Введение
Коллагеназы - это ферменты, которые разрушают пептидные связи в коллагене. Они помогают разрушать внеклеточные структуры в патогенезе бактерий, таких как Клостридиум. Они считаются фактором вирулентности, способствующим распространению газовой гангрены. Обычно они нацелены на соединительную ткань в мышечных клетках и других органах тела. Коллаген, ключевой компонент внеклеточного матрикса животных, образуется при расщеплении проколлагена коллагеназой после его выделения из клетки. Это предотвращает образование больших структур внутри клетки. В дополнение к производству некоторыми бактериями, коллагеназа может быть произведена организмом как часть его нормального иммунного ответа. Это производство индуцируется цитокинами, которые стимулируют клетки, такие как фибробласты и остеобласты, и могут вызвать косвенное повреждение тканей.
Семейство MEROPS M9
Эта группа металлопептидаз составляет семейство MEROPS пептидаз M9, подсемейства M9A и M9B (микробная коллагеназа, клан MA(E)). Белокожие складки пептидазного домена для членов этого семейства напоминают те, что у термолизина, типичный пример для клана MA и прогнозируемые остатки активного места для членов этого семейства и термолизина встречаются в мотиве HEXXH. Микробные коллагеназы были идентифицированы у бактерий рода Vibrio и Clostridium. Коллагеназа используется во время бактериальной атаки для разрушения коллагенового барьера хозяина во время вторжения. В больницах бактерии вибрио иногда используются для удаления мертвой ткани от ожогов и язв. Clostridium histolyticum - это патоген, вызывающий газовую гангрену; тем не менее, изолированная коллагеназа использовалась для лечения язв. Расщепление коллагена происходит в а у бактерий Vibrio и в связях в коллагеназах Clostridium. Анализ первичной структуры продукта гена из Clostridium perfringens показал, что фермент вырабатывается с помощью 86 остатков, которые содержат предполагаемую последовательность сигналов. В пределах этого отрезка находится PLGP, аминокислотная последовательность, типичная для подложки коллагеназы. Таким образом, эта последовательность может быть связана с самообработкой коллагеназы.