Введение
Вид вируса Φ6 (Phi 6) является наиболее изученным бактериофагом семейства Cystoviridae. Он инфицирует бактерии Pseudomonas (обычно растительнопатогенные P. syringae). Его геном состоит из трех сегментов двухцепочечной РНК общей длиной около 13,5 кб. Φ6 и его близкие родственники имеют липидную оболочку вокруг нуклеокапсида, что является редким свойством для бактериофагов. Это литический фаг, однако при определенных условиях наблюдается задержка лизиса, которую можно охарактеризовать как "состояние носительства".
Φ6 (Phi 6) is the best studied bacteriophage of the virus family Cystoviridae. It infects Pseudomonas bacteria (typically plant pathogenic P. syringae). It has a three part, segmented, double stranded RNA genome, totalling ~13.5 kb in length. Φ6 and its relatives have a lipid membrane around their nucleocapsid, a rare trait among bacteriophages. It is a lytic phage, though under certain circumstances has been observed to display a delay in lysis which may be described as a "carrier state".
Белки
Геном Φ6 кодирует 12 белков. P1 – основной капсидный белок, ответственный за формирование каркаса полимеразного комплекса. Внутри оболочки, образованной P1, находится вирусная репликаза и транскриптаза P2. Шипы, связывающиеся с рецепторами на вирионе Φ6, формируются белком P3. P4 – это нуклеозидтрифосфатаза, необходимая для упаковки генома и транскрипции. P5 – литический фермент. Спайк-белок P3 закреплен на фузогенном белке оболочки P6. P7 – дополнительный (минорный) капсидный белок, P8 отвечает за формирование поверхностной оболочки нуклеокапсида, а P9 – основной белок оболочки. P12 – неструктурный морфогенный белок, который, как было показано, участвует в сборке оболочки. P10 и P13 – белки, гены которых ассоциированы с вирусной оболочкой, а P14 – неструктурный белок.
Исследования
Φ6 изучался как модель для понимания того, как сегментированные РНК-вирусы упаковывают свои геномы, его структура исследовалась учеными, изучающими бактериофаги, содержащие липиды, и он использовался в качестве модельного организма для проверки эволюционных теорий, таких как храповый механизм Мюллера. Фаг Φ6 широко использовался в дополнительных экспериментальных исследованиях эволюции фагов.