Введение
Международный кодекс номенклатуры прокариотов (ICNP) или Прокариотический кодекс, ранее Международный кодекс номенклатуры бактерий (ICNB) или Бактериологический кодекс (BC), регулирует научные названия бактерий и архей. Он устанавливает правила наименования таксонов бактерий в соответствии с их относительным рангом и является одним из кодексов номенклатуры в биологии. Изначально Международный кодекс ботанической номенклатуры применялся и к бактериям, что отражалось в его содержании до исключения соответствующих положений на Международном ботаническом конгрессе 1975 года. Первый кодекс номенклатуры бактерий был утвержден на 4-м Международном конгрессе по микробиологии в 1947 году, но впоследствии был отменен. Последнее издание в виде книги – Ревизия 1990 года, однако она не отражает действующие правила. Ревизии 2008 и 2022 годов опубликованы в Международном журнале систематической и эволюционной микробиологии (IJSEM), начиная с 1980 года. Новые названия бактерий рассматриваются Международным комитетом по систематике прокариотов (ICSP) на предмет соответствия правилам номенклатуры и публикуются в IJSEM.
The International Code of Nomenclature of Prokaryotes (ICNP) or Prokaryotic Code, formerly the International Code of Nomenclature of Bacteria (ICNB) or Bacteriological Code (BC), governs the scientific names for Bacteria and Archaea. It denotes the rules for naming taxa of bacteria, according to their relative rank. As such it is one of the nomenclature codes of biology. Originally the International Code of Botanical Nomenclature dealt with bacteria, and this kept references to bacteria until these were eliminated at the 1975 International Botanical Congress. An early Code for the nomenclature of bacteria was approved at the 4th International Congress for Microbiology in 1947, but was later discarded. The latest version to be printed in book form is the 1990 Revision, but the book does not represent the current rules. The 2008 and 2022 Revisions have been published in the International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM). with a starting point of 1980. New bacterial names are reviewed by the ICSP as being in conformity with the Rules of Nomenclature and published in the IJSEM.
Цианобактерии
С 1975 года большинство бактерий регулировалось бактериологическим кодексом. Однако цианобактерии по-прежнему регулировались ботаническим кодексом. Начиная с 1999 года, цианобактерии регулировались как ботаническим, так и бактериологическим кодексами. Эта ситуация создавала номенклатурные проблемы для цианобактерий. К 2020 году было предложено три варианта решения: исключить цианобактерии из сферы действия бактериологического кодекса, применять бактериологический кодекс ко всем цианобактериям или считать действительные публикации, сделанные в соответствии с ботаническим кодексом, действительными и в соответствии с бактериологическим кодексом. В 2021 году ICSP провел официальное голосование по этим трем вариантам, и был выбран третий.
Exclude cyanobacteria from the bacteriological code. Apply the bacteriological code to all cyanobacteria. Treat valid publication under the botanical code as valid publication under the bacteriological code. In 2021, the ICSP held a formal vote on the three proposals and the third option was chosen.
Тип штамма
С 2001 года при описании нового бактериального или археального вида необходимо выделять типовой штамм. Типовой штамм – это живая культура, с которой формально связывается научное название данного организма. Для действительной публикации названия нового вида типовой штамм должен быть депонирован в публичную коллекцию культур как минимум в двух разных странах. До 2001 года вид можно было типифицировать также с помощью описания, сохраненного образца или иллюстрации. Если прокариотический вид невозможно культивировать в лаборатории (и, следовательно, депонировать в коллекции культур), ему может быть присвоено предварительное название *candidatus*, но оно не считается действительным образом опубликованным.
Версии
Бьюкенен, Р. Э., и Ральф Сент-Джон Брукс. (1947, июнь) (Редакторы). Предлагаемый бактериологический кодекс номенклатуры. Разработан на основе предложений, одобренных Международным комитетом по бактериологической номенклатуре на заседании Третьего международного конгресса по микробиологии. Публикация разрешена на пленарном заседании, с. 61. Iowa State College Press, Эймс, Айова. США. Hathi Trust. Переиздание 1949 г., Journal of General Microbiology 3, 444–462. Международный комитет по бактериологической номенклатуре. (1958, июнь). Международный кодекс номенклатуры бактерий и вирусов. Эймс, Iowa State College Press. BHL. Лапаж, С. П., Снейт, П. Х. А., Лессел, Э. Ф., Скерман, В. Б. Д., Зеелигер, Х. П. Р. и Кларк, У. А. (1975). Международный кодекс номенклатуры бактерий. Ревизия 1975 года. American Society for Microbiology, Вашингтон, Округ Колумбия. Лапаж, С. П., Снейт, П. Х. А., Лессел, Э. Ф., Скерман, В. Б. Д., Зеелигер, Х. П. Р. и Кларк, У. А. (1992). Международный кодекс номенклатуры бактерий. Бактериологический кодекс. Ревизия 1990 года. American Society for Microbiology, Вашингтон, Округ Колумбия. Паркер, К. Т., Тиндалл, Б. Дж. и Гаррити, Г. М., редакторы. (2019). Международный кодекс номенклатуры прокариот. Кодекс прокариот (ревизия 2008 года). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 69(1A): S1–S111. doi: 10.1099/ijsem.0.000778.
Lapage, S. P., Sneath, P. H. A., Lessel, E. F., Skerman, V. B. D., Seeliger, H. P. R. & Clark, W. A. (1992). International Code of Nomenclature of Bacteria. Bacteriological Code. 1990 Revision. American Society for Microbiology, Washington, D. C. link. Parker, C. T., Tindall, B. J. & Garrity, G. M., eds. (2019). International Code of Nomenclature of Prokaryotes. Prokaryotic Code (2008 Revision). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 69(1A): S1–S111. doi: 10.1099/ijsem.0.000778