Введение
Класс ферментов, катализирующих реакции элиминирования – группа ферментов.
the group of enzymes
In biochemistry, a lyase is an enzyme that catalyzes the breaking (an elimination reaction) of various chemical bonds by means other than hydrolysis (a substitution reaction) and oxidation, often forming a new double bond or a new ring structure. The reverse reaction is also possible (called a Michael reaction). For example, an enzyme that catalyzed this reaction would be a lyase:
ATP → cAMP + PPi
Lyases differ from other enzymes in that they require only one substrate for the reaction in one direction, but two substrates for the reverse reaction.
В биохимии лиаза – это фермент, который катализирует разрыв (реакцию элиминирования) различных химических связей способами, отличными от гидролиза (реакция замещения) и окисления, часто с образованием новой двойной связи или нового кольцевого строения. Возможна и обратная реакция (называемая реакцией Майкла). Например, фермент, катализирующий эту реакцию, является лиазой: ATP → cAMP + PPi. Лиазы отличаются от других ферментов тем, что для реакции в одном направлении им требуется только один субстрат, а для обратной реакции – два субстрата.
the group of enzymes
In biochemistry, a lyase is an enzyme that catalyzes the breaking (an elimination reaction) of various chemical bonds by means other than hydrolysis (a substitution reaction) and oxidation, often forming a new double bond or a new ring structure. The reverse reaction is also possible (called a Michael reaction). For example, an enzyme that catalyzed this reaction would be a lyase:
ATP → cAMP + PPi
Lyases differ from other enzymes in that they require only one substrate for the reaction in one direction, but two substrates for the reverse reaction.
Номенклатура
Систематические названия формируются как "лиаза субстратной группы". Распространенные названия включают декарбоксилазу, дегидратазу, альдолазу и т. д. Если продукт имеет большее значение, в названии может использоваться "синтаза", например, фосфосульфолактинсинтаза (EC 4.4.1.19, присоединение сульфита к фосфоенолпирувату по механизму Майкла). Комбинация реакции элиминирования и присоединения по Майклу наблюдается в O-сукцинилхомосерин(тиол)-лиазе (MetY или MetZ), которая сначала катализирует γ-элиминирование O-сукцинилхомосерина (с сукцинатом в качестве уходящей группы), а затем присоединение сульфида к винильному интермедиату. Эта реакция первоначально была классифицирована как лиаза (EC 4.2.99.9), но впоследствии была переклассифицирована как трансфераза (EC 2.5.1.48).
Классификация
Лиазы классифицируются как EC 4 в классификации ферментов по номеру EC. Лиазы можно далее классифицировать на семь подклассов:
EC 4.1 включает лиазы, расщепляющие связи углерод-углерод, такие как декарбоксилазы (EC 4.1.1), альдегидные лиазы (EC 4.1.2), лиазы оксокислот (EC 4.1.3) и другие (EC 4.1.99).
EC 4.2 включает лиазы, расщепляющие связи углерод-кислород, такие как дегидратазы.
EC 4.3 включает лиазы, расщепляющие связи углерод-азот.
EC 4.4 включает лиазы, расщепляющие связи углерод-сера.
EC 4.5 включает лиазы, расщепляющие связи углерод-галоген.
EC 4.6 включает лиазы, расщепляющие связи фосфор-кислород, такие как аденилатциклаза и гуанилатциклаза.
EC 4.99 включает другие лиазы, такие как феррохелатаза.
EC 4.1 includes lyases that cleave carbon–carbon bonds, such as decarboxylases (EC 4.1.1), aldehyde lyases (EC 4.1.2), oxo acid lyases (EC 4.1.3), and others (EC 4.1.99)
EC 4.2 includes lyases that cleave carbon–oxygen bonds, such as dehydratases
EC 4.3 includes lyases that cleave carbon–nitrogen bonds
EC 4.4 includes lyases that cleave carbon–sulfur bonds
EC 4.5 includes lyases that cleave carbon–halide bonds
EC 4.6 includes lyases that cleave phosphorus–oxygen bonds, such as adenylyl cyclase and guanylyl cyclase
EC 4.99 includes other lyases, such as ferrochelatase
Мембранно-ассоциированные лизы
Некоторые лиазы ассоциируются с биологическими мембранами как периферические мембранные белки или закрепляются посредством одной трансмембранной спирали.