Введение
В статистике, композиционные данные – это количественные описания частей целого, передающие относительную информацию. Математически, композиционные данные представляются точками на симплексе. Измерения, включающие вероятности, доли, проценты и ppm, можно рассматривать как композиционные данные.
Трехмерный участок
Композиционные данные, представленные тремя переменными, можно отобразить на треугольных диаграммах. Использование барицентрической диаграммы для трех переменных графически показывает соотношения между этими тремя переменными в виде точек внутри равностороннего треугольника.
Упрощенное пространство выборки
В целом, Джон Эйчисон определил композиционные данные как пропорции некоторого целого в 1982 году. В частности, композиционная точка данных (или просто композиция) может быть представлена вещественным вектором с положительными компонентами. Пространство выборки композиционных данных является симплексом:
Единственная информация содержится в соотношениях между компонентами, поэтому информация о композиции сохраняется при умножении на любую положительную константу. Следовательно, пространство выборки композиционных данных всегда можно рассматривать как стандартный симплекс, то есть. В этом контексте нормализация к стандартному симплексу называется замыканием и обозначается следующим образом:
где D – число частей (компонентов), а – вектор-строка.
Нормальные основания
Поскольку симплекс Эйчисона образует конечномерное пространство Гильберта, в нем можно построить ортонормальные базисы. Любую композицию можно разложить следующим образом:
где образует ортонормальный базис в симплексе. Значения являются (ортонормальными и декартовыми) координатами относительно данного базиса. Они называются изометрическими логарифмическими координатами.
Линейные преобразования
Существует три хорошо охарактеризованных изоморфизма, преобразующих простой Эйчисона в вещественное пространство. Все эти преобразования удовлетворяют линейности, как показано ниже.
Аддитивная логарифмическая преобразовательная
Аддитивный логарифмический коэффициент (ALR) — это изоморфизм, определяемый как [формула]. Выбор компонента в знаменателе произволен и может быть любым заданным компонентом. Это преобразование часто используется в химии, например, при измерениях pH. Кроме того, ALR-преобразование наиболее часто применяется в многочленной логистической регрессии. ALR-преобразование не является изометрией, то есть расстояния между преобразованными значениями не будут соответствовать расстояниям между исходными композициями в симплексе.
The choice of denominator component is arbitrary, and could be any specified component. This transform is commonly used in chemistry with measurements such as pH. In addition, this is the transform most commonly used for multinomial logistic regression. The alr transform is not an isometry, meaning that distances on transformed values will not be equivalent to distances on the original compositions in the simplex.
Примеры
В химии составы могут быть выражены как молярные концентрации каждого компонента. Поскольку сумма всех концентраций не фиксирована, необходим полный состав из D частей, который, таким образом, представляется в виде вектора из D молярных концентраций. Эти составы можно преобразовать в весовые проценты, умножив каждый компонент на соответствующую константу. В демографии город может быть представлен как композиционная точка данных в выборке городов; город, в котором 35% населения – христиане, 55% – мусульмане, 6% – евреи, а остальные 4% – другие, будет соответствовать четверке [0.35, 0.55, 0.06, 0.04]. Набор данных будет соответствовать списку городов. В геологии порода, состоящая из различных минералов, может быть композиционной точкой данных в выборке пород; порода, в которой 10% составляет первый минерал, 30% – второй, а остальные 60% – третий, будет соответствовать тройке [0.1, 0.3, 0.6]. Набор данных будет содержать одну такую тройку для каждой породы в выборке. В высокопроизводительном секвенировании полученные данные обычно преобразуются в относительные концентрации, что делает их композиционными. В теории вероятностей и статистике разбиение пространства выборки на непересекающиеся события описывается вероятностями, присвоенными этим событиям. Вектор из D вероятностей можно рассматривать как состав из D частей. Поскольку они в сумме дают единицу, одну вероятность можно исключить, и состав будет полностью определен. В хемометрике – для классификации нефтяных масел. В ходе опроса доли людей, положительно ответивших на различные вопросы, могут быть выражены в процентах. Поскольку общая сумма фиксирована как 100%, композиционный вектор из D компонентов может быть определен, используя только D–1 компонентов, при условии, что оставшийся компонент представляет собой процент, необходимый для того, чтобы весь вектор в сумме давал 100%.