Ферменты и кофакторы
-
Дегидрогеназы: ферменты окислительно-восстановительных реакций.
Дегидрогеназы: ферменты-оксидоредуктазы, катализирующие окисление/восстановление. Роль в метаболизме, примеры (этанол, ацетальдегид), классификация EC 1.
-
Флавины: структура, свойства и биологическая роль.
Флавины: витамин B2 (рибофлавин), изоаллоксазин и его производные. Роль в биохимии, FAD и FMN. Отличие от флавоноидов и флавонолов.
-
Алкогольдегидрогеназы: эволюция, генетические варианты и связь с алкоголизмом.
Алкогольдегидрогеназы (ADH): ферменты, расщепляющие алкоголь в организме и участвующие в метаболизме. Происхождение и роль ADH в ферментации и детоксикации.
-
Дигидрофолатредуктаза человека: структура, функция и механизм действия.
Дигидрофолатредуктаза (DHFR) человека: фермент, кодируемый геном DHFR на 5-й хромосоме. Роль в метаболизме фолиевой кислоты и одноуглеродном обмене.
-
Уреаза: структура, свойства и механизм гидролиза мочевины.
Уреаза: фермент, расщепляющий мочевину до аммиака и CO2. Никельсодержащий комплекс, встречающийся в почве, растениях и микроорганизмах. Катализ гидролиза.
-
Активный центр фермента
Активный центр фермента: структура, функция и роль аминокислотных остатков в катализе реакций. Высокая специфичность и оптимизация связывания субстрата.
-
Фенилaланингидроксилаза: структура, механизм и регуляция.
Фенилaланингидроксилаза (PAH): фермент, превращающий фенилаланин в тирозин. Мутации гена PAH вызывают фенилкетонурию. Механизм действия и роль в метаболизме.
-
Протеиндисульфид изомераза: структура, функции и роль в клеточных процессах
Протеиндисульфид изомераза (PDI): фермент, катализирующий образование дисульфидных связей в белках для правильной укладки. Роль в ER и бактериях.
-
Кофакторы и коферменты: помощники ферментов
Кофакторы: не белковые соединения и ионы металлов, необходимые для работы ферментов как катализаторов. Типы: ионы и коэнзимы. Энзимная кинетика.
-
Лиазы: ферменты, катализирующие реакции элиминирования
Лиазы – ферменты, катализирующие реакции элиминирования без гидролиза и окисления. Образуют двойные связи и кольца. Примеры: декарбоксилазы, дегидратазы.
-
S-Аденозилметионин: Многогранный кофактор и малоизученные ферменты радикального типа.
S-аденозилметионин (SAM, SAMe, AdoMet): ключевой метаболический кофактор в клетках. Роль в метилировании, синтезе гормонов, иммунитете и метаболизме.
-
Пирролохинолинхинон (PQQ): открытие, биосинтез и роль в бактериях и эукариотах.
Пирролохинолинхинон (PQQ): антиоксидант и кофактор для бактерий. Стимулирует рост, используется как глюкозный сенсор. Открытие и свойства PQQ.
-
Тиаминаза: ферменты, функции и влияние на здоровье
Тиаминаза: фермент, разрушающий витамин B1 (тиамин). Два типа (I & II), антинутриент, продуцируется бактериями. Влияние на усвоение тиамина и здоровье.
-
Россмановская складка: структура, функции и эволюционное происхождение.
Россман-складка: структура белков, связывающих нуклеотиды (FAD, NAD+, NADP+). Состоит из β-листов и α-спиралей. Важна для ферментов и узнавания кофакторов.
-
Нитрогеназы: структура, функция и механизмы азотфиксации
Нитрогеназы: ферменты, фиксирующие азот из воздуха в аммиак. Ключевые для жизни, участвуют в синтезе белков и нуклеиновых кислот. Nif гены.
-
Яблочная дегидрогеназа: структура, функция и эволюция.
Малатдегидрогеназа: фермент цикла Кребса, окисляющий малат в оксалоацетат. Роль в метаболизме, гликолизе и другие изоферменты. Подробно о MDH.
-
Глутатион-S-трансферазы: семейство ферментов и механизмы детоксикации.
Глутатион-S-трансферазы (GST): ферменты детоксикации, катализирующие связывание глутатиона с ксенобиотиками. Разнообразие, классификация и функции GST.
-
Птерины: структура, свойства и биологическая роль.
Птерины: гетероциклические соединения, производные птеридина. Открыты в крыльях бабочек, важны для окраски и выполняют различные биологические функции.
-
Метилентетрагидрофолатредуктаза: ключевой фермент метильного цикла и его полиморфизмы.
MTHFR: ключевой фермент метильного цикла. Генетические варианты MTHFR, влияние на здоровье сосудов, риск дефектов нервной трубки и деменции.
-
Флавин-адениндинуклеотид: окислительно-восстановительный кофермент
ФАД (флавин аденин динуклеотид): кофермент, участвующий в метаболизме и окислительно-восстановительных реакциях. Важен для работы ферментов и комплексов.
-
Тирозиназа: фермент контроля меланогенеза
Тирозиназа: фермент контроля меланина. Роль в синтезе пигмента, окисление тирозина, реакции Raper-Mason. Важно для кожи и растений.
-
Нитрилазы: структура, функции и механизмы гидролиза нитрилов
Нитрилазы: ферменты, гидролизующие нитрилы в кислоты и аммиак. Обладают активностью NHase, формируя амиды. Структура и механизм действия нитрилаз.
-
Флавинмононуклеотид: свойства, функции и роль в биохимических процессах.
Флавин мононуклеотид (ФМН): роль в биохимии, окислительно-восстановительных реакциях и фоторецепции. Важный кофактор витамина B2 для здоровья клеток.
-
Гидрогеназы: структура, функции и перспективы использования.
Гидрогеназы: ферменты, катализирующие окисление водорода. Важны для микроорганизмов, участвуют в метаболизме, утилизации электронов и ферментации.
-
Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenases
-
Хлорамфеникол-ацетилтрансфераза: структура, механизм и применение.
Хлорамфениколацетилтрансфераза (CAT): фермент бактерий, обеспечивающий устойчивость к антибиотику хлорамфениколу. Структура, механизм действия и роль в резистентности.
-
Неконкурентное ингибирование ферментов
Неконкурентное ингибирование ферментов: влияние ингибиторов на активность, отличие от конкурентного ингибирования, работы Майкла и Ментена, кинетика ферментов.
-
Флавопротеины: структура, функции и история изучения
Флавопротеины: белки с производными рибофлавина, участвующие в фотосинтезе, удалении радикалов и репарации ДНК. Важные ферменты с FMN/FAD кофакторами.
-
Пируватдекарбоксилаза: структура, механизм и роль в ферментации.
Пируватдекарбоксилаза: фермент, катализирующий образование ацетальдегида из пировиноградной кислоты. Важен в ферментации дрожжей и рыб.
-
Список EC 1: Оксидоредуктазы - Номера и изменения
Окидоредуктазы (EC 1): полный список EC-номеров ферментов по классификации IUBMB. Информация о nitrogenase, ferredoxin hydrogenase и др. – база данных ЭК.
-
DMSO reductase
-
Muconate lactonizing enzyme
-
Molybdopterin
-
Nitrite reductase
-
Flavodoxin
-
Nitrate reductase
-
Catechol 1,2-dioxygenase