Введение

Человеческая хромосома

Хромосома 15 – одна из 23 пар хромосом у человека. Обычно у людей имеется две копии этой хромосомы. Хромосома 15 охватывает приблизительно 99,7 миллионов пар оснований (строительный материал ДНК) и составляет от 3% до 3,5% от общего количества ДНК в клетках. Хромосома 15 является акроцентрической хромосомой с очень коротким коротким плечом ("p" плечо, от "petite" – маленький), которое содержит немного генов, кодирующих белки, среди своих 19 миллионов пар оснований. Она имеет более длинное длинное плечо ("q" плечо), богатое генами, охватывающее около 83 миллионов пар оснований. Ген человеческого лейкоцитарного антигена для β2-микроглобулина находится на хромосоме 15, а также ген FBN1, кодирующий как фибриллин-1 (белок, критически важный для нормального функционирования соединительной ткани), так и аспрозин (небольшой белок, образующийся из части мРНК транскрибированного гена FBN1), который участвует в метаболизме жиров.

Список генов

Ниже представлен частичный список генов на 15-й хромосоме человека. Полный список доступен по ссылке в информационном блоке справа.

Хромосомные заболевания

Следующие состояния обусловлены мутациями в 15-й хромосоме. Два из этих состояний (синдром Ангельмана и синдром Прадера-Уилли) связаны с утратой активности генов в одной и той же области 15-й хромосомы – регионе 15q11.2-q13.1. Это открытие впервые у людей продемонстрировало, что на экспрессию генов могут влиять факторы, не связанные с самими генами.

Синдром Ангельмана

Основными характеристиками синдрома Ангельмана являются тяжелая интеллектуальная недостаточность, атаксия, отсутствие речи и чрезмерно жизнерадостное поведение. Синдром Ангельмана возникает в результате потери активности гена в определенной части хромосомы 15, в области 15q11-q13. В этой области содержится ген UBE3A, который при мутации или отсутствии, вероятно, вызывает характерные признаки этого состояния. У людей обычно есть две копии гена UBE3A, по одной от каждого родителя. Обе копии этого гена активны во многих тканях организма. Однако в мозге активна только копия, унаследованная от матери (материнская копия). Если материнская копия теряется из-за хромосомной перестройки или мутации гена, у человека не будет функционирующих копий гена UBE3A в мозге. В большинстве случаев (около 70%) у людей с синдромом Ангельмана наблюдается делеция материнской копии хромосомы 15. Эта хромосомная перестройка удаляет участок хромосомы 15, включающий ген UBE3A. Поскольку копия гена UBE3A, унаследованная от отца (отцовская копия), обычно неактивна в мозге, делеция в материнской хромосоме 15 приводит к отсутствию активных копий гена UBE3A в мозге. В 3–7% случаев синдром Ангельмана возникает, когда у человека есть две копии отцовской хромосомы 15 вместо одной копии от каждого родителя. Это явление называется отцовской унипарентальной дисомией (UPD). У людей с отцовской UPD по хромосоме 15 есть две копии гена UBE3A, но обе они унаследованы от отца и, следовательно, неактивны в мозге. Примерно в 10% случаев синдрома Ангельмана причиной является мутация в гене UBE3A, а еще в 3% – дефект в области ДНК, которая контролирует активацию гена UBE3A и других генов на материнской копии хромосомы 15. В небольшом проценте случаев синдром Ангельмана может быть вызван хромосомной перестройкой, называемой транслокацией, или мутацией в гене, отличном от UBE3A. Эти генетические изменения могут аномально инактивировать ген UBE3A. Синдром Ангельмана может быть наследственным, что подтверждается случаем, когда пациентка забеременела дочерью, у которой также было это заболевание.

Синдром Прадера-Вилли

Основными характеристиками этого состояния являются полифагия (чрезмерный, ненасытный аппетит), легкая или умеренная задержка развития, гипогонадизм, приводящий к задержке или отсутствию полового созревания, и гипотония. Синдром Прадера-Вилли вызван потерей активных генов в определенной части хромосомы 15, в области 15q11-q13. У людей обычно есть две копии этой хромосомы в каждой клетке, по одной копии от каждого родителя. Синдром Прадера-Вилли возникает, когда отцовская копия частично или полностью отсутствует. Примерно в 70% случаев синдром Прадера-Вилли возникает при делеции области 15q11-q13 отцовской хромосомы 15. Гены в этой области обычно активны на отцовской копии хромосомы и неактивны на материнской копии. Поэтому у человека с делецией в отцовской хромосоме 15 не будет активных генов в этой области. Примерно в 25% случаев у человека с синдромом Прадера-Вилли в каждой клетке имеются две материнские копии хромосомы 15 вместо одной копии от каждого родителя. Это явление называется материнской унипарентальной дисомией. Поскольку некоторые гены обычно активны только на отцовской копии этой хромосомы, у человека с двумя материнскими копиями хромосомы 15 не будет активных копий этих генов. В небольшом проценте случаев синдром Прадера-Вилли не вызван хромосомной перестройкой, называемой транслокацией. В редких случаях это состояние вызвано аномалией в области ДНК, которая контролирует активность генов на отцовской хромосоме 15. Поскольку пациенты почти всегда испытывают трудности с воспроизводством, синдром Прадера-Вилли, как правило, не является наследственным.

Изодицентрическая хромосома 15

Специфическое хромосомное изменение, называемое изодицентрической хромосомой 15 (IDIC15) (также известное под рядом других названий), может влиять на рост и развитие. У пациента присутствует "дополнительная" или "маркерная" хромосома. Эта небольшая дополнительная хромосома состоит из генетического материала хромосомы 15, который был аномально дублирован (скопирован) и присоединен конец к концу. В некоторых случаях дополнительная хромосома очень мала и не оказывает влияния на здоровье человека. Более крупная изодицентрическая хромосома 15 может приводить к слабому мышечному тонусу (гипотонии), интеллектуальной недостаточности, судорогам и поведенческим проблемам. Признаки и симптомы аутизма (расстройства развития, влияющего на общение и социальное взаимодействие) также ассоциируются с наличием изодицентрической хромосомы 15.

Цитогенетическая полоса

G-области хромосомы 15 человека с разрешением 850 бфн. Полоса ISCNstart ISCNstop Плотность 15 p 13 0 270 1 4200000 gvar 15 p 12 270 631 4200001 9700000 stalk 15 p 11.2 631 1142 9700001 17500000 gvar 15 p 11.1 1142 1382 17500001 19000000 acen 15 q 11.1 1382 1487 19000001 20500000 acen 15 q 11.2 1487 1773 20500001 25500000 gneg 15 q 12 1773 1968 25500001 27800000 gpos 50 15 q 13.1 1968 2164 27800001 30000000 gneg 15 q 13.2 2164 2284 30000001 30900000 gpos 50 15 q 13.3 2284 2524 30900001 33400000 gneg 15 q 14 2524 2765 33400001 39800000 gpos 75 15 q 15.1 2765 2975 39800001 42500000 gneg 15 q 15.2 2975 3065 42500001 43300000 gpos 25 15 q 15.3 3065 3245 43300001 44500000 gneg 15 q 21.1 3245 3471 44500001 49200000 gpos 75 15 q 21.2 3471 3621 49200001 52600000 gneg 15 q 21.3 3621 3846 52600001 58800000 gpos 75 15 q 22.1 3846 3982 58800001 59000000 gneg 15 q 22.2 3982 4087 59000001 63400000 gpos 25 15 q 22.31 4087 4252 63400001 66900000 gneg 15 q 22.32 4252 4357 66900001 67000000 gpos 25 15 q 22.33 4357 4507 67000001 67200000 gneg 15 q 23 4507 4613 67200001 72400000 gpos 25 15 q 24.1 4613 4748 72400001 74900000 gneg 15 q 24.2 4748 4808 74900001 76300000 gpos 25 15 q 24.3 4808 4928 76300001 78000000 gneg 15 q 25.1 4928 5048 78000001 81400000 gpos 50 15 q 25.2 5048 5169 81400001 84700000 gneg 15 q 25.3 5169 5379 84700001 88500000 gpos 50 15 q 26.1 5379 5649 88500001 93800000 gneg 15 q 26.2 5649 5860 93800001 98000000 gpos 50 15 q 26.3 5860 6070 98000001 101991189 gneg