Инженерия белков
-
Каталитические антитела: новые возможности в борьбе с ВИЧ и не только.
Каталитические антитела (абзимы): свойства, создание, роль в катализе и иммунной системе. Исследования механизмов реакций и аутоиммунных заболеваниях.
-
Пептидовые нуклеиновые кислоты: свойства и перспективы применения.
Пептидная нуклеиновая кислота (ПНК): синтетический аналог ДНК/РНК для молекулярной биологии, диагностики и терапии. Высокая специфичность и прочность связывания.
-
Молекулярные Ассемблеры: от Теории к Практике
Молекулярный ассемблер: теория, принципы работы и возможности создания нанотехнологического устройства для точного позиционирования молекул. Нанотехнологии.
-
Механосинтез: Перспективы и вызовы молекулярного производства
Механосинтез: гипотетический метод химического синтеза с использованием механических ограничений для точного направления молекул. Нанотехнологии будущего.
-
Полигистидиновый тег: метод молекулярной биологии для очистки белков.
His-тег в молекулярной биологии: структура, применение для очистки белков с помощью аффинной хроматографии. Коммерческие наборы от Roche и Qiagen.
-
Биосенсоры: принципы работы и применение.
Биосенсоры: определение, принцип работы и компоненты. Аналитические устройства для обнаружения химических веществ с использованием биологических элементов.
-
Специфичность взаимодействия биомолекул с лигандами
Специфичность биомолекул: как белки связывают лиганды. Описание химической специфичности, константы диссоциации и важности для ферментативной активности.
-
Нативная химическая лигация: синтез больших пептидов и белков.
Нативная химическая лигация (NCL): эффективный метод синтеза белков до 300 аминокислот. Химическая конденсация пептидов, образование нативного амидного соединения.
-
Биотинация: методы присоединения биотина к молекулам.
Биотинилирование: ковалентное присоединение биотина к молекулам (белкам, ДНК). Высокая аффинность к стрептавидину/авидину для биохимических исследований и анализа.
-
Метод Эдмана для секвенирования пептидов
Деградация Эдмана: метод секвенирования пептидов и определения аминокислотной последовательности. Описание процесса, ПТГ-производные, хроматография.
-
Пептоиды: синтез, структура и перспективы применения.
Пептоиды: биомиметики, имитирующие белки и пептиды. Отличаются структурой, устойчивы к протеазам, перспективны для разработки лекарств.
-
Молекулярное распознавание: типы и механизмы.
Молекулярное распознавание: нековалентные связи (водородные, Ван-дер-Ваальса, π-π). Роль растворителей, комплементарность молекул и селективность.
-
Синтез пептидов: методы и особенности
Синтез пептидов: производство соединений из аминокислот посредством пептидных связей. Химический синтез, стратегии защиты, C- и N-концы.
-
Синтез на твердой фазе: метод создания сложных молекул
Твердофазный синтез: эффективный метод создания сложных молекул (пептидов, ДНК, РНК) с высокой скоростью и выходом. Химия, реагенты, защита групп.
-
Фаговый дисплей: метод эволюции белков с использованием бактериофагов.
Фаговый дисплей: эволюция белков с помощью бактериофагов. Техника для изучения взаимодействия белков, пептидов и ДНК, скрининга библиотек белков.
-
Одноцепочечные фрагменты антител: структура, свойства и применение.
scFv фрагменты: структура, свойства и применение в биохимии. Синтетические белки, сохраняющие специфичность антител, но без Fc-фрагмента. Очистка протеином L.
-
Протеиновые микромассивы: принцип работы и применение.
Протеомные микрочипы: высокопроизводственный метод анализа белков, их взаимодействия и функций. Определение функций белков параллельно и быстро.
-
Стрептавидин из Streptomyces avidinii: структура и свойства связывания с биотином
Стрептавидин из Streptomyces avidinii: свойства, высокая аффинность к биотину (витамин B7). Применение в молекулярной биологии и бионанотехнологиях.
-
Молекулярные машины: от основ к применению
Молекулярные машины: искусственные и биологические устройства на молекулярном уровне. Принципы работы, примеры (кинезины, рибосомы) и история создания.
-
Иммунопреципитация и выделение белковых комплексов.
Иммунопреципитация (IP): выделение и очистка белков антителами в биохимии. Техника для изоляции конкретных белков из сложных смесей.
-
Клик-химия: точное соединение молекул для биологических исследований
Химия «клик»: быстрые и эффективные реакции для соединения молекул, особенно биомолекул. Применение в биохимии, медицине и материаловедении.
-
Молекулярное импринтирование: принципы и развитие техники
Молекулярный импринтинг: создание полимерных матриц с высокой селективностью и аффинностью к целевым молекулам. Принцип "ключ-замок" в химии полимеров.
-
Рибосомный дисплей: метод in vitro эволюции белков.
Рибосомный дисплей: эволюция белков in vitro для создания высокоаффинных лигандов. Техника для отбора и амплификации нужных последовательностей ДНК.
-
Аптамеры: искусственные молекулы для специфического связывания и применения в медицине и биологии.
Аптамеры: искусственные молекулы ДНК/РНК, связывающие специфические цели. Альтернатива антителам в исследованиях и медицине. Высокая аффинность и селективность.
-
Лиганды в биохимии: взаимодействие с биомолекулами.
Лиганды в биохимии: вещества, образующие комплексы с биомолекулами (белками, ДНК) для выполнения биологических функций. Связывание и сигналы.
-
Биакор: Технология поверхностного плазмонного резонанса для анализа биомолекулярных взаимодействий.
Biacore: технологии SPR для анализа биомолекулярных взаимодействий (белок-белок, фрагмент-белок). Теперь бренд Cytiva (GE Healthcare). Измерение сродства и кинетики.
-
Методы предсказания в молекулярном моделировании
Докинг в молекулярном моделировании: предсказание ориентации и силы связывания молекул (лигандов и мишеней). Важно для разработки лекарств и изучения сигнальных путей.
-
Методы анализа белков: от ДНК до количественного определения.
Методы изучения белков: экспериментальные (детектирование, очистка, структура) и вычислительные. Анализ данных, экспрессия и очистка белков.
-
Affinity label
-
Циклическая амплификация неправильно свернутых белков: диагностика и изучение прионных болезней.
PMCA: усиление мисфолдинговых прионов для диагностики болезней, таких как CWD и BSE. Ультразвуковая амплификация для быстрого выявления прионных инфекций.
-
Уравнение Скэтчарда: определение аффинности и числа связывающих центров.
Уравнение Скэтчарда: расчет аффинности и числа сайтов связывания лиганда с рецептором в молекулярной биологии. Определение Kd и параметров связывания.
-
Метод определения концентрации белка с использованием бицинхиноновой кислоты (BCA-анализ)
Определение концентрации белка методом БКА (BCA assay): принцип, реактивы, диапазон измерения (0.5 мкг/мл - 1.5 мг/мл). Колориметрический анализ.
-
Дисплей белков на дрожжах: метод протеинной инженерии.
Едродисплей – технология протеиновой инженерии для создания и отбора белков, антител. Отображение белков на поверхности дрожжей Aga2p.
-
Бактериальный дисплей: метод эволюции белков in vitro.
Бактериальный дисплей: технология эволюции белков in vitro. Создание библиотек полипептидов для скрининга и поиска белков с заданными свойствами. Применение в вакцинах и лигандах.
-
Белки, содержащие небелковые компоненты
Белки, содержащие небелковые компоненты: что такое конъюгированные белки, их структура и роль. Протетические группы, витамины и гидролиз белка.
-
Флаг-тег: применение и свойства в биохимии и молекулярной биологии.
FLAG-тег: описание, применение в биохимии и молекулярной биологии. Очистка белков, выделение комплексов, определение структуры рекомбинантных протеинов.
-
Направленная эволюция белков: метод и принципы.
Дирижируемая эволюция: метод протеинной инженерии для создания белков с заданными свойствами. Мутагенез, отбор, амплификация – ключ к эволюции in vitro и in vivo.
-
Far-western blot
-
Antibody microarray