Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Семейство вирусов
Family of viruses
Tombusviridae – это семейство одноклеточных вирусов растений, содержащих одноцепочечную позитивную РНК. В это семейство входят три подсемейства, 17 родов и 95 видов. Название семейства происходит от вируса кустистости томатов (Tomato bushy stunt virus, TBSV).
Tombusviridae is a family of single stranded positive sense RNA plant viruses. There are three subfamilies, 17 genera, and 95 species in this family. The name is derived from Tomato bushy stunt virus (TBSV).
Геном
Все вирусы семейства имеют несегментированный (монопартивный) линейный геном, за исключением диантовирусов, геном которых состоит из двух частей. Длина генома составляет приблизительно 4,6–4,8 кб, он не имеет 5'-кэпа и поли(А)-хвоста и кодирует 4–6 открытых рамки считывания (ORF). Полимераза кодирует янта́рный стоп-кодон, который является местом считывания в ORF1, в результате чего образуются два продукта, необходимых для репликации. Вирус не кодирует геликазу.
All viruses in the family have a non segmented (monopartite) linear genome, with the exception of Dianthoviruses, whose genome is bipartite. The genome is approximately 4.6–4.8kb in length, lacks a 5' cap and a poly(A) tail, and it encodes 4–6 ORFs. The polymerase encodes an amber stop codon which is the site of a readthrough event within ORF1, producing two products necessary for replication. There is no helicase encoded by the virus.
Структура
РНК заключена в икосаэдрическую (T=3) капсиду, состоящую из 180 мономерных единиц белка-оболочки размером 27–42 кДа; диаметр вириона составляет 28–35 нм, и он не имеет оболочки.
The RNA is encapsulated in an icosahedral (T=3) capsid, composed of 180 units of a single coat protein 27–42K in size; the virion measures 28–35 nm in diameter, and it is not enveloped.
Жизненный цикл
Вирусная репликация происходит в цитоплазме и носит лизогенный характер. Проникновение в клетку хозяина осуществляется путем внедрения в клетку. Репликация следует модели репликации РНК-вирусов с положительной цепью. Транскрипция положительной цепи РНК-вируса, использующая модель преждевременного обрыва транскрипции субгеномной РНК, является методом транскрипции. Трансляция осуществляется посредством "просачивающегося" сканирования, рибосомного сдвига рамки на -1, вирусной инициации и подавления терминации. Вирус покидает клетку хозяина посредством вирусного движения, направляемого тубулами. Растения являются естественными хозяевами. Пути передачи – механический, через семена и при контакте. ), включающие последовательности основных промоторов, регулирующие сайт инициации синтеза комплементарной цепи РНК. Считается, что этот механизм распознается РНК-зависимой РНК-полимеразой, кодируемой в геноме. Вирусы семейства Tombusviridae используют GAPDH, метаболический фермент хозяина, в репликационном центре. GAPDH может связываться с (-) цепью РНК и удерживать ее в репликационном комплексе, позволяя (+) цепям РНК, синтезированным на ее основе, экспортироваться и накапливаться в клетке хозяина. Подавление экспрессии GAPDH снижало накопление вирусной РНК и устраняло избыток (+) копий РНК.
Viral replication is cytoplasmic, and is lysogenic. Entry into the host cell is achieved by penetration into the host cell. Replication follows the positive stranded RNA virus replication model. Positive stranded RNA virus transcription, using the premature termination model of subgenomic RNA transcription is the method of transcription. Translation takes place by leaky scanning, −1 ribosomal frameshifting, viral initiation, and suppression of termination. The virus exits the host cell by tubule guided viral movement. Plants serve as the natural host. Transmission routes are mechanical, seed borne, and contact. ), which include core promoter sequences which regulate the site of initiation for the complementary RNA strand synthesis. This mechanism is thought to be recognised by RNA dependent RNA polymerase, found encoded within the genome. Viruses in Tombusviridae have been found to co opt GAPDH, a host metabolic enzyme, for use in the replication center. GAPDH may bind to the (−)RNA strand and keep it in the replicase complex, allowing (+)RNA strands synthesized from it to be exported and accumulate in the host cell. Downregulation of GAPDH reduced viral RNA accumulation, and eliminated the surplus of (+)RNA copies.