Америкалық вирусолог Пол Альквист және оның ғылыми еңбектері

Кіріспе

Американдық вирусолог Пол Ахлквист – Висконсин университетінің (Мэдисон) онкология, молекулалық вирусология және өсімдік патологиясы бойынша профессоры. Ол Висконсин университеті Карбон қатерлі ісік орталығының негізгі ғылымдар жөніндегі орынбасар директоры және Моргридж зерттеу институтының вирусология саласындағы Джон және Жанна Роу атындағы зерттеу орталығының директоры.

Білім

Ахквист физика бакалавры дәрежесін Иова мемлекеттік университетінен және биофизика ғылымдарының докторы дәрежесін Висконсин университетінен (Мэдисон) алды. Оның зерттеулері РНК вирустарының гендік экспрессиясына қадалаған. 1997 жылдан 2021 жылға дейін Говард Хьюз Медициналық Институтының (HHMI) ғалымы болды.

Зерттеу

Висконсин университеті мен Моргридж зерттеу институтындағы оның жұмысы вирустың көбеюінің молекулалық механизмдеріне, жаңашырмен (қонақшы) өзара әрекеттесуіне және қатерлі ісіктердің пайда болуына (онкогенез) қатысты.

Таңдалған басылымдар

Жан Х., Унчванивала Н., Реболедо Виверос А., Пеннингтон Дж., Хорсвилл М., Бродберри Р., Майерс Дж., Ден Бун Дж. А, Грант Т., Ахликвист П. Нодавирустың РНК репликациясы тәжінің архитектурасы прото-таждың прекурсоры мен вирустық А протеинінің конформациялық ауысуын көрсетеді. Proc Natl Acad Sci U S A. 2023 қаңтар 31;120(5):e2217412120. doi: 10.1073/pnas.2217412120. PMID 36693094; PMCID: PMC9945985. Ден Бун, Дж. А., Жан, Х., Унчванивала, Н., Хорсвилл, М., Славик, К., Пеннингтон, Дж., Навин, А., және Ахликвист, П. (2022). Көпфункционалды А ақуызы – нодавирустың РНК репликациясы үшін қажетті жалғыз вирустық ақуыз. Viruses, 14(12), 2711. https://doi.org/10.3390/v14122711. Эванс, Е. Л., 3-ші, Покок, Г. М., Эйнсдорф, Г., Бехренс, Р. Т., Добсон, Е. Т. А., Виденманн, М., Биркхольд, С., Ахликвист, П., Элисейри, К. В., және Шерер, Н. М. (2022). HIV RGB: KNIME-де бейне өңдеуді пайдалана отырып, ХИВ 1 Rev тәуелді РНК ядролық экспорты мен аудармасын автоматтандырылған бір жасушалық талдау. Viruses, 14(5), 903. https://doi.org/10.3390/v14050903. Олбрайт, Э. Р., Моррисон, К., Рангатан, П., Картер, Д. М., Нишикиори, М., Ли, Дж. Х., Слейтон, М. Д., Ахликвист, П., Терхуне, С. С., және Калежда, Р. Ф. (2022). Адам цитомегаловирусының литикалық инфекциясы репликацияға тәуелді гистон синтезін тежеп, сақина тәрізді байланысқан ақуыз функциясын қажет етеді. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 119(14), e2122174119. https://doi.org/10.1073/pnas.2122174119. Беннер, Б. Е., Брюс, Дж. В., Кентала, Дж. Р., Мюррей, М., Беккер, Дж. Т., Гарсия Миранда, П., Ахликвист, П., Бутчер, С. Е., және Шерер, Н. М. (2022). ВИЧ 1 рибосомалық кадрлардың ауысу жиілігін өзгерту ГАГ-полдың құрамына кіретін цис артықшылығын көрсетеді. Journal of virology, 96(1), e0134921. https://doi.org/10.1128/JVI.0134921. Унчванивала, Н., Жан, Х., Ден Бун, Дж. А., және Ахликвист, П. (2021). Нодавирустың РНК репликациялық органелдерінің криоэлектрондық микроскопиясы оң жіптік РНК вирусының геномдық репликациясын анықтайды. Current opinion in virology, 51, 74–79. https://doi.org/10.1016/j.coviro.2021.09.008. Унчванивала, Н., Жан, Х., Пеннингтон, Дж., Хорсвилл, М., Ден Бун, Дж. А., және Ахликвист, П. (2020). Нодавирустық репликация протеинінің субдоменді криоэлектрондық құрылымы А геномының репликациясының механизмі туралы түсініктер береді. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 117(31), 18680–18691. https://doi.org/10.1073/pnas.2006165117. Нишикиори, М., және Ахликвист, П. (2018). (+) жіптік РНК вирусының репликациясына органеллдің жарық тәуелділігі жасырын дәрілік нысананы ашады. Science advances, 4(1), eaap8258. https://doi.org/10.1126/sciadv.aap8258. Ден Бун, Дж. А., Пьон, Д., Ван, С. С., Хорсвилл, М., Шифман, М., Шерман, М., Зуна, Р. Е., Ван, З., Хьюитт, С. М., Пирсон, Р., Шотт, М., Чунг, Л., Ол, Q., Ламберт, П., Уокер, Дж., Ньютон, М. А., Венценсен, Н., және Ахликвист, П. (2015). Папилломавирустық инфекциядан жатыр мойнының преканцеріне және қатерлі ісігіне молекулалық ауысулар: стромальдық эстроген рецепторларының сигналдануының рөлі. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 112(25), E3255–E3264. https://doi.org/10.1073/pnas.1509322112. Хименес Барконс, М., Альвес Родригес, И., Юнгфлайш, Дж., Ван Винсберге, П. М., Ахликвист, П., және Диез, Дж. LSm1, Pat1 және Dhh1 жасушалық декаппинг активаторлары субгеномдық және геномдық үй вирусы РНК-ның арақатынасын бақылайды. J. Virol., 87(11): 6192–6200, 2013. Сейдель, С., Брюс, Дж., Лебланк, М., Ли, К. Ф., Фан, Х., Ахликвист, П., және Янг, Дж. A. T. ZASC1 нокаутты тышқандарда мысық лейкемия вирусының репликациясында сүйек миының ертедегі ерекше ақаулығы байқалады. Virol. J., 10(1): 130, 2013. Диаз, А., және Ахликвист, П. Оң жіптік РНК вирусының репликациясы үшін мембраналарды қайта реттеудегі хост ретикулон ақуыздарының рөлі. Curr. Opin. Microbiol., 15: 519–524, 2012. Диаз, А., Галлей, А., және Ахликвист, П. Бромвирустың РНК репликациясы бөлімшесінің қалыптасуы 1a-ның өзіне-өзі әрекеттесетін РНК капингтері мен геликазалық домендердің келісілген әрекетін қажет етеді. J. Virol., 86: 821–834, 2012. Хуан, Х. С., Пьон, Д., Пирс, С. М., Ланк, С. М., Гриффин, Л. М., Ахликвист, П., және Ламберт, П. Ф. Жаңа вирусқа қарсы препараттар ВПЧ инфекциясының алғашқы сатыларын тежейді. Antiviral Res., 93: 280–287, 2012. Вен, З., Пьон, Д., Ван, Ю., Ламберт, П., Сюй, В., және Ахликвист, П. Жетім ядролық рецептор PNR/NR2E3 p53 ацетилденуін күшейту арқылы p53 функцияларын ынталандырады. Mol. Cell. Biol., 32: 26–35, 2012. Чжан, Дж., Диаз, А., Мао, Л., Ахликвист, П., және Ван, Х. Хост ацил коферментінің А белдеуі оң жіптік РНК вирусының репликациялық кешенінің құрастырылуы мен белсенділігін реттейді. J. Virol., 86: 5110–5121, 2012. Ганкарц, Б. Л., Хао, Л., Хэ, К., Ньютон, М. А., және Ахликвист, П. Бромовирустың РНК репликациясын әсер ететін жаңа, қажетті хост гендерін жүйелі түрде анықтау. PLoS One, 6(8):e23988, 2011. Шолтхоф, К. Б. Г., Адкинс, С., Чзосник, Х., Палукайтис, П., Жакко, Е., Хон, Т., Хон, Б., Соундерс, К., Кандресс, Т., Ахликвист, П., Хеменуэй, С., және Фостер, Г. Д. Молекулалық өсімдік патологиясындағы 10 үздік өсімдік вирусы. Mol. Plant Pathol., 12: 938–954, 2011. Ван, Х., Диаз, А., Хао, Л., Ганкарц, Б., Ден Бун, Дж. А., және Ахликвист, П. Мультивзикулярлық дене жолы мен липидтік гомеостаздың оң жіптік РНК вирусының репликациясымен қиылысуы. J. Virol., 85: 5494–5503, 2011.

Zhan H., Unchwaniwala N., Rebolledo Viveros A., Pennington J., Horswill M., Broadberry R., Myers J., den Boon J. A , Grant T., Ahlquist P. Nodavirus RNA replication crown architecture reveals proto crown precursor and viral protein A conformational switching. Proc Natl Acad Sci U S A. 2023 Jan 31;120(5):e2217412120. doi: 10.1073/pnas.2217412120. PMID 36693094; PMCID: PMC9945985. den Boon, J. A., Zhan, H., Unchwaniwala, N., Horswill, M., Slavik, K., Pennington, J., Navine, A., & Ahlquist, P. (2022). Multifunctional Protein A Is the Only Viral Protein Required for Nodavirus RNA Replication Crown Formation. Viruses, 14(12), 2711. https://doi. org/10.3390/v14122711. Evans, E. L., 3rd, Pocock, G. M., Einsdorf, G., Behrens, R. T., Dobson, E. T. A., Wiedenmann, M., Birkhold, C., Ahlquist, P., Eliceiri, K. W., & Sherer, N. M. (2022). HIV RGB: Automated Single Cell Analysis of HIV 1 Rev Dependent RNA Nuclear Export and Translation Using Image Processing in KNIME. Viruses, 14(5), 903. https://doi. org/10.3390/v14050903. Albright, E. R., Morrison, K., Ranganathan, P., Carter, D. M., Nishikiori, M., Lee, J. H., Slayton, M. D., Ahlquist, P., Terhune, S. S., & Kalejta, R. F. (2022). Human cytomegalovirus lytic infection inhibits replication dependent histone synthesis and requires stem loop binding protein function. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 119(14), e2122174119. https://doi. org/10.1073/pnas.2122174119. Benner, B. E., Bruce, J. W., Kentala, J. R., Murray, M., Becker, J. T., Garcia Miranda, P., Ahlquist, P., Butcher, S. E., & Sherer, N. M. (2022). Perturbing HIV 1 Ribosomal Frameshifting Frequency Reveals a cis Preference for Gag Pol Incorporation into Assembling Virions. Journal of virology, 96(1), e0134921. https://doi. org/10.1128/JVI.01349 21. Unchwaniwala, N., Zhan, H., den Boon, J. A., & Ahlquist, P. (2021). Cryo electron microscopy of nodavirus RNA replication organelles illuminates positive strand RNA virus genome replication. Current opinion in virology, 51, 74–79. https://doi. org/10.1016/j. coviro.2021.09.008. Unchwaniwala, N., Zhan, H., Pennington, J., Horswill, M., den Boon, J. A., & Ahlquist, P. (2020). Subdomain cryo EM structure of nodaviral replication protein A crown complex provides mechanistic insights into RNA genome replication. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 117(31), 18680–18691. https://doi. org/10.1073/pnas.2006165117. Nishikiori, M., & Ahlquist, P. (2018). Organelle luminal dependence of (+)strand RNA virus replication reveals a hidden druggable target. Science advances, 4(1), eaap8258. https://doi. org/10.1126/sciadv. aap8258. den Boon, J. A., Pyeon, D., Wang, S. S., Horswill, M., Schiffman, M., Sherman, M., Zuna, R. E., Wang, Z., Hewitt, S. M., Pearson, R., Schott, M., Chung, L., He, Q., Lambert, P., Walker, J., Newton, M. A., Wentzensen, N., & Ahlquist, P. (2015). Molecular transitions from papillomavirus infection to cervical precancer and cancer: Role of stromal estrogen receptor signaling. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 112(25), E3255–E3264. https://doi. org/10.1073/pnas.1509322112. Giménez Barcons, M., Alves Rodrigues, I., Jungfleisch, J., Van Wynsberghe, P. M., Ahlquist, P., and Díez, J. The Cellular Decapping Activators LSm1, Pat1, and Dhh1 Control the Ratio of Subgenomic to Genomic Flock House Virus RNAs. J. Virol., 87(11): 6192 6200, 2013. Seidel, S., Bruce, J., Leblanc, M., Lee, K. F., Fan, H., Ahlquist, P., and Young, J. A. T. ZASC1 Knockout Mice Exhibit an Early Bone Marrow Specific Defect in Murine Leukemia Virus Replication. Virol. J., 10(1): 130, 2013. Diaz, A., and Ahlquist, P. Role of Host Reticulon Proteins in Rearranging Membranes for Positive Strand RNA Virus Replication. Curr. Opin. Microbiol., 15: 519 524, 2012. Diaz, A., Gallei, A., and Ahlquist, P. Bromovirus RNA Replication Compartment Formation Requires Concerted Action of 1a’s Self Interacting RNA Capping and Helicase Domains. J. Virol., 86: 821 834, 2012. Huang, H. S., Pyeon, D., Pearce, S. M., Lank, S. M., Griffin, L. M., Ahlquist, P., and Lambert, P. F. Novel Antivirals Inhibit Early Steps in HPV Infection. Antiviral Res., 93: 280 287, 2012. Wen, Z., Pyeon, D., Wang, Y., Lambert, P., Xu, W., and Ahlquist, P. Orphan Nuclear Receptor PNR/NR2E3 Stimulates p53 Functions by Enhancing p53 Acetylation. Mol. Cell. Biol., 32: 26 35, 2012. Zhang, J., Diaz, A., Mao, L., Ahlquist, P., and Wang, X. Host Acyl Coenzyme A Binding Protein Regulates Replication Complex Assembly and Activity of a Positive Strand RNA Virus. J. Virol., 86: 5110 5121, 2012. Gancarz, B. L., Hao, L., He, Q., Newton, M. A., and Ahlquist, P. Systematic Identification of Novel, Essential Host Genes Affecting Bromovirus RNA Replication. PLoS One, 6(8):e23988, 2011. Scholthof, K. B. G., Adkins, S., Czosnek, H., Palukaitis, P., Jacquot, E., Hohn, T., Hohn, B., Saunders, K., Candresse, T., Ahlquist, P., Hemenway, C., and Foster, G. D. Top 10 Plant Viruses in Molecular Plant Pathology. Mol. Plant Pathol., 12: 938 954, 2011. Wang, X., Diaz, A., Hao, L., Gancarz, B., den Boon, J. A., and Ahlquist, P. Intersection of the Multivesicular Body Pathway and Lipid Homeostasis in RNA Replication by a Positive Strand RNA Virus. J. Virol., 85: 5494 5503, 2011.