Кіріспе
Кладтар үшін ұсынылған номенклатура коды – Филогенетикалық номенклатураның халықаралық коды, қысқаша Филокод деп аталады, және ол филогенетикалық номенклатураны реттейтін ресми ережелер жиынтығы болып табылады. Оның қазіргі нұсқасы ерекше түрде кладтардың атауын реттеуге бағытталған, ал түрлердің атауларын басқару санатқа негізделген номенклатура кодтарына (ICN, ICNCP, ICNP, ICZN, ICVCN) жүктеледі. Филокод Халықаралық филогенетикалық номенклатура қоғамымен (ISPN) байланысты. "Филонимдер" атты қосымша томда Филокод бойынша 300 таксон атауы келтірілген, бұл кодты білмейтіндер үшін мысал ретінде қызмет етеді. RegNum – тіркелген клад атауларына арналған онлайн деректер базасы. Филокод филогенетикалық номенклатураны қандай атаулар мен анықтамалардың байланысы орнатылған деп есептелетінін, олардың қайсысы омонимдер немесе синонимдер болып саналатынын және синонимдер немесе омонимдер жиынтығынан қайсысы қабылданған деп есептелетінін (әдетте бірінші тіркелгені; төменде қараңыз) анықтау ережелерін беру арқылы реттейді. Филокод тек кладтарды атаумен ғана айналысады, парафилетикалық немесе полифилетикалық топтарды емес, және тек үлгілерді, түрлерді және апоморфияларды спецификаторлар (белгішелер) ретінде пайдалануға рұқсат береді.
The International Code of Phylogenetic Nomenclature, known as the PhyloCode for short, is a formal set of rules governing phylogenetic nomenclature. Its current version is specifically designed to regulate the naming of clades, leaving the governance of species names up to the rank based nomenclature codes (ICN, ICNCP, ICNP, ICZN, ICVCN). The PhyloCode is associated with the International Society for Phylogenetic Nomenclature (ISPN). The companion volume, Phylonyms, establishes 300 taxon names under PhyloCode, serving as examples for those unfamiliar with the code. RegNum is an associated online database for registered clade names. The PhyloCode regulates phylogenetic nomenclature by providing rules for deciding which associations of names and definitions are considered established, which of those will be considered homonyms or synonyms, and which one of a set of synonyms or homonyms will be considered accepted (generally the one registered first; see below). The PhyloCode only governs the naming of clades, not of paraphyletic or polyphyletic groups, and only allows the use of specimens, species, and apomorphies as specifiers (anchors).
Нұсқалар
PhyloCode бірнеше рет қайта қарастырылды. 2023 жылғы дерек бойынша, қазіргі нұсқасы – 6, ол 2020 жылдың 8 маусымында веб-сайтта жарияланды.
Ұйым
Басқа номенклатуралық кодекстердегідей, PhyloCode ережелері баптар түрінде ұйымдастырылған, ал олар өз кезегінде тарауларға бөлінген. Әр бапта түсіндірмелер, мысалдар және ұсынымдар да болуы мүмкін.
Тіркеу дерекқоры
Іске асырылғаннан кейін PhyloCode, RegNum деп аталатын тіркеу дерекқорымен байланыстырылады, ол барлық клад атаулары мен анықтамаларын сақтайды, олар қабылданған болып есептеледі. Бұл, клад атауларын анықтамалармен байланыстыратын, ал одан кейін филогенетикалық ағаш дерекқорлары (мысалы, TreeBASE) арқылы кіші таксондар немесе үлгілер жиынтығымен байланыстыруға мүмкіндік беретін, жалпы қолданысқа жарамды құрал болады деп үміттелген. Дегенмен, қазіргі жоспар бойынша RegNum-ның ең маңызды қолданысы – бірнеше синонимдер немесе гомонимдердің қайсысы қабылданған деп есептелетінін анықтау: консервация жағдайларын ескермегенде, ең төменгі тіркеу нөміріне ие болған нұсқа.