Введение
Вид одноклеточного организма Phaeodactylum tricornutum - диатомия. В отличие от других диатомовых водорослей, P. tricornutum может существовать в разных морфотипах (фузиформных, трирадиатных и овальных), а изменения в форме клетки могут стимулироваться условиями окружающей среды. Эта особенность может быть использована для изучения молекулярной основы контроля формы клетки и морфогенеза. В отличие от большинства диатомовых водорослей, P. tricornutum может расти в отсутствие кремния и может выживать без образования кремниевых фрустул. Это дает возможность для экспериментального исследования нанопроизводства на основе кремния в диатомовых водорослях. Еще одна особенность заключается в том, что во время бесполого размножения фрустулы не становятся меньше. Это позволяет непрерывно культивировать без необходимости полового размножения. Неизвестно, может ли P. tricornutum размножаться половым путем. На сегодняшний день не найдено никаких существенных доказательств, подтверждающих половое размножение в лаборатории или в других условиях. Хотя P. tricornutum можно считать атипичным пенообразным диатомом, это один из основных типов диатомов. Был разработан протокол трансформации, и векторы РНКи доступны. Это значительно облегчает молекулярно-генетические исследования.
Phaeodactylum tricornutum is a diatom. Unlike other diatoms, P. tricornutum can exist in different morphotypes (fusiform, triradiate, and oval) and changes in cell shape can be stimulated by environmental conditions. This feature can be used to explore the molecular basis of cell shape control and morphogenesis. Unlike most diatoms, P. tricornutum can grow in the absence of silicon and can survive without making silicified frustules. This provides opportunities for experimental exploration of silicon based nanofabrication in diatoms. Another peculiarity is that during asexual reproduction the frustules do not appear to become smaller. This allows continuous culture without need for sexual reproduction. It is not known if P. tricornutum can reproduce sexually. To date no substantial evidence has been found to support sexual reproduction in a laboratory or other setting. Although P. tricornutum can be considered to be an atypical pennate diatom, it is one of the main diatom model species. A transformation protocol has been established and RNAi vectors are available. This makes molecular genetic studies much easier.
История
Phaeodactylum tricornutum впервые был описан в трирадиатном морфотипе Болином в 1897 году. Записи первых культур P. tricornutum были опубликованы Алленом и Нельсоном в 1910 году, хотя он был ошибочно идентифицирован как Nitzschia colsterium, W. См., форма миунтиссимма. Изолят был позже корректно пересмотрен как P. tricorntum Дж. Этот штамм среди других поздних изолированных образцов все еще сохраняется в коллекциях культур по всему миру.
Секвенирование генома
Phaeodactylum tricornutum - одна из немногих диатомий, чей геном был секвенирован. По состоянию на 2023 год P. tricornutum является единственной диатомой, для которой существует сборка генома теломера к теломере. P. tricornutum - это диплоид с 25 парами ядерных хромосом. P. tricornutum стал потенциальным источником энергии микроводорослей. Он быстро растет, и липиды составляют около 20-30% его сухого веса клеток при стандартных условиях культивирования. Ограничение содержания азота может вызвать накопление нейтральных липидов в P. tricornutum, что указывает на возможные стратегии улучшения производства биодизельного топлива из микроводорослей.