Введение

Полиморфизм амплифицированных фрагментов длины (AFLP PCR или AFLP) – это инструмент, основанный на ПЦР, который используется в генетических исследованиях, ДНК-дактилоскопии и в практике генетической инженерии. Разработанный в начале 1990-х годов компанией KeyGene, AFLP использует рестрикционные ферменты для расщепления геномной ДНК, за которым следует лигация адаптеров к липким концам рестрикционных фрагментов. Затем выбирается подмножество рестрикционных фрагментов для амплификации. Этот отбор достигается с помощью праймеров, комплементарных последовательности адаптера, последовательности рестрикционного сайта и нескольких нуклеотидов внутри рестрикционных фрагментов (как подробно описано ниже). Амплифицированные фрагменты разделяются и визуализируются при денатурации с помощью электрофореза в агарозном геле, либо посредством авторадиографии или флуоресцентных методик, либо с использованием автоматизированных капиллярных секвенаторов. Хотя AFLP не следует использовать как аббревиатуру, его часто называют "полиморфизмом амплифицированных фрагментов длины". Однако полученные данные не оцениваются как полиморфизмы длины, а вместо этого – как полиморфизмы по наличию и отсутствию. AFLP PCR – это высокочувствительный метод для выявления полиморфизмов в ДНК. Метод был впервые описан Восом и Забео в 1993 году, но он также способен амплифицировать от 50 до 100 фрагментов одновременно. Кроме того, для амплификации не требуется предварительной информации о последовательности (Meudt & Clarke 2007). В результате AFLP стал чрезвычайно полезным в изучении таксонов, включая бактерии, грибы и растения, где многое до сих пор неизвестно о геномном составе различных организмов. Технология AFLP защищена патентами и патентными заявками Keygene N. V. AFLP является зарегистрированным товарным знаком Keygene N. V.