Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Род бактерий Chlamydophila является спорным бактериальным родом, принадлежащим к семейству Chlamydiaceae.
Genus of bacteria
Chlamydophila is a controversial bacterial genus belonging to the family Chlamydiaceae.
Таксономия
Все Chlamydiota являются анаэробными бактериями с двуфазным жизненным циклом развития, который зависит от обязательного внутриклеточного роста в эукариотических клетках-хозяевах. Хламидофила была признана рядом ученых в 1999 году, с шестью видами в Хламидофиле и тремя в оригинальном роде Хламидия. Это сразу же было воспринято как спорный вопрос. В 2015 году вид Chlamydophila был переклассифицирован в Chlamydia. В зависимости от применимости и доступности также использовались окрашивание гликогена, ассоциация хозяина и морфология ЭМ. Сравнительный геномный анализ в 2006 году выявил ряд характерных белков, которые были уникально присутствуют у видов из родов Chlamydia и Chlamydophila, которые поддержали отличие Chlamydophila. Этот взгляд был оспорен три года спустя новыми методами анализа целого генома, что привело к предложению "объединить Chlamydiaceae в один род, Chlamydia". К 2010-м годам эта реклассификация "не была полностью принята или принята" среди микробиологов, что "привело к возврату к единственному оригинальному роду Chlamydia, который теперь включает все 9 видов, включая Chlamydia psittaci". Слияние рода Chlamydophila обратно в род Chlamydia теперь общепринято.
All Chlamydiota are anaerobic bacteria with a biphasic developmental lifecycle that depends on obligately intracellular growth in eukaryotic host cells. Chlamydophila was recognized by a number of scientists in 1999, with six species in Chlamydophila and three in the original genus, Chlamydia. This was immediately seen as controversial. In 2015 the Chlamydophila species were reclassified as Chlamydia. glycogen staining, host association, and EM morphology were also employed, depending on applicability and availability. Comparative genomic analyses in 2006 identified a number of signature proteins that were uniquely present in species from the genera Chlamydia and Chlamydophila, which supported the distinctness of Chlamydophila. This view was challenged three years later by newer whole genome analysis techniques leading to a proposal to "reunite the Chlamydiaceae into a single genus, Chlamydia". By the 2010s this reclassification "was not wholly accepted or adopted" among microbiologists, which "resulted in a reversion to the single, original genus Chlamydia, which now encompasses all 9 species including Chlamydia psittaci." The merger of the genus Chlamydophila back into the genus Chlamydia is now generally accepted.
Дифференциация Chlamydophila
По данным авторов исследования 1999 года, средняя разница в реассоциации ДНК ДНК, отличающая Chlamydophila от Chlamydia, составляет 10,1%, что является общепринятым значением для разделения рода. Хотя последовательности генов 16S рибосомальной РНК этих двух видов почти на 95% идентичны, в отличие от других ранее установленных родов, авторы считали, что сходство менее 95% является только руководящим принципом для установления новых родов в семействах хламидий. В исследовании авторы использовали сходство локаций кодирования белков и рибосомных генов РНК в геноме (группы генов), чтобы помочь отличить Chlamydophila от Chlamydia. Кроме того, полная длина 23S-рибосомальных генов РНК видов двух родов была менее чем на 95% идентична. + Некоторые молекулярные критерии, отличающие Chlamydiaceae GeneraGenusПриблизительный размер генома (миллион пар оснований ДНК)Определяемый гликогенЧисло рибосомных опероновChlamydophila1.2No1Chlamydia1.0Yes2
According to the authors of the 1999 study, the mean DNA DNA reassociation difference distinguishing Chlamydophila from Chlamydia is 10.1%, an accepted value for genus separation. Although the 16S ribosomal RNA gene sequences of the two are close to 95% identical, unlike the other previously established genera, the authors considered a less than 95% similarity only a guideline for establishing new genera in chlamydial families. In the study, the authors used the similarity of the locations of coding for protein and ribosomal RNA genes in the genome (gene clusters) to help distinguish Chlamydophila from Chlamydia. Also, the full length 23S ribosomal RNA genes of the species of the two genera were less than 95% identical. + Some Molecular Criteria Distinguishing Chlamydiaceae GeneraGenusApproximate Genome Size (million DNA base pairs)Detectable GlycogenNumber of Ribosomal OperonsChlamydophila1.2No1Chlamydia1.0Yes2