Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Тип грам-отрицательных бактерий
Phylum of Gram negative bacteria
Тип Bacteroidota (синоним Bacteroidetes) состоит из трех больших классов грам-отрицательных, не образующих спор, анаэробных или аэробных, палочковидных бактерий, которые широко распространены в окружающей среде, включая почву, отложения и морскую воду, а также в кишечнике и на коже животных. Хотя некоторые виды Bacteroides могут быть оппортунистическими патогенами, многие Bacteroidota являются симбиотическими видами, хорошо адаптированными к желудочно-кишечному тракту. Бактериоиды в высокой концентрации присутствуют в кишечнике, достигая до 10¹¹ клеток на грамм кишечного содержимого. Они осуществляют метаболические превращения, необходимые для хозяина, такие как расщепление белков или сложных полимеров сахаров. Бактериоиды колонизируют желудочно-кишечный тракт уже у младенцев, поскольку непереваримые олигосахариды в материнском молоке поддерживают рост как Bacteroides, так и видов Bifidobacterium. Виды Bacteroides избирательно распознаются иммунной системой хозяина посредством специфических взаимодействий.
The phylum Bacteroidota (synonym Bacteroidetes) is composed of three large classes of Gram negative, nonsporeforming, anaerobic or aerobic, and rod shaped bacteria that are widely distributed in the environment, including in soil, sediments, and sea water, as well as in the guts and on the skin of animals. Although some Bacteroides spp. can be opportunistic pathogens, many Bacteroidota are symbiotic species highly adjusted to the gastrointestinal tract. Bacteroides are highly abundant in intestines, reaching up to 1011 cells g−1 of intestinal material. They perform metabolic conversions that are essential for the host, such as degradation of proteins or complex sugar polymers. Bacteroidota colonize the gastrointestinal tract already in infants, as non digestible oligosaccharides in mother milk support the growth of both Bacteroides and Bifidobacterium spp. Bacteroides spp. are selectively recognized by the immune system of the host through specific interactions.
История
Bacteroides fragilis был впервые выделен в 1898 году как патогенный для человека вид, связанный с аппендицитом и другими клиническими случаями. Долгое время считалось, что большинство грамотрицательных бактерий желудочно-кишечного тракта относятся к роду Bacteroides, однако в последние годы многие виды Bacteroides были переклассифицированы. Согласно современной классификации, большинство видов Bacteroidota относятся к семействам Bacteroidaceae, Prevotellaceae, Rikenellaceae и Porphyromonadaceae. В альтернативной системе классификации, предложенной Кавальером-Смитом, этот таксон рассматривается как класс в типе Sphingobacteria.
Bacteroides fragilis was the first Bacteroides species isolated in 1898 as a human pathogen linked to appendicitis among other clinical cases. For a long time, it was thought that the majority of Gram negative gastrointestinal tract bacteria belonged to the genus Bacteroides, but in recent years many species of Bacteroides have undergone reclassification. Based on current classification, the majority of the gastrointestinal Bacteroidota species belong to the families Bacteroidaceae, Prevotellaceae, Rikenellaceae, and Porphyromonadaceae. In the alternative classification system proposed by Cavalier Smith, this taxon is instead a class in the phylum Sphingobacteria.
Медицинская и экологическая роль
В микробиоте желудочно-кишечного тракта Бактериоидоты обладают очень широким метаболическим потенциалом и считаются одной из наиболее стабильных составляющих микрофлоры желудочно-кишечного тракта. Снижение численности Бактериоидот в некоторых случаях связано с ожирением. Эта бактериальная группа, по-видимому, встречается в повышенном количестве у пациентов с синдромом раздраженного кишечника и играет роль при диабете 1 и 2 типа. Например, Бактериоидоты, вместе с "Pseudomonadota", "Bacillota" и "Actinomycetota", также входят в число наиболее распространенных бактериальных групп в ризосфере. Они были обнаружены в образцах почвы из различных местоположений, включая пахотные поля, почвы теплиц и невозделанные участки.
In the gastrointestinal microbiota Bacteroidota have a very broad metabolic potential and are regarded as one of the most stable part of gastrointestinal microflora. Reduced abundance of the Bacteroidota in some cases is associated with obesity. This bacterial group appears to be enriched in patients with irritable bowel syndrome and involved in type 1 and type 2 diabetes. For example, Bacteroidota, together with "Pseudomonadota", "Bacillota", and "Actinomycetota", are also among the most abundant bacterial groups in rhizosphere. They have been detected in soil samples from various locations, including cultivated fields, greenhouse soils and unexploited areas.
Метаболизм
В качестве основных конечных продуктов бактерии типа Bacteroidota производят янтарную кислоту, уксусную кислоту и, в некоторых случаях, пропионовую кислоту. Виды, относящиеся к родам Alistipes, Bacteroides, Parabacteroides, Prevotella, Paraprevotella, Alloprevotella, Barnesiella и Tannerella, являются сахаролитическими, в то время как виды родов Odoribacter и Porphyromonas преимущественно асахаролитические. Некоторые виды Bacteroides spp. и Prevotella spp. способны расщеплять сложные растительные полисахариды, такие как крахмал, целлюлоза, ксиланы и пектины. Виды типа Bacteroidota также играют важную роль в метаболизме белков благодаря протеолитической активности, обусловленной протеазами, связанными с клеткой. Некоторые виды Bacteroides spp. обладают потенциалом использовать мочевину в качестве источника азота. Другие важные функции видов Bacteroides spp. включают деконъюгацию желчных кислот и рост на слизи.
Gastrointestinal Bacteroidota species produce succinic acid, acetic acid, and in some cases propionic acid, as the major end products. Species belonging to the genera Alistipes, Bacteroides, Parabacteroides, Prevotella, Paraprevotella, Alloprevotella, Barnesiella, and Tannerella are saccharolytic, while species belonging to Odoribacter and Porphyromonas are predominantly asaccharolytic. Some Bacteroides spp. and Prevotella spp. can degrade complex plant polysaccharides such as starch, cellulose, xylans, and pectins. The Bacteroidota species also play an important role in protein metabolism by proteolytic activity assigned to the proteases linked to the cell. Some "Bacteroides spp. have a potential to utilize urea as a nitrogen source. Other important functions of Bacteroides spp. include the deconjugation of bile acids and growth on mucus.