Аморфея: Таксономия и эволюция одноклеток и многоклеточных эукариот.
Amorphea
Аморфея: новая классификация протистов, включающая грибы, животных и простейших. Обновлённая таксономия, филогенез и предложенные филумы Сулькозоа и Варисулька.
Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Группа, включающая грибы, животных и различные простейшие
Group including fungi, animals and various protozoa
Аморфеи
Amorphea
Международное общество протестологов, признанный орган по таксономии простейших, рекомендовало в 2012 году заменить термин "Униконт" на "Аморфеи", поскольку название "Униконт" основано на гипотетической синапоморфии, которую авторы ISOP и другие ученые впоследствии отвергли. В эту группу входят амебозои, опистоконты и апусомонады.
The International Society of Protistologists, the recognised body for taxonomy of protozoa, recommended in 2012 that the term Unikont be changed to Amorphea because the name "Unikont" is based on a hypothesized synapomorphy that the ISOP authors and other scientists later rejected. It includes amoebozoa, opisthokonts, and Apusomonada.
Таксономические изменения в этой группе
Томас Кавалье-Смит предложил два новых типа: Sulcozoa, который состоит из подтипов Apusozoa (Apusomonadida и Breviatea), и Varisulca, который включает в себя подтипы Diphyllatea, Discocelida, Mantamonadidae, Planomonadida и Rigifilida. Последующие работы Кавалье-Смита показали, что Sulcozoa является парафилетической группой. Apusozoa также представляется парафилетической. Varisulca была переопределена для включения планомонадов, Mantamonas и Collodictyon. Для планомонадов и Mantamonas был создан новый таксон – Glissodiscea. Подтверждение обоснованности этой пересмотренной таксономии пока требуется. Amoebozoa, по-видимому, монофилетична и имеет две основные ветви: Conosa и Lobosa. Conosa разделена на аэробный инфратип Semiconosia (Mycetozoa и Variosea) и вторично анаэробные Archamoebae. Lobosa состоит исключительно из нежгутиковых амёб группы Lobosa и разделена на два класса: Discosea, характеризующиеся плоскими клетками, и Tubulinea, имеющие преимущественно трубчатые псевдоподии.
Thomas Cavalier Smith proposed two new phyla: Sulcozoa, which consists of the subphyla Apusozoa (Apusomonadida and Breviatea), and Varisulca, which includes the subphyla Diphyllatea, Discocelida, Mantamonadidae, Planomonadida and Rigifilida. Further work by Cavalier Smith showed that Sulcozoa is paraphyletic. Apusozoa also appears to be paraphyletic. Varisulca has been redefined to include planomonads, Mantamonas and Collodictyon. A new taxon has been created Glissodiscea for the planomonads and Mantamonas. Again, the validity of this revised taxonomy awaits confirmation. Amoebozoa seems to be monophyletic with two major branches: Conosa and Lobosa. Conosa is divided into the aerobic infraphylum Semiconosia (Mycetozoa and Variosea) and secondarily anaerobic Archamoebae. Lobosa consists entirely of non flagellated lobose amoebae and has been divided into two classes: Discosea, which have flattened cells, and Tubulinea, which has predominantly tube shaped pseudopodia.
Клейд
Группа включает эукариотические клетки, которые в основном имеют один выходящий флагеллум или являются амебами, не имеющими флагеллумов. Униканты включают опистоконтов (животных, грибов и родственные формы) и амебозоа. В отличие от них, другие хорошо известные группы эукариот, которые чаще имеют два выходящих флагеллума (хотя и существует множество исключений), обычно называются биконтами. Биконты включают Archaeplastida (растения и их родственники) и супергруппу SAR, а также Cryptista, Haptista, Telonemia и picozoa.
The group includes eukaryotic cells that, for the most part, have a single emergent flagellum, or are amoebae with no flagella. The unikonts include opisthokonts (animals, fungi, and related forms) and Amoebozoa. By contrast, other well known eukaryotic groups, which more often have two emergent flagella (although there are many exceptions), are often referred to as bikonts. Bikonts include Archaeplastida (plants and relatives) and SAR supergroup, the Cryptista, Haptista, Telonemia and picozoa.
Характеристики
Униканты обладают тройным слиянием генов, отсутствующим у биконтов. Три гена, объединенных в уникантах, но не встречающихся у бактерий или биконтов, кодируют ферменты, необходимые для синтеза пиримидиновых нуклеотидов: карбамоилфосфатсинтазу, дигидроротазу и аспартаткарбамоилтрансферазу. Это потребовало двойного слияния – редкого сочетания событий, что подтверждает общее происхождение Opisthokonta и Amoebozoa. Кавалье-Смит первоначально предположил, что предки уникантов имели один жгутик и одно базальное тельце. Однако это маловероятно, поскольку у жгутиковых опистоконтов, а также у некоторых жгутиковых амебозоев, включая Breviata, фактически два базальных тельца, как и у типичных "биконтов" (хотя у большинства уникантов флагеллирован только один из них). Такое парное расположение также наблюдается в организации центриолей в типичных клетках животных. Несмотря на название группы, общим предком всех "уникантов", вероятно, была клетка с двумя базальными тельцами.
The unikonts have a triple gene fusion that is lacking in the bikonts. The three genes that are fused together in the unikonts, but not bacteria or bikonts, encode enzymes for synthesis of the pyrimidine nucleotides: carbamoyl phosphate synthase, dihydroorotase, aspartate carbamoyltransferase. This must have involved a double fusion, a rare pair of events, supporting the shared ancestry of Opisthokonta and Amoebozoa. Cavalier Smith originally proposed that unikonts ancestrally had a single flagellum and single basal body. This is unlikely, however, as flagellated opisthokonts, as well as some flagellated Amoebozoa, including Breviata, actually have two basal bodies, as in typical 'bikonts' (even though only one is flagellated in most unikonts). This paired arrangement can also be seen in the organization of centrioles in typical animal cells. In spite of the name of the group, the common ancestor of all 'unikonts' was probably a cell with two basal bodies.