Темы

Геномное секвенирование

Genomic Sequencing · 25 статей

  1. Определение и методы секвенирования ДНК

    Определение секвенирования в генетике и биохимии: определение первичной структуры биополимеров, метод Сэнгера. Анализ последовательности ДНК.

    #6921 · 7 мин чтения

  2. Дробное секвенирование генома: методы и история

    Секвенирование генома: метод "дробовика" (shotgun sequencing) для анализа длинных ДНК. Разбиение на фрагменты, секвенирование и сборка последовательности.

    #6922 · 7 мин чтения

  3. ДНК-секвенаторы: принципы, поколения и применение.

    ДНК секвенатор: автоматический анализ последовательности ДНК (гуанин, цитозин, аденин, тимин). Определение порядка оснований для научных исследований.

    #38354 · 10 мин чтения

  4. Идентификация и анализ геномных последовательностей

    Анализ геномных последовательностей в биоинформатике: методы, функции, структура и эволюция ДНК, РНК и белков. Изучение геномов и баз данных.

    #64597 · 8 мин чтения

  5. Контиг: сборка перекрывающихся фрагментов ДНК

    Контиг в ДНК-секвенировании: наборы перекрывающихся фрагментов ДНК, формирующие консенсусную область. Объяснение понятия и применение в проектах секвенирования.

    #80481 · 4 мин чтения

  6. Экспрессированные последовательности тегов (EST): обзор и применение.

    Экспрессированные последовательности (EST) – короткие фрагменты cDNA, используемые для идентификации генов. Обнаружение генов и секвенирование.

    #105026 · 3 мин чтения

  7. Сборка геномных последовательностей: методы и проблемы

    Сборка генома: восстановление полной последовательности ДНК из фрагментов, полученных секвенированием. Решение сложных задач биоинформатики и анализа генов.

    #105106 · 4 мин чтения

  8. Нанопористое секвенирование ДНК/РНК: принципы и применение.

    Секвенирование нанопор: быстрое, мобильное и недорогое чтение ДНК/РНК без ПЦР. Применение: от диагностики вирусов до геномики и мониторинга устойчивости к антибиотикам.

    #139178 · 9 мин чтения

  9. Консенсусная последовательность в молекулярной биологии

    Консенсус-последовательность в биоинформатике: выявление наиболее часто встречающихся нуклеотидов/аминокислот при сравнении последовательностей ДНК и белков.

    #143527 · 1 мин чтения

  10. Ампликон: фрагмент ДНК или РНК, полученный с помощью амплификации.

    Ампликон: фрагмент ДНК/РНК, полученный методом ПЦР или ЛЦР. Используется в молекулярной биологии, генетике, криминалистике и медицине для анализа ДНК.

    #159120 · 3 мин чтения

  11. Штрафы за пробелы в выравнивании последовательностей: типы и применение.

    Штрафы за гэпы в выравнивании последовательностей: как они влияют на точность и информативность анализа ДНК, РНК и белков. Оптимизация выравнивания.

    #169877 · 4 мин чтения

  12. Прыжки по хромосомам: метод физического картирования геномов.

    Прыжки по хромосомам: метод молекулярной биологии для физического картирования геномов. Преодолевает сложные участки ДНК, ускоряет поиск генов.

    #184693 · 2 мин чтения

  13. Пиросеквенирование ДНК: принципы и методы

    Пиросеквенирование ДНК: метод секвенирования нового поколения, основанный на детекции света при синтезе ДНК. Принцип, применение и история разработки.

    #187618 · 3 мин чтения

  14. Быстрая амплификация концов кДНК (RACE) в молекулярной биологии

    RACE-ПЦР: быстрое клонирование и секвенирование РНК-транскриптов. Метод для получения полных последовательностей цДНК, включая NGS-секвенирование.

    #205910 · 3 мин чтения

  15. Изучение генов в окружающей среде: современные методы и анализ метагеномов

    Метагеномика: анализ ДНК из окружающей среды, новые технологии секвенирования (PacBio, Nanopore), фильтрация данных и удаление эукариотических загрязнений.

    #214234 · 6 мин чтения

  16. Метод секвенирования ДНК: Primer Walking и Chromosome Walking

    Секвенирование ДНК методом "primer walking": клонирование генов, подтверждение и открытие последовательностей до 7 кб. Sanger секвенирование, анализ плазмид и ПЦР.

    #222062 · 4 мин чтения

  17. Циклическая зондовая технология: принцип и применение в молекулярной биологии.

    Циклическое зондирование (CPT) – молекулярно-биологический метод для выявления ДНК. Альтернатива ПЦР, работает изотермически, использует химерные зонды и RNase H.

    #241741 · 2 мин чтения

  18. Метод Сэнгера: История и современное применение секвенирования ДНК.

    Секвенирование по Сэнгеру: метод анализа ДНК, разработанный в 1977 году. Электрофорез, дидезоксинуклеотиды, валидация данных. Применение в генетике.

    #244001 · 9 мин чтения

  19. Серийный анализ экспрессии генов (SAGE) и его модификации.

    SAGE: метод молекулярной биологии для анализа экспрессии генов. Создание "тегов" мРНК, идентификация генов и изучение транскриптома. LongSAGE, SuperSAGE.

    #247212 · 4 мин чтения

  20. Фрагментация ДНК: методы, причины и влияние на репродуктивные технологии.

    Фрагментация ДНК: разрыв цепей ДНК на части. Методы измерения (Comet-анализ, TUNEL-анализ) и индекс фрагментации (DFI). Причины и спонтанное накопление.

    #254924 · 2 мин чтения

  21. Вложенная ПЦР: метод снижения неспецифического амплифицирования ДНК

    Несколько ПЦР (nested PCR): усиление ДНК, снижение неспецифической амплификации, применение в генетике, секвенировании и ДНК-фингерпринтинге.

    #392641 · 2 мин чтения

  22. Метод CLIP и его варианты для идентификации сайтов связывания РНК-белков

    CLIP-seq: выявление сайтов связывания РНК с белками. Метод молекулярной биологии для изучения посттранскрипционной регуляции генов с помощью УФ-сшивания и иммунопреципитации.

    #392794 · 5 мин чтения

  23. Определение сайта начала транскрипции методом продления праймера.

    Праймер-экстензия: определение сайта начала транскрипции РНК с помощью радиоактивного праймера и обратной транскриптазы. Метод в молекулярной биологии.

    #404855 · 2 мин чтения

  24. Полимеразная цепная реакция с перекрывающимися расширениями (OE ПЦР) для сборки и мутагенеза ДНК

    ОЕ ПЦР: сборка ДНК-фрагментов. Мутации, создание кастомных последовательностей. Подробно о принципе и применении метода полимеразной цепной реакции.

    #441431 · 4 мин чтения

  25. Анализ транскрипции: методы Run-on и GRO-seq

    Анализ транскрипции генов: GRO, PolII RIP-chip. Методы оценки скорости транскрипции и стабильности мРНК у дрожжей S. cerevisiae. Исследования генома.

    #443274 · 2 мин чтения