Геномдық секвендирование
-
ДНК тізбектеу әдістері мен геномдық зерттеулер
Биохимия & генетикада: Биополимерлердің тізбектелуі – ДНК құрамын анықтау. Sanger әдісімен ДНК тізбегін зерттеу, молекула құрылымын түсінуге көмектеседі.
-
Кездейсоқ ДНК тізбектерін анықтау әдісі
Shotgun sequencing – ДНК тізбектерін анықтау әдісі. Ұзын ДНК-ны шағын фрагменттерге бөліп, тізбектеп, сосын біріктіру арқылы толық тізбек құрастырылады.
-
ДНҚ тізбектеуіш: ғылыми құрал және технологиялар эволюциясы
ДНҚ секвенаторы – ДНҚ тізбегін автоматты түрде анықтайтын ғылыми құрал. G, C, A, T базаларын санайды, генетикалық зерттеулерде маңызды.
-
Геномдық тізбектерді анықтау және зерттеу
Геномдық тізбектерді зерттеу, ДНК, РНҚ талдауы, биоинформатика, эволюция, құрылым. Биологиялық дерекқорларды іздеу және тізбектерді салыстыру әдістері.
-
ДНҚ тізбектерінің тұтас жиынтығы
ДНҚ тізбектемесінде контиг – ДНҚ-ның консенсус аймағын құрайтын үсті-үстіне жатқан сегменттер жиынтығы. Топтық және төменнен жоғары стратегияларда қолданылады.
-
Экспрессиялық тізбек белгілері: генетикалық зерттеулер мен қолданылуы
Женетикада EST – кДНК тізбегінің бөлігі. Гендерді анықтауға көмектеседі, бірақ геном және транскриптом секвендеумен ығыстырылды.
-
ДНК тізбегін құрастыру және биоақпараттық алгоритмдер
ДНҚ тізбегін құрастыру: геном фрагменттерін біріктіріп, толық тізбек құру. Биоинформатикадағы маңызды процесс, ДНҚ секвенциялауда қолданылады.
-
ДНҚ/РНҚ тізбектеуі: Наносаңылау технологиясы
Нанопорлы секвендеу: ДНҚ/РНҚ талдауы, жылдам нәтижелер, төмен құн. Вирустарды анықтау, геномдық зерттеулер, антибиотикке төзімділікті бақылау үшін қолданылады.
-
Жіктелген тізбектердің ең көп кездесетін нұсқасы
Консенсус тізбегі: ДНК, РНҚ және аминқышқылдарының ең көп кездесетін тізбегі. Молекулалық биологияда маңызды, ферменттер мен белок байланыс орындарына қатысты.
-
Көбейтілген ДНК/РНҚ фрагменті
Ампликон – ДНК/РНК фрагменті, ПТР (ПЦР) немесе гендік көбейту арқылы алынады. Зерттеу, сот-медицина, медицинада қолданылады. Гентипті анықтауға көмектеседі.
-
Жаралым жазалары: ДНК тізбектерін салыстыру әдісі
Жазылымдарды салыстырудағы Gap жазасы – тізбектерге енгізілген бос орындар үшін баллды төмендету. Дұрыс жазылым үшін бос орындарды азайту маңызды. 🧬📊
-
Хромосомалық секіру: Геномдық карта жасаудағы жаңа тәсіл
Хромосомалық секіру – геномдарды физикалық түрде іздеуге арналған молекулалық биология құралы. ДНҚ-ның қиын участақтарын тікелей зерттеуге көмектеседі.
-
ДНК тізбектеу әдісі: Пиросекуенциялау
ДНҚ тізбектеу әдісі – пиросекуенциялау. ДНҚ-ның нуклеотидтік құрамын анықтау, синтез арқылы, жарық көмегімен жүзеге асырылады. Биология, генетика.
-
Молекулалық биологияда РНК транскрипттерінің толық тізбегін алу әдісі
Жасушадағы РНҚ транскрипттерінің толық тізбегін алуға арналған RACE әдісі – молекулалық биологиядағы маңызды тәсіл. cDNA көшірмесін жасау, PCR және секвенделеу кіреді.
-
Қоршаған ортадағы гендерді зерттеу әдістері
Қоршаған ортадағы ДНК-ны зерттеу, метагеномика әдістері, ұзын оқу технологиялары (PacBio, Nanopore). Деректерді тазалау, еуропейлік ДНК-ны анықтау.
-
ДНК тізбегін анықтау әдістері: Праймерлік жүріс және хромосомалық жүріс
ДНК тізбектеу әдісі: Праймерлік жүріс – генді көшіру және тізбектеу үшін қолданылады. 1.3-7.0 кб дейінгі ДНК тізбегін анықтауға көмектеседі.
-
Циклдік зондтық технология: ДНК тізбектерін анықтау әдісі
Циклдық зондтау технологиясы (CPT) – ДНК тізбектерін анықтау әдісі. PCR-ға альтернатива, изотермиялық жағдайда жұмыс істейді, сигнал күшеюі сызықты.
-
1977 жылы жасалған ДНК тізбектеу әдісі
1977 ж. Ф. Сэнгер жасаған ДНК тізбектеу әдісі – электрофорезге негіделген, ДНК полимеразасы арқылы тізбек тоқтатушы дидезоксинуклеотидтерді қосу.
-
Женектік экспрессияны сандық талдау (SAGE) әдісі
Женектік экспрессияны саралау (SAGE) – молекулалық биологиядағы транскриптомдық әдіс. РНҚ популяциясын талдауға, гендерді анықтауға көмектеседі.
-
ДНҚ фрагментациясы: себептері, әдістері және маңызы
ДНҚ фрагментациясы – ДНҚ тізбегінің бөлінуі немесе үзілуі. Зертханалық, жасушалық және спонтанды түрде жүреді. ДФИ арқылы өлшенеді.
-
ДНК көбейту әдісі: Ішкі полимераза тізбектік реакциясы (nested PCR)
Ішек PCR: ДНК-ны күшейту әдісі, қате нәтижелерді азайтады. ДНК анализ, генетикалық зерттеулер, криминалистикада қолданылады. ДНК полимераза, праймерлер туралы ақпарат.
-
Молекулалық биологиядағы РНҚ байланыс орындарын анықтау әдісі
Қысқаша айтқанда, CLIP seq молекулалық биологияда РНҚ байланыс орындарын анықтауға көмектеседі. Иммунопреципитация және UV байланысы арқылы геномдық зерттеулер жүргізіледі.
-
РНК транскрипциясының басталу орнын анықтау әдісі
РНК праймерлік кеңейту әдісімен РНК транскрипциясының басталу орны анықталады. Радиоактивті праймер, обрат транскриптаза қолданылады. Молекулярлық биология.
-
Қабаттасу кеңейту полимераз тізбекті көбейту реакциясы (OE ПТР)
OE PCR: ДНК фрагменттерін біріктіру, мутация енгізу және тізбек құрастыруға арналған кең таралған молекулалық биологиялық әдіс. Жоғары дәлдік!
-
Жаңадан синтезделген РНК-ны анықтау: GRO-Seq әдісінің сипаттамасы
Ядролық жүгіру әдісімен гендердің транскрипциясын анықтау, mRNA тұрақсыздығын бағалау, S. cerevisiae-де TR есептеу. PolII RIP chip туралы да білесіз бе?