Введение
Генетическое равновесие – это состояние аллеля или генотипа в генофонде (например, популяции), при котором частота не изменяется из поколения в поколение. Генетическое равновесие описывает теоретическое состояние, служащее основой для определения того, насколько и каким образом популяции могут отклоняться от него. Равновесие Харди — Вайнберга – одна из теоретических моделей для изучения генетического равновесия. Обычно оно изучается с использованием моделей, в основе которых лежат предположения Харди — Вайнберга, а именно:
Отсутствие мутаций генов в данном локусе или локусах, связанных с признаком.
Большая численность популяции.
Ограниченная или отсутствующая иммиграция, эмиграция или миграция (генный поток).
Отсутствие естественного отбора в данном локусе или по данному признаку.
Случайное скрещивание (панмиксия).
Оно может описывать и другие типы равновесия, особенно в контексте моделирования. В частности, многие модели используют вариацию принципа Харди — Вайнберга в качестве основы. Вместо соблюдения всех условий Харди — Вайнберга, в них предполагается баланс между разнообразием, создаваемым генетическим дрейфом, и гомогенизацией, вызванной миграцией между популяциями. Популяция, не находящаяся в равновесии, указывает на то, что одно из допущений рассматриваемой модели было нарушено.
No gene mutations occurring at that locus or the loci associated with the trait
A large population size
Limited to no immigration, emigration, or migration (genetic flow)
No natural selection on that locus or trait
Random mating (panmixis)
It can describe other types of equilibrium as well, especially in modeling contexts. In particular, many models use a variation of the Hardy–Weinberg principle as their basis. Instead of all of the Hardy–Weinberg characters being present, these instead assume a balance between the diversifying effects of genetic drift and the homogenizing effects of migration between populations. A population not at equilibrium suggests that one of the assumptions of the model in question has been violated.
Теоретические модели генетического равновесия
Принцип Харди-Вайнберга обеспечивает математическую основу для генетического равновесия. Само генетическое равновесие, будь то равновесие Харди-Вайнберга или иное, служит основой для ряда приложений, включая популяционную генетику, охрану природы и эволюционную биологию. С быстрым ростом числа доступных последовательностей геномов и распространением анонимных маркеров, модели стали использоваться для расширения первоначальной теории на различные биологические контексты. Используя данные генетических маркеров, таких как ISSR и RAPD, а также прогностический потенциал статистических методов, исследования разработали модели для выявления процессов, приведших к нарушению равновесия. К ним относятся локальная адаптация, сокращение и расширение ареала, а также отсутствие генного потока из-за географических или поведенческих барьеров, хотя моделирование равновесия применялось к широкому спектру тем и вопросов. Моделирование равновесия способствовало развитию в этой области. Поскольку аллельное доминирование может искажать прогнозы равновесия, некоторые модели отказались от использования генетического равновесия в качестве предположения, перейдя к использованию байесовских оценок вместо традиционной F-статистики. Холсингер и др. разработали аналог FST, названный тета. Исследования показали, что байесовские оценки лучше предсказывают наблюдаемые закономерности. Однако моделирование, основанное на генетическом равновесии, остается важным инструментом в популяционной генетике и охране природы, предоставляя ценную информацию о прошлых исторических процессах. Генетическое равновесие чаще встречается в крупных панмиктических популяциях, которые, по-видимому, не подвержены сильному влиянию географических барьеров. Тем не менее, некоторые исследования выявили значительную дифференциацию по всему ареалу видов. Вместо этого, при поиске генетического равновесия, исследования обнаружили крупные, широко распространенные виды-комплексы. Это указывает на то, что генетическое равновесие может быть редким или трудным для идентификации в природе из-за значительных локальных демографических изменений в короткие сроки. Фактически, хотя большой размер популяции является необходимым условием для генетического равновесия согласно Харди-Вайнбергу, некоторые утверждают, что большой размер популяции может фактически замедлить достижение генетического равновесия. Это может иметь последствия для охраны природы, где генетическое равновесие может служить индикатором здоровой и устойчивой популяции.