Введение
Эндопептидаза Clp (, эндопептидаза Ti, казеинолитическая протеаза, протеаза Ti, ATP- зависимая протеаза Clp, ClpP, протеаза Clp). Этот фермент каталитизирует следующую химическую реакцию Гидролиз белков в мелкие пептиды в присутствии АТФ и Mg2+. Этот бактериальный фермент содержит подединицы двух типов, ClpP, с активностью пептидазы, и белок ClpA, с активностью ААА+ АТФазы. ClpP и ClpA не связаны эволюционно. Полностью собранный комплекс протеазы Clp имеет структуру в виде бочки, в которой два сложенных гептамерических кольца протеолитических подединиц (ClpP или ClpQ) либо помещены между двумя кольцами, либо однослойны одним кольцом активных шаперонных подединиц гексамерической АТФазы (ClpA, ClpC, ClpE, ClpX, ClpY или другие). ClpXP присутствует почти у всех бактерий, в то время как ClpA обнаруживается у граммо- отрицательных бактерий, ClpC - у граммо- положительных бактерий и цианобактерий. ClpAP, ClpXP и ClpYQ сосуществуют в E. coli, в то время как только комплекс ClpXP присутствует у человека в виде митохондриальных ферментов.
Hydrolysis of proteins to small peptides in the presence of ATP and Mg2+. This bacterial enzyme contains subunits of two types, ClpP, with peptidase activity, and the protein ClpA, with AAA+ ATPase activity. ClpP and ClpA are not evolutionarily related. A fully assembled Clp protease complex has a barrel shaped structure in which two stacked heptameric ring of proteolytic subunits (ClpP or ClpQ) are either sandwiched between two rings or single caped by one ring of hexameric ATPase active chaperon subunits (ClpA, ClpC, ClpE, ClpX, ClpY, or others). ClpXP is presented in almost all bacteria while ClpA is found in the Gram negative bacteria, ClpC in Gram Positive bacteria and cyanobacteria. ClpAP, ClpXP and ClpYQ coexist in E. coli while only ClpXP complex in present in humans as mitochondrial enzymes.
АТФаза
Семейство Hsp100 эукариотических белков теплового шока является гомологичным активным шаперонным подединицам АТФазы, обнаруженным в комплексе Clp; как таковая, вся группа часто упоминается как семейство HSP100 / Clp. Семейство обычно делится на две части, одна из которых - ClpA/B с двумя доменами ATPазы, а другая - ClpX и друзья с только одним таким доменом. ClpA через E помещают в первую группу вместе с Hsp78/104, а ClpX и HSIU помещают во вторую группу. Член семейства ClpA/B, называемый ClpV, используется в бактериальной T6SS.