Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Протоонкоген, производный от полиомавируса SV40.
Proto oncogene derived from polyomavirus SV40
Большой T-антиген SV40 (Simian Vacuolating Virus 40 TAg) – это гексамерный белок, являющийся доминантно действующим онкопротеином, производным от полиомавируса SV40. TAg способен индуцировать злокачественную трансформацию различных типов клеток. Трансформирующая активность TAg в значительной степени обусловлена нарушением им функции белков-супрессоров опухолей ретинобластомы (pRb) и p53. Кроме того, TAg связывается с несколькими другими клеточными факторами, включая транскрипционные коактиваторы p300 и CBP, что может способствовать его трансформационной функции. Аналогичные белки от родственных вирусов обычно известны как крупный T-антиген. TAg является продуктом раннего гена, транскрибируемого во время вирусной инфекции SV40, и участвует в репликации вирусного генома и регуляции клеточного цикла хозяина. SV40 – это вирус с двухцепочечной кольцевой ДНК, принадлежащий к семейству Polyomaviridae (ранее Papovavirus), роду Orthopolyomavirus. Полиомавирусы инфицируют широкий спектр позвоночных и вызывают солидные опухоли в различных локализациях. SV40 был выделен Свитом и Морисом Хиллеманом в 1960 году в первичных культурах клеток почки обезьяны, используемых для выращивания OPV Сабина.
SV40 large T antigen (Simian Vacuolating Virus 40 TAg) is a hexamer protein that is a dominant acting oncoprotein derived from the polyomavirus SV40. TAg is capable of inducing malignant transformation of a variety of cell types. The transforming activity of TAg is due in large part to its perturbation of the retinoblastoma (pRb) and p53 tumor suppressor proteins. In addition, TAg binds to several other cellular factors, including the transcriptional co activators p300 and CBP, which may contribute to its transformation function. Similar proteins from related viruses are known as large tumor antigen in general. TAg is a product of an early gene transcribed during viral infection by SV40, and is involved in viral genome replication and regulation of host cell cycle. SV40 is a double stranded, circular DNA virus belonging to the Polyomaviridae (earlier Papovavirus) family, Orthopolyomavirus genus. Polyomaviruses infect a wide variety of vertebrates and cause solid tumours at multiple sites. SV40 was isolated by Sweet and Maurice Hilleman in 1960 in primary monkey kidney cell cultures being used to grow Sabin OPV.
Домены
TAg содержит CUL7-связывающий домен, TP53-связывающий домен, цинковый палец и домен Superfamily 3 ATPase/Helicase. В его структуре присутствуют два мотива: один – сигнал для ядерной локализации, другой – мотив LXCXE.
The TAg has a CUL7 binding domain, a TP53 binding domain, a Zinc finger, and a Superfamily 3 ATPase/Helicase domain. It has two motifs, one for nuclear localization signal, the other being the LXCXE motif.
Механизм
После проникновения в клетку вирусные гены транскрибируются РНК-полимеразой II клетки-хозяина с образованием ранних мРНК. В связи с относительной простотой генома полиомавирусы в значительной степени зависят от клетки в отношении транскрипции и репликации генома. Цис-действующий регуляторный элемент, окружающий начало репликации, направляет транскрипцию, а Т-антиген направляет как транскрипцию, так и репликацию. Репликация ДНК SV40 инициируется связыванием большого Т-антигена с областью начала репликации генома. Функция Т-антигена регулируется фосфорилированием, которое ослабляет его связывание с началом репликации SV40. Белок-белковые взаимодействия между Т-антигеном и ДНК-полимеразой альфа непосредственно стимулируют репликацию вирусного генома. Т-антиген также связывается и инактивирует белки-супрессоры опухолей (p53, p105 Rb). Это приводит к выходу клеток из фазы G1 и переходу в фазу S, что способствует репликации ДНК. Геном SV40 очень мал и не кодирует всей информации, необходимой для репликации ДНК. Поэтому для клетки-хозяина необходимо войти в фазу S, когда клеточная ДНК и вирусный геном реплицируются одновременно. Таким образом, помимо усиления транскрипции, еще одна функция Т-антигена заключается в изменении клеточной среды для обеспечения репликации вирусного генома.
After entering the cell, the viral genes are transcribed by host cell RNA polymerase II to produce early mRNAs. Because of the relative simplicity of the genome, polyomaviruses are heavily dependent on the cell for transcription and genome replication. The cis acting regulatory element surrounding the origin of replication directs transcription, and T antigen directs transcription and replication. SV40 DNA replication is initiated by binding of large T antigen to the origin region of the genome. The function of T antigen is controlled by phosphorylation, which attenuates the binding to the SV40 origin. Protein protein interactions between T antigen and DNA polymerase alpha directly stimulate replication of the virus genome. T antigen also binds and inactivates tumor suppressor proteins (p53, p105 Rb). This causes the cells to leave G1 phase and enter into S phase, which promotes DNA replication. The SV40 genome is very small and does not encode all the information necessary for DNA replication. Therefore, it is essential for the host cell to enter S phase, when cell DNA and the viral genome are replicated together. Therefore, in addition to increasing transcription, another function of T antigen is to alter the cellular environment to permit virus genome replication.
Сигнал ядерной локализации
SV40 большой T-антиген использовался в качестве модельного белка для изучения ядерных локализационных сигналов (NLS). Он импортируется в ядро посредством взаимодействия с импортином α. Последовательность NLS – PKKKRKV. Диагностический шаблон для домена с высоким аффинитетом связывания с pRb был уточнен с использованием программы индукции шаблонов на основе искусственного интеллекта, работающей на массивно-параллельном суперкомпьютере (Connection Machine 2). Мотив характеризуется остатком Asp, Asn или Thr, за которым следуют три инвариантные аминокислоты, разделенные неконсервативными аминокислотами (обозначаемыми как x, где x не может быть остатком Lys или Arg). Например, мутация инвариантного Glu в позиции 107 в Lys 107 полностью подавляет трансформирующую активность. Была продемонстрирована биофизическая основа взаимодействия между этим участком T-антигена и pRb. Остатки T-антигена с 103 по 109 образуют протяженную петлевую структуру, которая плотно связывается в поверхностной борозде pRb. Вероятно, это связано с тем, что на поверхности связывания pRb имеется шесть лизиновых остатков, которые будут отталкивать положительно заряженные остатки внутри или по краям последовательности Leu – x – Cys – x – Glu.
The SV40 large T antigen has been used as a model protein to study nuclear localization signals (NLSs). It is imported into the nucleus by its interaction with importin α. The NLS sequence is PKKKRKV. A diagnostic pattern for a high affinity pRb binding domain was refined using an artificial intelligence pattern induction program running on a massively parallel supercomputer (Connection Machine 2). The motif is characterized by an Asp, Asn or Thr residue followed by three invariant amino acids, interspersed with non conserved amino acids (designated by x, where x cannot be a Lys or Arg residue). For example, mutation of the invariant Glu at position 107 to Lys 107 completely abolishes transforming activity. have demonstrated the biophysical basis for the interaction between this region of TAg and pRb. TAg residues 103 to 109 form an extended loop structure that binds tightly in a surface groove of pRb. This is likely due to the fact that the binding surface on pRb features six lysine residues, which will tend to repel positive residues within or flanking the Leu – x – Cys – x – Glu sequence.