Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Введение
Аламитицин – пептидный антибиотик, формирующий каналы, продуцируемый грибом Trichoderma viride. Он относится к пептиболам, содержащим непротеиногенный аминокислотный остаток Aib (2-аминоизомасляная кислота). Этот остаток сильно индуцирует образование альфа-спиральной структуры. Последовательность пептида следующая:
Alamethicin is a channel forming peptide antibiotic, produced by the fungus Trichoderma viride. It belongs to peptaibol peptides which contain the non proteinogenic amino acid residue Aib (2 aminoisobutyric acid). This residue strongly induces formation of alpha helical structure. The peptide sequence is
Ac Aib Pro Aib Ala Aib Ala Gln Aib Val Aib Gly Leu Aib Pro Val Aib Aib Glu Gln Phl,
Ac Aib Pro Aib Ala Aib Ala Gln Aib Val Aib Gly Leu Aib Pro Val Aib Aib Glu Gln Phl
где Ac = ацетил, Phl = фенилаланинол, и Aib = 2-аминоизомасляная кислота. В клеточных мембранах он формирует ионные каналы, зависимые от напряжения, путем агрегации от четырех до шести молекул.
where Ac = acetyl, Phl = phenylalaninol, and Aib = 2 Aminoisobutyric acid. In cell membranes, it forms voltage dependent ion channels by aggregation of four to six molecules.
Биосинтез
Предполагается, что биосинтез аламетицина катализируется аламетициновой синтетазой, нерибосомным пептидным синтетазом (NRPS), впервые выделенным в 1975 году. Хотя существует несколько известных последовательностей пептида аламетицина, данные свидетельствуют о том, что все они следуют общему механизму NRPS с незначительными вариациями в отдельных аминокислотах. Процесс начинается с ацилирования N-терминала первой аминоизомасляной кислоты на ферменте АЛМ-синтазы ацетил-КоА, за которым следует последовательная конденсация аминокислот каждой модульной единицей синтетазы. Аминокислоты первоначально аденилируются доменом аденилирования (А), после чего присоединяются к белку-носителю ацила, такому как белок-носитель пептидила, посредством тиоэстерной связи. Растущая цепь присоединяется к аминокислоте, связанной с ПЦП, доменом конденсации (С), после чего следующий модуль повторяет тот же цикл реакций. После добавления фенилаланинола завершенная пептидная цепь расщепляется тиоэстеразой, которая разрывает тиоэстерную связь, высвобождая спирт.
Alamethicin biosynthesis is hypothesized to be catalyzed by alamethicin synthase, a Nonribosomal peptide synthase (NRPS) first isolated in 1975. Although there are several sequences of the alamethicin peptide accepted, evidence suggests these all follow the general NRPS mechanism with small variations at select amino acids. Beginning with the acylation of the N terminal of the first aminoisobutiric acid on the ALM synthase enzyme by Acetyl CoA, this is followed by the sequential condensation of amino acids by each modular unit of the synthetase. Amino acids are initially adenylated by an “adenylylation” (A) domain before being attached by a thioester bond to an Acyl Carrier Protein like Peptidyl carrier protein. The growing chain is attached to the amino acid bearing PCP by the "condensation" (C) domain, followed by another round of the same reactions by the next module. Following addition of phenylalaninol the completed peptide chain is cleaved by the thioesterase domain, cleaving the thioester bond and leaving an alcohol.