Введение
Должность вице-президента Республики Бурунди была учреждена в июне 1998 года, когда вступила в силу переходная конституция. Она заменила должность премьер-министра.
Переходный период (1998-2001)
Пьер Буйоя, бывший президент (1987–1993), пришедший к власти в результате военного переворота 1996 года, был приведен к присяге в качестве президента Республики 11 июня 1998 года. Он назначил Фредерика Бамвугиньюмиру, этнического хуту и члена Фронта за демократию в Бурунди (FRODEBU), первым вице-президентом. Матиас Синаменье, этнический тутси и член партии Буйоя "Союз за национальный прогресс" (UPRONA), был назначен вторым вице-президентом. Согласно переходной конституции, пост вице-президента состоял из двух должностей: первый вице-президент (ответственный за политические и административные вопросы) и второй вице-президент (ответственный за экономические и социальные вопросы).
Переходный период (20012005)
1 ноября 2001 года вступило в должность новое переходное правительство, осуществляющее совместное управление страной. Временный президент Пьер Буйоя стал переходным президентом сроком на 18 месяцев. По истечении его полномочий в 2003 году, вице-президент хуту Домитьен Ндайзие вступил в должность и назначил тутси (Альфонса Мари Кадеге) вице-президентом. В ноябре 2004 года Кадеге был освобожден от должности вице-президента и заменен Фредериком Нгензебухоро. Хотя срок полномочий Ндайзие должен был завершиться в конце 2004 года после проведения выборов, переходный период был продлен, а запланированные выборы – отложены. Выборы состоялись в середине 2005 года, и переходный период должен завершиться 26 августа 2005 года, когда вновь избранный президент вступит в должность.
Вице-президентство 2005-2018
Новая конституция Бурунди, утвержденная 28 февраля 2005 года на конституционном референдуме, предусматривает коллегиальную должность вице-президента, состоящую из двух человек (аналогично переходному периоду). Первый вице-президент будет отвечать за политические и административные вопросы, а второй вице-президент – за социальные и экономические вопросы. Один из вице-президентов должен быть хуту, а другой – тутси. Кандидатуры должны быть одобрены обеими палатами парламента для вступления в должность. 29 августа 2005 года президент Пьер Нкурунзиза выдвинул кандидатуры Мартина Ндуимана и Элис Нзомукунды на должности первого и второго вице-президентов. Оба получили одобрение парламента и были немедленно приведены к присяге. Нзомукунда подала в отставку 5 сентября 2006 года. Два дня спустя ее заменила Марина Барампама. В феврале 2007 года Барампаму заменил Габриэль Нтисезерана. В ноябре 2007 года Ндуимана был заменен Ивесом Сахингуву. В августе 2010 года Сахингуву был заменен Теренсом Синунгурузой, а Нтисезерана – Гервайсом Руфикири.
Вице-президент с 2018 года
Новые конституционные поправки были одобрены на конституционном референдуме 17 мая 2018 года. Должность второго вице-президента будет упразднена. Единственный оставшийся вице-президент, полномочия которого будут ограничены, будет выбран из политической партии и этнической группы, отличной от тех, к которым принадлежит Президент.