Введение
Класс вирусов Caudoviricetes — это класс вирусов, известных как хвостовые бактериофаги (cauda — латинское слово, означающее «хвост»). В соответствии с классификацией Балтимора, Caudoviricetes относятся к группе I вирусов, поскольку содержат двухцепочечную ДНК (dsDNA) геном, длина которого может варьироваться от 18 000 до 500 000 пар оснований. Вирусные частицы имеют характерную форму: каждый вирион состоит из икосаэдрической головки, содержащей вирусный геном, и гибкого хвоста, соединенных посредством коннекторного белка.
Caudoviricetes is a class of viruses known as the tailed bacteriophages (cauda is Latin for "tail"). Under the Baltimore classification scheme, the Caudoviricetes are group I viruses as they have double stranded DNA (dsDNA) genomes, which can be anywhere from 18,000 base pairs to 500,000 base pairs in length. The virus particles have a distinct shape; each virion has an icosahedral head that contains the viral genome, and is attached to a flexible tail by a connector protein.
Инфекция
При встрече с бактерией-хозяином хвостовая часть вириона связывается с рецепторами на поверхности клетки и доставляет ДНК в клетку с помощью инъекциозного механизма (инъекциозный аппарат – это наномашина, эволюционировавшая для доставки белков посредством секреции типа III). Хвостовая часть вируса пробивает отверстие в бактериальной клеточной стенке и плазматической мембране, и геном проходит по хвосту внутрь клетки. Попав внутрь, гены экспрессируются из транскриптов, созданных клеточными механизмами хозяина, с использованием рибосом хозяина. Обычно геном реплицируется с помощью конкатемеров, при которых синтезируются перекрывающиеся фрагменты ДНК, а затем они соединяются, формируя полный геном. Siphoviridae составляют большинство известных хвостовых вирусов. Брэдли называл Myoviridae типом А, Siphoviridae типом В и Podoviridae типом С. Он также разделил свои группы на основе морфологии головки: в группе А, А1 имеют небольшие изометрические головки; А2 – пролатные головки; и А3 – удлиненные головки. В группах B и C номера были присвоены аналогично: B1 и C1 имеют небольшие изометрические головки; B2 и C2 – пролатные головки; а B3 и C3 – удлиненные головки. Поскольку "семейства" Myoviridae, Podoviridae и Siphoviridae были упразднены из-за полифилетического происхождения, в настоящее время в классе существует множество неклассифицированных семейств, подсемейств и родов, не имеющих предшествующих таксонов выше Caudoviricetes. В настоящее время в классе насчитывается 7 отрядов, 63 семейства, 109 подсемейств, 1360 родов и 4079 видов. В этой статье перечислены все официальные и предлагаемые таксоны Caudoviricetes. (Примечание: кавычки указывают на то, что таксон предложен и еще не ратифицирован ICTV.)
Эволюция бактериофагов
Бактериофаги обнаружены более чем в 1100 родах бактерий или архей.