Введение

Вид вируса Вирус африканской чумы свиней (ASFV) представляет собой крупный, двойной ниток ДНК-вирус из семейства Asfarviridae. Он не вызывает болезни у людей. ВПЧ является эндемическим в Африке к югу от Сахары и существует в дикой природе через цикл инфекции между клещами и дикими свиньями, кустарными свиньями и вартунами. Болезнь была впервые описана после того, как европейские поселенцы привезли свиней в районы, эндемичные для АЧС, и как таковые является примером возникающего инфекционного заболевания. ВПЧ реплицируется в цитоплазме инфицированных клеток. Это единственный вирус с двойным ДНК-геномом, который, как известно, передается членистоногими.

Вирусология

ASFV - это большой (175215 нм), икосаэдральный, двойной нитью ДНК вирус с линейным геномом 189 килобаз, содержащим более 180 генов. Количество генов немного отличается в разных изолятах вируса. ASFV имеет сходство с другими крупными ДНК-вирусами, например, с поксвирусом, иридовирусом и мимивирусом. Как и в случае с другими вирусными геморрагическими лихорадками, основными клетками-мишенями для репликации являются моноциты, макрофаги. Вхождение вируса в клетку-хозяина происходит через рецептор, но точный механизм эндоцитоза в настоящее время неясен. Вирус кодирует ферменты, необходимые для репликации и транскрипции его генома, включая элементы системы восстановления отсечения оснований, структурные белки и многие белки, которые не являются необходимыми для репликации в клетках, но вместо этого играют роль в выживании вируса и передаче в его хозяевах. Репликация вируса происходит в районах перинуклеарных заводов. Это очень организованный процесс, включающий по меньшей мере четыре стадии транскрипции: немедленно, рано, рано, промежуточно и поздно. Большая часть репликации и сборки происходит в дискретных перинуклеарных областях клетки, называемых вирусными фабриками, и, наконец, потомки вирионов переносятся на плазменную мембрану вдоль микротубулей, где они вырождаются или отталкиваются вдоль проецированных актина, чтобы заразить новые клетки. По мере прогрессирования вируса в течение его жизненного цикла большинство, если не все, органеллы клетки-хозяина модифицируются, адаптируются или в некоторых случаях разрушаются. Сборка икосаэдрической капсиды происходит на модифицированных мембранах из эндоплазматического сетчатки. Продукты из протеолитически обработанных полипротеинов образуют ядро, расположенное между внутренней мембраной и ядром нуклеопротеина. Дополнительная внешняя мембрана получается, когда частицы выходят из плазменной мембраны. Вирус кодирует белки, которые ингибируют сигнальные пути в инфицированных макрофагах и таким образом модулируют транскрипционную активацию генов иммунного ответа. Кроме того, вирус кодирует белки, которые ингибируют апоптоз инфицированных клеток для облегчения производства потомства вирионов. Вирусные мембранные белки с сходством с клеточными адгезионными белками модулируют взаимодействие инфицированных вирусом клеток и внеклеточных вирионов с компонентами хозяина. Все генотипы ASFV p72 циркулируют в восточной и южной Африке. В Европе, Южной Америке, Карибском бассейне и Западной Африке циркулирует генотип I. Генотип VIII встречается только в четырех странах Восточной Африки.

Эволюция

Считается, что вирус происходит от вируса мягкого клеща (род Ornithodoros), который заражает диких свиней, включая гигантских лесных свиней (Hylochoerus meinertzhageni), бородавок (Phacochoerus africanus) и свиней (Potamochoerus porcus). У этих диких хозяев инфекция обычно бессимптомна. Вирус, по-видимому, эволюционировал около 1700 года нашей эры. Эта дата подтверждается историческими записями. Свиньи были первоначально одомашнены в Северной Африке и Евразии. В Южную Африку они были завезены из Европы и Дальнего Востока португальцами (300 лет назад) и китайцами (600 лет назад). В конце XIX века после массовых потерь крупного рогатого скота в результате вспышки чумы крупного рогатого скота в родном регионе АЧС (Кения) началась масштабная свиноводческая промышленность. В 1904 году колонизаторы из Сейшельских островов и в 1905 году из Англии ввозили свиней в массовом порядке для разведения. В то время свиноводство было свободным. Первая вспышка АЧС была зарегистрирована в 1907 году.

Таксономия

У АСПВ нет близких родственников. Это единственный вид в роде Asfivirus, семействе Asfarviridae и порядке Asfuvirales. Каждый из этих трех таксонов, по крайней мере, частично назван в честь ASFV.

Признаки и симптомы

При острой форме болезни, вызванной высоковирусными штаммами, у свиней может развиться высокая температура, но в течение первых нескольких дней другие заметные симптомы не проявляются. Затем они постепенно теряют аппетит и впадают в депрессию. У свиней с белой кожей конечности становятся синьо-фиолетовыми, а кровотечения становятся заметными на ушах и брюшной полости. Группы инфицированных свиней лежат в сгущенном виде, дрожа, дышат неправильно, а иногда и кашляют. Если заставить их встать, они будут выглядеть неустойчивыми на ногах; это называется врожденным тремором типа А I у новорожденных поросят. Через несколько дней после заражения они впадают в коматозное состояние и умирают. У беременных свинок могут возникать спонтанные аборты. При легких инфекциях свиньи теряют вес, худеют, у них появляются признаки пневмонии, язвы кожи и отеки суставов.

Диагноз

Клинические симптомы инфекции ASFV очень похожи на симптомы классической чумы свиней, и эти два заболевания обычно должны быть различены лабораторной диагностикой. Диагностика обычно проводится с помощью ЭЛИСА, ПЦР в реальном времени или изоляции вируса из крови, лимфатических узлов, селезенки или сыворотки инфицированной свиньи. Национальная ассоциация свиней, отраслевой орган Великобритании, заявляет, что вирус может также передаваться при прямом или косвенном контакте с инфицированными свиньями, фекалиями или жидкостями тела. Поскольку вирус может выживать в течение 11 дней в свиных фекалиях и месяцев или лет в продуктах из свинины, ассоциация рекомендует принять строгие меры биологической безопасности для свиноводческих хозяйств, включая трехдневный карантин при въезде в Великобританию, и избегать как свиней, так и районов, где встречаются дикие кабаны.

Исследования вакцин

Вьетнам успешно произвел первую вакцину против африканской чумы свиней 1 июня 2022 года. Против евразийского изолированного штамма "Georgia07" экспериментальная вакцина, ослабленная путем удаления вируса I177L, разрабатывается в Соединенных Штатах с 22 января 2020 года. Эта экспериментальная вакцина была лицензирована как кандидат на вакцинацию с 3 января 2023 года.

История

Первая вспышка была ретроспективно признана произошедшей в 1907 году после того, как АЧС была впервые описана в 1921 году в Кении. Болезнь оставалась в Африке до 1957 года, когда о ней сообщили в Лиссабоне, Португалия. В 1960 году в Португалии произошла новая вспышка. После этих первоначальных вводов болезнь установилась на Пиренейском полуострове, а в 1980-х годах вспышки болезни случались в Франции, Бельгии и других европейских странах. В Испании и Португалии удалось искоренить болезнь к середине 1990-х годов посредством политики убоя. ВИЧ пересек Атлантический океан, и о вспышках заболевания сообщалось на некоторых Карибских островах, включая Испаньолу (Доминиканская Республика и Гаити). В результате Таможенная и пограничная служба США находится в состоянии повышенной готовности, чтобы предотвратить распространение в США, что нанесет ущерб промышленности свинины в стране на миллиарды долларов.

Куба

В 1971 году на Кубе произошла вспышка болезни, в результате которой были забиты 500 000 свиней, чтобы предотвратить общенациональную эпидемию животных. Организация ООН по продовольствию и сельскому хозяйству назвала вспышку "самым тревожным событием" 1971 года. Через шесть лет после этого события газета Newsday со ссылкой на неотслеживаемые источники утверждала, что антикастро-саботажники, по крайней мере, с молчаливой поддержкой чиновников Центрального разведывательного управления США, якобы завезли вирус африканской чумы свиней на Кубу за шесть недель до вспышки в 1971 году, чтобы дестабилизировать кубинскую экономику и поддержать внутреннюю оппозицию Фиделю Кастро. Вирус якобы был доставлен оперативникам с военной базы в зоне Панамского канала неназванным источником разведки США.

Европа

Впервые вирус АЧС был обнаружен в Европе в 1957 году, когда он был зафиксирован в Португалии. Оттуда она распространилась в Испанию и Францию. Несмотря на то, что были предприняты согласованные усилия по искоренению АЧС, такие как широкомасштабный убой и строительство современных сельскохозяйственных объектов, болезнь была искоренена только в 1990-х годах. В начале 2007 года в Грузии произошла вспышка, которая впоследствии распространилась на Армению, Азербайджан, Иран, Россию и Беларусь, что вызвало опасения, что АЧС может распространиться дальше по географическому направлению и оказать негативное экономическое воздействие на свиноводческую отрасль. Африканская чума свиней стала эндемичной в Российской Федерации с момента ее распространения на Северный Кавказ в ноябре 2007 года, скорее всего, в результате перемещения зараженных диких кабанов из Грузии в Чечню, говорится в докладе 2013 года Продовольственной и сельскохозяйственной организации, агентства Организации Объединенных Наций. В докладе показано, как болезнь распространилась на север от Кавказа в другие части страны, где свиноводство было более сконцентрировано - Центральный федеральный округ (где проживает 28,8% свиней России) и Волжский федеральный округ (с 25,4% национального стада) и на северо-запад в сторону Украины, Белоруссии, Польши и стран Балтии. В России, добавляется в докладе, болезнь "на пути к эндемичности в Тверской области" (около 106 км к северу от Москвы) и примерно 500 км к востоку от прибрежных соседей России на Балтике. Одним из факторов распространения вируса африканской чумы свиней в России было "распространение" "инфицированных продуктов из свиней" за пределами пораженных (под карантином и с ограничениями торговли) районов, которые прошли большие расстояния (тысячи километров) внутри страны. "Покупатели оптовых товаров, особенно военные, неоднократно участвовали в незаконном распространении зараженного мяса", - говорится в докладе Продовольственной и сельскохозяйственной организации. В докладе предупреждалось, что "страны, граничащие с Российской Федерацией, особенно Украина, Молдова, Казахстан и Латвия, наиболее уязвимы для заражения [африканской чумой свиней] и эндемического распространения, в основном потому, что биологическая безопасность их свиноводства в основном низкая. Предотвращение распространения [африканской чумы свиней] на Украину особенно важно для всего сектора свиноводства в Европе. Учитывая тревожные события в Российской Федерации, европейские страны должны быть бдительными. Они должны быть готовы предотвращать и эффективно реагировать на внедрение [африканской чумы свиней] на их территории в течение многих лет ". Чтобы остановить распространение вируса, "действующий сценарий в Российской Федерации предполагает, что [профилактика] должна быть особенно подчеркнута на часто неформальном уровне и должна включать не только свиноводцев, но и всех участников всей цепочки создания стоимости - мясников, посредников, скотобоен и т. д. Особенно важно, чтобы в зоне, свободной от [африканской чумы свиней], не было [ново] заражения, и чтобы при возникновении болезни быстро реагировали". С 2007 года по 31 августа 2018 года ветеринарный отдел Россельхознадзора (Ланг ру), российского федерального агентства, осуществляющего надзор за сельским хозяйством, и государственные СМИ сообщили о 1367 случаях заболевания домашними свиньями или дикими свиньями. Согласно официальным данным, центральные и южные районы были наиболее затронуты болезнью (с несколькими случаями на востоке). В августе 2012 года в Украине была зарегистрирована вспышка африканской чумы свиней. В июне 2013 года в Беларуси была зарегистрирована вспышка. В январе 2014 года власти объявили о наличии африканской чумы свиней в Литве и Польше, в июне 2014 года - в Латвии, а в июле 2015 года - в Эстонии. В июле 2015 года в Эстонии был зарегистрирован первый случай африканской чумы свиней среди свиней, выращенных на фермах в городе Валгамаа на границе страны с Латвией. В тот же день был зарегистрирован еще один случай в округе Вильянди, который также граничит с Латвией. Все свиньи были забиты, а их трупы сожжены. Менее чем через месяц почти 15 000 свиней были забиты, и страна "боролась с тем, чтобы избавиться от сотен тонн тушек". Ожидалось, что число погибших "повысится". В январе 2017 года Латвия объявила чрезвычайную ситуацию в связи с вспышками африканской чумы свиней в трех регионах, вк...

Китай и Восточная Азия

В августе 2018 года в Китае была зарегистрирована первая вспышка африканской чумы свиней в провинции Ляонин, которая также стала первым зарегистрированным случаем в Восточной Азии. К 1 сентября 2018 года в стране было уничтожено более 38 000 свиней. С 10 сентября 2018 года Китай заблокировал транспортировку живых свиней и продуктов из свиней в значительной части страны, чтобы избежать распространения за пределы 6 провинций, где вирус был тогда подтвержден. К концу 2018 года о вспышках заболевания сообщалось в 23 провинциях и муниципалитетах по всему Китаю. 25 апреля 2019 года сообщалось, что вирус распространился во всех регионах Китая, а также в некоторых частях Юго-Восточной Азии, включая Камбоджу, Лаос, Таиланд и Вьетнам. По сообщениям, китайская свиная популяция сократилась почти на 100 миллионов по сравнению с предыдущим годом, что привело к тому, что цены на свинину в Европе достигли шестилетнего максимума. Зе Чен, Шан Гао и их коллеги из Университета Нанкай обнаружили вирус АЧС в дермаценторе (жёстких клещах) у овец и крупного рогатого скота с использованием небольшого РНК-секвенцирования. Этот сегмент 235 bp имел идентичность 99% к сегменту 235 bp ДНК ASFV и содержал три одиночные нуклеотидные мутации (C38T, C76T и A108C). C38T, в результате которого возникает одна аминокислотная мутация G66D, предполагает существование нового штамма АЧС, который отличается от всех зарегистрированных штаммов АЧС в базе данных NCBI Genbank и штамма АЧС (GenBank: MH713612.1), зарегистрированного в Китае в 2018 году. В декабре 2019 года Китай запретил импорт свиней и диких кабанов из Индонезии из-за вспышек африканской чумы свиней, которые достигли 392 случаев 17 декабря. В сентябре 2019 года в Южной Корее подтвердили второй случай африканской чумы свиней на свиноферме в Йончхоне, где выращивали 4700 свиней, через день после сообщения о первой в истории вспышке вируса. По состоянию на 31 октября 2019 года вирус был обнаружен у домашних свиней в девяти местах в Кёнгидо и пяти местах в городе Инчхон. Также он был подтвержден у 18 диких кабанов из Гангвон-до и Кёнги-до, в пределах или вблизи гражданской зоны контроля. 3 февраля 2020 года на берегу Ляйю (Малый Кинмен) был обнаружен еще один зараженный труп свиньи, что увеличило общее количество зараженных трупов свиней, найденных на берегах округа Кинмен, до одиннадцати. В апреле 2020 года на берегу острова Лейю (Малый Кинмен) выбросили двенадцатый труп свиньи, который, как было подтверждено, был заражен вирусом африканской чумы свиней. После проведения испытаний в семи активных свиноводческих хозяйствах на острове не было обнаружено вспышки болезни. 29 мая Министерство сельского хозяйства и сельского хозяйства Китая сообщило в пятницу, что обнаружило новую вспышку африканской чумы свиней вблизи города Ланчжоу в северо-западной провинции Гансу. 9 апреля 2019 года на берегу Нангана на островах Мацу (округ Ленцзян) был обнаружен труп свиньи с АЧС, что привело к недельному запрету на транспортировку свиней из округа.

Юго-Восточная Азия

Департамент сельского хозяйства Филиппин начал расследование в августе 2019 года в связи с инцидентами со смертью свиней в городах Ризаль и Булакан по подозрению в случаях африканской чумы свиней. Департамент приказал отсечь свиней в радиусе пораженных ферм. Первый случай африканской чумы свиней на Филиппинах был подтвержден 9 сентября 2019 года департаментом сельского хозяйства страны. Департамент отправил 20 образцов крови в Соединенное Королевство для тестирования, из которых 14 образцов дали положительный результат на вирус африканской чумы свиней. Однако в момент подтверждения министерство заявило, что болезнь еще не достигла уровня эпидемии и все еще оценивает ее тяжесть. Правительство Вьетнама приняло меры по ограничению перемещения свиней и продуктов из свиней и приняло меры по предотвращению, оперативному выявлению и строгому урегулированию случаев контрабанды, незаконной перевозки и торговли животными и продуктами животного происхождения, особенно свиньями и продуктами из свинины, в страну. К концу октября 2019 года в общей сложности в Дили было зарегистрировано 100 вспышек болезни в мелких свиноводческих хозяйствах. Однако с января было сообщено о большом количестве мертвых диких свиней, а с марта 2021 года было найдено более ста мертвых бородатых свиней Борнея; Департамент дикой природы Сабаха позже заявил, что это, вероятно, было связано с АЧС. Считается, что другие виды свиней Юго-Восточной Азии также уязвимы, включая (Сулавеси) Celebes warty свинью.

Индия

29 апреля 2020 года в Индии была зарегистрирована первая вспышка африканской чумы свиней в штате Ассам и Аруначал-Прадеш. Было сказано, что болезнь распространяется через трансграничную передачу из Китая. Согласно данным, имеющимся у ветеринарного департамента, более 15 000 свиней погибли в 9 пострадавших районах Асама. Голагат, Мажули, Дибругар, Камруп, Дхемаджи, Бисунатх, Северный Лакхимпур, Сивасагар, Йорхат. В пострадавших районах Ассама запрещена продажа и употребление свинины. 4 июля результаты исследований некоторых образцов тушек свиней подтвердили наличие африканской чумы свиней в подрайоне Бокакат Голагата. Смертность свиней достигла 800 человек в Бокакате. Предполагается, что инфекция попала в регион из Камаргаона, который находится недалеко от Бокахат.

Исторические теории

Появление АЧС за пределами Африки примерно в то же время, что и СПИД, вызвало некоторый интерес к тому, связаны ли эти два заболевания, и в 1986 году в журнале The Lancet появился отчет, подтверждающий это. Однако осознание того, что вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) вызывает СПИД, дискредитировало любую потенциальную связь с АЧС.