Геномная конвергенция в генетических исследованиях.
Genomic convergence
Геномная конвергенция: многофакторный подход в генетических исследованиях для выявления генов, связанных с Паркинсоном и другими сложными заболеваниями.
Сравнивайте с английским: нажмите на абзац — оригинал откроется в окне. Кнопка EN под абзацем показывает его прямо в тексте.
Содержание
Введение
Многофакторный подход, используемый в генетических исследованиях
Multifactor approach used in genetic research
Геномная конвергенция – это многофакторный подход, применяемый в генетических исследованиях, который объединяет различные виды анализа генетических данных для выявления и приоритизации генов восприимчивости к сложным заболеваниям.
Genomic convergence is a multifactor approach used in genetic research that combines different kinds of genetic data analysis to identify and prioritize susceptibility genes for a complex disease.
Ранние заявки
В январе 2003 года Майкл Хаузер вместе с коллегами-исследователями из Центра генетики человека Дьюка (CHG) ввел термин «геномная конвергенция» для описания их работы по выявлению генов, влияющих на проявление болезни Паркинсона (БП). Их работа успешно объединила серийный анализ экспрессии генов (SAGE) с анализом генетической связи. Авторы поясняют: «Хотя анализ генетической связи и анализ экспрессии сами по себе являются мощными инструментами, количество возможных генов, которые они предлагают в качестве кандидатов при болезни Паркинсона или любом другом сложном заболевании, остается чрезвычайно большим». Конвергенция этих двух методов позволила исследователям сократить число генов, потенциально связанных с болезнью Паркинсона, для дальнейшего изучения. Их успех стимулировал дальнейшее использование метода геномной конвергенции в CHG, и в июле 2003 года Yi Ju Li и др. опубликовали статью, показывающую, что глутатион S-трансфераза омега-1 (GSTO1) модифицирует возраст начала (AAO) болезни Альцгеймера (АД) и болезни Паркинсона. В мае 2004 года доктор Маргарет Перикак Вэнс, в настоящее время директор Института геномики человека имени Джона П. Хассмана при Медицинской школе Университета Майами Миллера, а в то время – директор CHG, подчеркнула ценность метода геномной конвергенции в своей ключевой речи под названием «Новые методы генетического исследования нейродегенеративных заболеваний» на конференции в Нью-Йоркской академии наук (NYAS). Она заявила: «Ни один метод сам по себе не приведет нас к желаемому результату в изучении этих сложных признаков. Для понимания этиологии этих заболеваний потребуется комбинация различных методов».
In January 2003, Michael Hauser along with fellow researchers at the Duke Center for Human Genetics (CHG) coined the term “genomic convergence” to describe their endeavor to identify genes affecting the expression of Parkinson disease (PD). Their work successfully combined serial analysis of gene expression (SAGE) with genetic linkage analysis. The authors explain, “While both linkage and expression analyses are powerful on their own, the number of possible genes they present as candidates for PD or any complex disorder remains extremely large”. The convergence of the two methods allowed researchers to decrease the number of possible PD genes to consider for further study. Their success prompted further use of the genomic convergence method at the CHG, and in July 2003 Yi Ju Li, et al. published a paper revealing that glutathione S transferase omega 1 (GSTO1) modifies the age at onset (AAO) of Alzheimer disease (AD) and PD. In May 2004, Dr. Margaret Pericak Vance, currently the director of the John P. Hussman Institute for Human Genomics at the University of Miami Miller School of Medicine and then the director of the CHG, articulated the value of the genomic convergence method at a New York Academy of Sciences (NYAS) keynote address entitled "Novel Methods in Genetic Exploration of Neurodegenerative Disease." She stated, "No single method is going to get us where we need to be with these complex traits. It is going to take a combination of methods to dissect the underlying etiology of these disorders".
Недавние и будущие применения
Геномная конвергенция имеет бесчисленное множество перспективных применений, объединяющих сильные стороны различных анализов и исследований. Maher Noureddine и др. отмечают в своей статье 2005 года: "Одной из растущих проблем в изучении сложных заболеваний является то, как приоритизировать исследования и осмыслить огромное количество данных, которые теперь легко доступны в несколько кликов мыши. Наиболее эффективным подходом может быть использование преимуществ как SAGE, так и микромассивов". Результаты комбинирования методов анализа продолжают быть обнадеживающими. Sofia Oliveira и др. (2005) объединили данные об экспрессии генов, данные о генетической связи и "итерационное картирование ассоциаций" для выявления нескольких генов, связанных с ранним началом болезни Паркинсона (PD AAO). В будущих исследованиях геномная конвергенция будет продолжать применяться для выяснения этиологии сложных заболеваний. Доктор Джефф Вэнс, директор Центра передовых исследований болезни Паркинсона им. Морриса К. Удалла, отмечает: "Геномная конвергенция по сути не отличается от математической конвергенции – чем больше подходов к проблеме, тем выше вероятность ее решения".
Genomic convergence has a countless number of creative applications that combine the strengths of different analyses and studies. Maher Noureddine et al., note in their 2005 paper, “One of the growing problems in the study of complex diseases is how to prioritize research and make sense of the immense amount of data now readily available at the click of a computer mouse The best approach may be to take advantage of the strengths of both SAGE and microarrays”. The results of combining methods of analysis have continued to be promising. Sofia Oliveira et al. (2005) combined gene expression, linkage data, and “iterative association mapping” to identify several genes associated with PD AAO. Future studies will continue to apply genomic convergence to elucidate the etiology of complex diseases. Dr. Jeff Vance, Director of the Morris K. Udall PD Research Center of Excellence, notes, “Genomic convergence is really no different from mathematical convergence – the more angles from which you can come at a problem, the better chance you have of solving it”.