Введение
VPg (вирусный геном белка, связанный) - это белок, который ковалентно прикреплен к 5'-концу положительной нитки вирусной РНК и действует как праймер во время синтеза РНК в различных семействах вирусов, включая Picornaviridae, Potyviridae и Caliciviridae. Существуют некоторые исследования, показывающие, что возможный белок VPg также присутствует в астровирусах, однако экспериментальные доказательства этого еще не были представлены и требуют дальнейшего изучения. Примерная активность VPg возникает, когда белок становится уредилированным, обеспечивая свободный гидроксил, который может быть расширен вирусно закодированной РНК-зависимой РНК-полимеразой. Для некоторых семейств вирусов VPg также играет роль в инициировании трансляции, действуя как 5'- капка мРНК. Впервые VPg был описан в начальных исследованиях полиовирусной РНК как белок, ковалентно присоединенный к 5'-му концу генома. и позже обнаружены в калицивирусах.
Прикрепление во время синтеза РНК
Перед тем, как VPg может действовать в качестве праймера для репликации, он должен пройти посттрансляционную уредиллизацию. 3Dpol (RdRp) способен синтезировать Vpg pUpU OH, используя в качестве шаблона последовательность полиА в структуре стволовой петли (цис-действующий элемент репликации) 2C АТФазы. Кроме того, для формирования 3Dpol- преинициационного РНК- репликационного комплекса, участвующего в уредиллировании VPg, в cis требуется 5- терминальный клеверный лист. 3CDpro (протеаза) расщепляет VPg от мембранно связанного 3AB.
Функция 5-футового колпака
Исследования, в которых протеиназа K использовалась для отделения VPg от вирусного генома, показали, что вирус каллицивируса везикулярной экзантемы, не имеющий VPg, больше не является инфекционным, тогда как полиовирус сохраняет инфекционную способность даже при отсутствии VPg. Поскольку VPg находится на 5'- конце генома, подобно 5'- капелькам эукариотической мРНК, было проведено несколько экспериментов для изучения его функции в трансляции. Полиовирус использует внутренний сайт входа рибосомы (IRES) вместо крышки для инициирования трансляции, отменяя требование VPg при первоначальной инфекции, в то время как исследования с кошачьим калицивирусом подтвердили, что белок VPg взаимодействует непосредственно с белком, связывающим крышку рибосомы, eIF4E, и что это взаимодействие важно для вирусного трансляции.