIB needs to remain attached during elongation.